| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1171846 | 298 (0.720) | 19 (0.050) | 10/96 | NT | 7.1% | coding (964/1200 nt) | lolC | lipoprotein‑releasing system transmembrane protein |
| ? | CP009273 | = 1171942 | 244 (0.690) | coding (1060/1200 nt) | lolC | lipoprotein‑releasing system transmembrane protein | |||||
Only 100 of 323 total aligned reads displayed.
TGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGC > CP009273/1171878‑1172009 | ggCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggc > 1:15905032‑M2/1‑64 (MQ=255) ggCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggc > 1:7084835‑M2/1‑64 (MQ=255) gcgcCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggc < 1:23340270‑M2/67‑5 (MQ=255) gcCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggcgct > 1:29842679‑M2/1‑61 (MQ=255) gcCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggcgct > 1:32525395‑M2/1‑61 (MQ=255) cccTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCCATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggccct < 1:33442620‑M2/67‑8 (MQ=255) ccTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATTGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGc < 1:34046475/68‑1 (MQ=255) ccTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGc < 1:34233102/68‑1 (MQ=255) ccTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGc < 1:5357781/68‑1 (MQ=255) gCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggcgctggccc > 1:17884878‑M2/1‑56 (MQ=255) gCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCgg < 1:25962378/68‑1 (MQ=255) ttGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCgggg < 1:28914542/68‑3 (MQ=255) tGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTgg < 1:25615692/68‑1 (MQ=255) ccagccagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCt > 1:1423840/1‑68 (MQ=255) ccagccagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCt > 1:30264016/1‑68 (MQ=255) cagccagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTa < 1:13152974/68‑1 (MQ=255) cagccagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTa < 1:14437646/68‑1 (MQ=255) cagccagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTa < 1:23892537/68‑1 (MQ=255) agccagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTa > 1:4895713/1‑67 (MQ=255) ccagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCg > 1:33748763/1‑68 (MQ=255) cagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggcgctggccccttgcacc > 1:4032537‑M2/1‑46 (MQ=255) cagTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTAt < 1:1767449/65‑1 (MQ=255) cagTTAAATAATCTGAAGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGcggcgctggccccttgcacc > 1:12963777‑M2/1‑46 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:31840530/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:22972422/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:30109511/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:18516206/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:27517544/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:1012515/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:10770516/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:8617285/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGaa < 1:7252105/65‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAAcc < 1:33556205/67‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAAcc < 1:19842551/67‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAAcc < 1:24248103/67‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAAcc < 1:30937564/67‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:4650764/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:19942676/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:24434038/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:23525717/68‑1 (MQ=255) tAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCt < 1:12023867/68‑1 (MQ=255) aaaTAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCtt < 1:17172617/68‑1 (MQ=255) aaaTAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCtt < 1:18196400/68‑1 (MQ=255) aataatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCttt < 1:27326718/68‑1 (MQ=255) aataatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCttt < 1:24134936/68‑1 (MQ=255) aataatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCttt < 1:3316513/68‑1 (MQ=255) aataatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCttt < 1:26230276/68‑1 (MQ=255) ataatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCttt > 1:31345683/1‑67 (MQ=255) aatCTGATGCCGATCATCGGCGTCCTGCCTGATGGCGcggcgctggccccttgcaccataaagaccat > 1:32946040‑M2/1‑37 (MQ=255) aatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACa > 1:13892976/1‑68 (MQ=255) aatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACa > 1:11256652/1‑68 (MQ=255) aatCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACa > 1:8363544/1‑68 (MQ=255) aatCTGAGGCCGATAAGCGGCGTCCTGCTTGATCGCGcggcgctggccccttgcaccataaagaccat > 1:6268246‑M2/1‑37 (MQ=255) aacCTCATCCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGAGGGCGcggcgctggccccttgcaccataaagaccat > 1:4725075‑M2/1‑37 (MQ=255) atCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAg < 1:15397932/68‑1 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:7571338/68‑1 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:15664080/68‑1 (MQ=255) tCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg < 1:22006446/68‑1 (MQ=255) cTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg > 1:32199398/1‑67 (MQ=255) cTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAgg > 1:10277699/1‑67 (MQ=255) tGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTc < 1:29562725/68‑1 (MQ=255) tcccGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:15326353/66‑1 (MQ=255) tGCGGATAATCGGCGTCCTGCTTGTTGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:24798673/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:9265544/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:27057360/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:10929170/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:11435684/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:11759993/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:12290624/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:1836430/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:5703110/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:13598525/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:4119628/68‑1 (MQ=255) tGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCAtt < 1:20582171/68‑1 (MQ=255) gCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTg < 1:19311431/68‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGtt < 1:27753607/68‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGtt < 1:12529201/68‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGtt < 1:3605402/68‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGtt < 1:19472430/68‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGtt < 1:20804388/68‑1 (MQ=255) cGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGt < 1:23675841/67‑1 (MQ=255) gATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTa < 1:25050778/68‑1 (MQ=255) cGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTgcgc < 1:1677750/68‑1 (MQ=255) ggCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTgc > 1:16422419/1‑65 (MQ=255) ggCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCt < 1:11085085/68‑1 (MQ=255) ggccTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtgg < 1:20910513/65‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtgg < 1:21250148/67‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtgg < 1:21687365/67‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtgg < 1:29286548/67‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtgg < 1:7785529/67‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtgg < 1:26396927/67‑1 (MQ=255) gTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtgg < 1:7328577/67‑1 (MQ=255) ccTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCtggtg > 1:8645185/1‑67 (MQ=255) cTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGc < 1:6611034/68‑1 (MQ=255) tGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATgg < 1:28744612/68‑1 (MQ=255) tGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATg > 1:6853721/1‑67 (MQ=255) tGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCt < 1:18697761/67‑1 (MQ=255) tGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGGCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCt < 1:12754096/67‑1 (MQ=255) ggcgcggcgcTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTAt < 1:22550196/68‑1 (MQ=255) gcggcgcTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATcgc < 1:22256043/68‑1 (MQ=255) | TGGCGCCCTGCTTGCCAGCCAGTTAAATAATCTGATGCCGATAATCGGCGTCCTGCTTGATGGCGCGGCGCTGCCGGTGGCTATCGAACCTTTACAGGTCATTGTTATTGCGCTGGTGGCGATGGCTATCGC > CP009273/1171878‑1172009 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |