| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1171846 | 298 (0.720) | 19 (0.050) | 10/96 | NT | 7.1% | coding (964/1200 nt) | lolC | lipoprotein‑releasing system transmembrane protein |
| ? | CP009273 | = 1171942 | 244 (0.690) | coding (1060/1200 nt) | lolC | lipoprotein‑releasing system transmembrane protein | |||||
Only 100 of 402 total aligned reads displayed.
CCTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCT > CP009273/1171779‑1171910 | cTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCgg < 1:20826595/68‑1 (MQ=255) cTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCgg < 1:31947474/68‑1 (MQ=255) cTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCgg < 1:3792379/68‑1 (MQ=255) cTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCgg < 1:1389542/68‑1 (MQ=255) aCGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTa > 1:18125593/1‑67 (MQ=255) aCGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTAt < 1:4783487/68‑1 (MQ=255) gCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCg > 1:1762991/1‑68 (MQ=255) aaGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCgg < 1:7401709/67‑1 (MQ=255) aaGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGt < 1:7656500/68‑1 (MQ=255) aaGGCTTAACTACGCGACAAAACATGACGGGCTTTATGGTGCACGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGt < 1:12422743/68‑1 (MQ=255) cTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGc < 1:33034062/66‑1 (MQ=255) ttAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGa < 1:9184115/67‑1 (MQ=255) ttAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGa < 1:14023872/67‑1 (MQ=255) ttAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGAt < 1:25022055/68‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc < 1:438816/68‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc < 1:3540455/68‑1 (MQ=255) aaCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc < 1:888398/68‑1 (MQ=255) aCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc > 1:11911137/1‑67 (MQ=255) aCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc > 1:20358348/1‑67 (MQ=255) aCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc > 1:28823913/1‑67 (MQ=255) aCTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATcc > 1:8751021/1‑67 (MQ=255) cTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTc > 1:29402897/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:22882548/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:11089003/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:27797700/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:20013826/1‑68 (MQ=255) tCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCg > 1:20983177/1‑68 (MQ=255) cgcgACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGa < 1:13419214/68‑1 (MQ=255) gACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAgcg > 1:5713211/1‑68 (MQ=255) aCAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAgcg > 1:20082573/1‑67 (MQ=255) aCAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAgcg > 1:25413532/1‑67 (MQ=255) aCAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAgcg > 1:33336337/1‑67 (MQ=255) aCAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAgcg > 1:18686473/1‑67 (MQ=255) cAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAgcggc < 1:30378021/68‑1 (MQ=255) cAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAgcggc < 1:23642103/68‑1 (MQ=255) cAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAgcggc < 1:31512147/68‑1 (MQ=255) aaaTCATGATGGTCTTTATTGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAgcggcg < 1:6677156/68‑1 (MQ=255) aaaTCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAgcggc > 1:25935311/1‑67 (MQ=255) tCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCtt < 1:10285748/68‑1 (MQ=255) tCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCtt < 1:10696425/68‑1 (MQ=255) tgatgGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGgc < 1:27873108/68‑1 (MQ=255) atgGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGcgcgatcaagcaggacgccgcttatcggcctcagatt > 1:6268246‑M1/1‑31 (MQ=255) atgGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGgcg > 1:7069917/1‑67 (MQ=255) tgGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGcgccaaaacgcaggaaggcgattatcggcatcagatta > 1:15757933‑M1/1‑30 (MQ=255) ggTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattat > 1:12745092‑M1/1‑29 (MQ=255) ggTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGgcgc > 1:7143684/1‑66 (MQ=255) tCTTTATGGTGCAAGGGTCCAGCGCCGTGATTATCGGTGCGATACTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCt < 1:28074141/67‑1 (MQ=255) tCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattattt > 1:13151392‑M1/1‑27 (MQ=255) tCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCt > 1:32544052/1‑67 (MQ=255) tCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCt < 1:24366423/67‑1 (MQ=255) tCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCt < 1:6566447/67‑1 (MQ=255) cTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGt < 1:22122664/37‑1 (MQ=255) cTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGc < 1:33561447/68‑1 (MQ=255) tttATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCt < 1:11221706/68‑1 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:2625523/1‑67 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:18910470/1‑67 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:409637/1‑67 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:30614404/1‑67 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:4583380/1‑67 (MQ=255) aTGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTg > 1:32326039/1‑67 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactg > 1:7484216‑M1/1‑21 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:22427381/1‑68 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:14427891/1‑68 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:9757946/1‑68 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:24250796/1‑68 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:5602492/1‑68 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:20206739/1‑68 (MQ=255) tGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcc > 1:28559986/1‑68 (MQ=255) ggggCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcca > 1:16247751/4‑68 (MQ=255) ggTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcca > 1:15301422/1‑68 (MQ=255) ggTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcca > 1:11497697/1‑68 (MQ=255) ggTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcca > 1:29941192/1‑68 (MQ=255) gTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcca > 1:30175709/1‑67 (MQ=255) gTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgcca > 1:30971000/1‑67 (MQ=255) gCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgccagcc > 1:29074166/1‑68 (MQ=255) aaGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgccagcca < 1:23854507/67‑1 (MQ=255) aaGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgccagcca < 1:19803789/67‑1 (MQ=255) aaGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTgccagcca < 1:33322691/67‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:33705113/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:857772/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:17314331/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:32912219/68‑1 (MQ=255) aGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGt < 1:3641388/68‑1 (MQ=255) gggCCAGCGCCGcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactggctggcaagc > 1:809327‑M1/1‑12 (MQ=255) gggCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTa > 1:11338187/1‑68 (MQ=255) gggCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTa > 1:33964637/1‑68 (MQ=255) ggCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTa < 1:19202729/67‑1 (MQ=255) ggCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTa < 1:21638509/67‑1 (MQ=255) ccAGCGCCGcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactggctggcaagcagg > 1:10951608‑M1/1‑9 (MQ=255) ccACCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTaaa < 1:14961175/67‑1 (MQ=255) agggccgcgccatcaagcaggacgccgattatgggcatcagattatttaactggctggcaagcaggg < 1:33442620‑M1/64‑61 (MQ=255) aGCGCCGcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactggctggcaagcaggg < 1:34215635‑M1/67‑61 (MQ=255) aGCGCCGcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactggctggcaagcaggg < 1:21885819‑M1/67‑61 (MQ=255) gcgccgcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactggctggccagcagggc > 1:26990429‑M1/1‑6 (MQ=255) cgccgcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactagctggcaagcagggcg > 1:16721854‑M1/1‑5 (MQ=255) gccgcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactggctggcaagcagggcgcc > 1:9475268‑M1/1‑4 (MQ=255) gccgcgccatcaagcaggacgccgattatcggcatcagattatttaactggctggcaagcagggcgc < 1:23340270‑M1/67‑64 (MQ=255) gcCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataat < 1:512474/66‑1 (MQ=255) gcCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataat < 1:12969014/66‑1 (MQ=255) gcCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAaataa > 1:10019326/1‑65 (MQ=255) | CCTGCAAACGCAAGGCTTAACTCCGCGACAAATCATGATGGTCTTTATGGTGCAAGGGGCCAGCGCCGGGATTATCGGTGCGATCCTCGGAGCGGCGCTTGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCT > CP009273/1171779‑1171910 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |