| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1314847 = | 188 (0.450) | 9 (0.030) | 8/96 | NT | 5.6% | coding (795/1596 nt) | trpD | fused glutamine amidotransferase (component II) of anthranilate synthase/anthranilate phosphoribosyl transferase |
| ? | CP009273 | 1314933 = | 140 (0.390) | coding (709/1596 nt) | trpD | fused glutamine amidotransferase (component II) of anthranilate synthase/anthranilate phosphoribosyl transferase | |||||
Only 100 of 207 total aligned reads displayed.
AGCGCGGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTT > CP009273/1314866‑1314998 | aGCGCGGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGcgccgc < 1:21104159/68‑1 (MQ=255)aGCGCGGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGcgccgc < 1:16989210/68‑1 (MQ=255)aGCGCGGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGcgccgc < 1:2928198/68‑1 (MQ=255)aGCGCGGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGcgccgc < 1:15729936/68‑1 (MQ=255) cgcgGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGGTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGcgccgccg > 1:22776305/1‑68 (MQ=255) gcgGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGcgccgccg < 1:31293679/67‑1 (MQ=255) gcgGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGcgccgccg < 1:3944837/67‑1 (MQ=255) gcgGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGcgccgccg < 1:24240408/67‑1 (MQ=255) gcgGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGcgccgccg < 1:25110711/67‑1 (MQ=255) ggTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCa < 1:27125937/68‑1 (MQ=255) ggTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCa < 1:17333190/68‑1 (MQ=255) ggTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCa > 1:30712179/1‑68 (MQ=255) ggTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCCCCa < 1:16146574/68‑1 (MQ=255) ggTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATCCTCACCAGCGCCGCCGCCa > 1:19777312/1‑68 (MQ=255) ggTTGCTGCCCCGGCGATCTCCTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCa < 1:14541214/68‑1 (MQ=255) gcggtgagcacccgaacgagatcgccggggcagcaaccgcgctactggaaaacgcagcgccgCCGCCa < 1:16974572‑M2/6‑1 (MQ=255) tgcCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGATTTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAgttgt > 1:24368117/1‑67 (MQ=255) ccccGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTcc > 1:7017900/1‑68 (MQ=255) ccccGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTcc > 1:20621185/1‑68 (MQ=255) ccccGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTcc > 1:16683061/1‑68 (MQ=255) ccccGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTcc > 1:14354954/1‑68 (MQ=255) ccccGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTcc > 1:26703466/1‑68 (MQ=255) ccccGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTcc > 1:11975588/1‑68 (MQ=255) ccGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCgg < 1:30270520/68‑1 (MQ=255) ggCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCt > 1:29842574/1‑68 (MQ=255) cGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTc > 1:16814776/1‑68 (MQ=255) cGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTc > 1:16503976/1‑68 (MQ=255) cGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTc > 1:13264626/1‑68 (MQ=255) cGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTc > 1:23607590/1‑68 (MQ=255) 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tcGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTc > 1:17449314/1‑68 (MQ=255) tcGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTc > 1:3918110/1‑68 (MQ=255) cGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCg < 1:12425690/68‑1 (MQ=255) ttCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGcc > 1:10275351/1‑68 (MQ=255) tCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGcc > 1:20724689/1‑67 (MQ=255) ccggggcagcaaccgcgctactggaaaacgcagcgccgCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCAc > 1:27904671‑M2/39‑68 (MQ=255) cGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCAc < 1:3327525/68‑1 (MQ=255) gggTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCAc > 1:30241577/1‑67 (MQ=255) gggTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGAAGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTAGCCACg > 1:409398/1‑68 (MQ=39) ggTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGc > 1:6280688/1‑68 (MQ=255) gTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGc > 1:34106921/1‑67 (MQ=255) gTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGc > 1:55931/1‑67 (MQ=255) gTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGc > 1:24950408/1‑67 (MQ=255) gcagcaaccgcgctactggaaaacgcagcgccgTCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGcacc > 1:2804176‑M2/34‑68 (MQ=255) gCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGcacc > 1:4941270/1‑68 (MQ=255) tCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGcaccac < 1:100070/68‑1 (MQ=255) tCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGcacca > 1:9467513/1‑67 (MQ=255) tCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGcacca > 1:668869/1‑67 (MQ=255) cACCGCGATTTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCGATTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCaccacc < 1:28459480/68‑1 (MQ=255) cACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCaccacc < 1:9357129/68‑1 (MQ=255) cACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCaccacc < 1:11732228/68‑1 (MQ=255) cACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCaccacc < 1:34355325/68‑1 (MQ=255) cACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCaccacc < 1:5076130/68‑1 (MQ=255) cACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCaccacc < 1:28169482/68‑1 (MQ=255) ccGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCTAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGc < 1:32316485/68‑1 (MQ=255) ccGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGc < 1:17768675/68‑1 (MQ=255) ccGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGc < 1:28509519/68‑1 (MQ=255) ccGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGc < 1:30762672/68‑1 (MQ=255) ccGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGc < 1:31752656/68‑1 (MQ=255) ccGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGc < 1:4449030/68‑1 (MQ=255) ccGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGc < 1:20991434/68‑1 (MQ=255) accgcgctactggaaaacgcagcgccgCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCaccacc > 1:13794927‑M2/28‑65 (MQ=255) gAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGa < 1:20180497/67‑1 (MQ=255) gAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGa < 1:9557601/67‑1 (MQ=255) aTTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGaaa < 1:13018389/67‑1 (MQ=255) tttCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACa < 1:26092641/68‑1 (MQ=255) tCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGc < 1:12709077/68‑1 (MQ=255) tCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGc < 1:31355715/68‑1 (MQ=255) gCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGCAAACAGCtggt > 1:12245722/1‑68 (MQ=255) gCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCtggt > 1:25568914/1‑68 (MQ=255) gCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCtggt < 1:1738806/68‑1 (MQ=255) gCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCtggt > 1:27662532/1‑68 (MQ=255) gCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCtggt > 1:24558049/1‑68 (MQ=255) tCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCtggtgg < 1:26978030/68‑1 (MQ=255) tCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCtggtg > 1:32997890/1‑67 (MQ=255) cACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGc < 1:18955285/68‑1 (MQ=255) cACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGc < 1:19184737/68‑1 (MQ=255) cACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGc < 1:31202857/68‑1 (MQ=255) cACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGc < 1:31727305/68‑1 (MQ=255) aCCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCTCCGCTGAAATCAGCTGGTGGCt < 1:2555177/68‑1 (MQ=255) ccAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCGTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCtt > 1:7841292/1‑68 (MQ=255) cagcgccgCCGCCAGTTGTGCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCttt < 1:21986737‑M2/60‑1 (MQ=255) gccgCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAATCAGCTGGTGGCTTTCttg > 1:8794515‑M2/5‑68 (MQ=255) gccgCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACCGCTGGTGGCTTTCttg > 1:11171665‑M2/5‑68 (MQ=255) gccgCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCttg > 1:6636846‑M2/5‑68 (MQ=255) gccgCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCttg > 1:16652479‑M2/5‑68 (MQ=255) gccgCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCttg > 1:8201747‑M2/5‑68 (MQ=255) gccgCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCttg < 1:10092696‑M2/64‑1 (MQ=255) gccgCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCt < 1:33741534‑M2/62‑1 (MQ=255) gccgCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCt < 1:15000652‑M2/62‑1 (MQ=255) cgCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCttgtt > 1:7413175‑M2/3‑68 (MQ=255) | AGCGCGGTTGCTGCCCCGGCGATCTCGTTCGGGTGCTCACCGCGAATTTTCATGCTCACCAGCGCCGCCGCCAGTTGTTCCGGCTTCAGCTCGCCACGCACCACCGCTGAAAACAGCTGGTGGCTTTCTTGTT > CP009273/1314866‑1314998 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |