| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1783272 | 269 (0.650) | 14 (0.040) | 5/98 | NT | 5.2% | coding (581/1047 nt) | aroH | 3‑deoxy‑D‑arabino‑heptulosonate‑7‑phosphate synthase, tryptophan repressible |
| ? | CP009273 | = 1783285 | 273 (0.750) | coding (594/1047 nt) | aroH | 3‑deoxy‑D‑arabino‑heptulosonate‑7‑phosphate synthase, tryptophan repressible | |||||
Only 100 of 423 total aligned reads displayed.
GGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATC > CP009273/1783219‑1783352 | cACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTat < 1:2686245‑M2/67‑3 (MQ=255) aCTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTatcc < 1:6683187‑M2/68‑5 (MQ=255) ctctCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTatccg > 1:15083949‑M2/1‑63 (MQ=255) ctcCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTatccgc < 1:25155908‑M2/67‑7 (MQ=255) ccTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCa > 1:33665686/1‑68 (MQ=255) ccTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCa > 1:17491083/1‑68 (MQ=255) ccTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCa > 1:16423155/1‑68 (MQ=255) ccTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCa > 1:15329078/1‑68 (MQ=255) ccTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCa > 1:14284344/1‑68 (MQ=255) ccTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCa > 1:24675764/1‑68 (MQ=255) ccTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCa < 1:10021994/68‑1 (MQ=255) tGTCCGGTAGGTTTTAAAAATTGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTTGATGCTATCCGCGCAGc < 1:32035916/68‑1 (MQ=255) tGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGc < 1:20557849/68‑1 (MQ=255) tGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGc < 1:15817409/68‑1 (MQ=255) tGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGc < 1:5369521/68‑1 (MQ=255) tGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGAATGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGc < 1:11841065/68‑1 (MQ=255) ccGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGTCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGccc > 1:370612/1‑67 (MQ=255) ccGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGccc > 1:6279565/1‑67 (MQ=255) ccGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGccc > 1:32315411/1‑67 (MQ=255) ccGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGccc > 1:17795937/1‑67 (MQ=255) ccGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGccc > 1:17649485/1‑67 (MQ=255) ccGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGccc > 1:26312692/1‑67 (MQ=255) ccGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGccc > 1:23052137/1‑67 (MQ=255) ccGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGccc > 1:33427602/1‑67 (MQ=255) ccGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGccc > 1:20009072/1‑67 (MQ=255) ccGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGccc > 1:12795995/1‑67 (MQ=255) ccGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGAATGCTATCCGCGCAGccc > 1:30753042/1‑67 (MQ=255) aGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCTCgcca > 1:24313080/1‑68 (MQ=255) aGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgcca > 1:22159807/1‑68 (MQ=255) aGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgcca > 1:9258457/1‑68 (MQ=255) aGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgcca < 1:19495687/68‑1 (MQ=255) aGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgcca > 1:19805405/1‑68 (MQ=255) aGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgcc < 1:8689586/67‑1 (MQ=255) gTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgccag > 1:15653472/1‑67 (MQ=255) ttttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgccagc < 1:10354688/67‑1 (MQ=255) ttttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgccagc < 1:19056615/67‑1 (MQ=255) ttttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgccagc < 1:6960042/67‑1 (MQ=255) ttttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgccagc < 1:17130157/67‑1 (MQ=255) ttttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgccag < 1:23640977/66‑1 (MQ=255) ttttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgccag < 1:26476608/66‑1 (MQ=255) ttttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgccag < 1:9457654/66‑1 (MQ=255) ttttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgccag < 1:8041671/66‑1 (MQ=255) ttttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgccag < 1:7656556/66‑1 (MQ=255) ttttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgccag < 1:33912017/66‑1 (MQ=255) ttttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgccag < 1:22563079/66‑1 (MQ=255) tttAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCgccagcc < 1:23891530/67‑1 (MQ=255) aaaaaTGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCatat < 1:21760740/68‑1 (MQ=255) aaaTGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGt > 1:22351808/1‑68 (MQ=255) aaaTGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGt > 1:2716660/1‑68 (MQ=255) aaaTGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGt > 1:1053057/1‑68 (MQ=255) aaaTGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGt > 1:33250568/1‑68 (MQ=255) tGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTcc < 1:18664206/68‑1 (MQ=255) tGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTatccgcgtattgccatcggtaccatttttaaaacctacc > 1:4842194‑M2/1‑28 (MQ=255) tGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTatccgcgtattgccatcggtaccatttttaaaacctacc > 1:1085141‑M2/1‑28 (MQ=255) tGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAg > 1:10947631/1‑68 (MQ=255) ggCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGa < 1:25278285/68‑1 (MQ=255) ggCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGa < 1:11218983/68‑1 (MQ=255) aaTACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACa < 1:4079032/67‑1 (MQ=255) aTACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACaaa < 1:8568715/68‑1 (MQ=255) ccgcggAACGCTGTGCATGCTatccgcgtattgccatcggtaccatttttaaaacctaccggacagga > 1:347894‑M2/2‑21 (MQ=255) aCGCGGATTGCTGTGGATGCTatccgcgtattgccatcggtaccatttttaaaacctaccggacagga > 1:30102247‑M2/1‑21 (MQ=255) aCGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACaaaga > 1:13641719/1‑66 (MQ=255) cgcgGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAAt < 1:16004536/68‑1 (MQ=255) gcgGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATg > 1:31796594/1‑68 (MQ=255) ggATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGt < 1:16340166/68‑1 (MQ=255) ttGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAg > 1:8215840/1‑68 (MQ=255) ttGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAg < 1:29696712/68‑1 (MQ=255) tGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGa < 1:13065866/68‑1 (MQ=255) tGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGa > 1:20128544/1‑68 (MQ=255) ggATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGAcc < 1:12389136/67‑1 (MQ=255) ggATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGAcc < 1:9202648/67‑1 (MQ=255) ggATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGAcc < 1:8355384/67‑1 (MQ=255) ggATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGAcc < 1:21484640/67‑1 (MQ=255) ggATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGAcc < 1:6465045/67‑1 (MQ=255) ggATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGAcc < 1:18463950/67‑1 (MQ=255) aTGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCa > 1:7807511/1‑66 (MQ=255) aTGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCa > 1:5908477/1‑66 (MQ=255) aTGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCa > 1:7162721/1‑66 (MQ=255) aTGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCAt < 1:21374872/67‑1 (MQ=255) aTGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCAt < 1:29018130/67‑1 (MQ=255) aTGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCAt < 1:11536332/67‑1 (MQ=255) aTGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCAt < 1:5668034/67‑1 (MQ=255) tGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCt < 1:9545295/68‑1 (MQ=255) tGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCt > 1:25684048/1‑68 (MQ=255) tGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCt < 1:4525891/68‑1 (MQ=255) tGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCt < 1:34271866/68‑1 (MQ=255) tGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCt < 1:1927623/68‑1 (MQ=255) tGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCt < 1:22741180/68‑1 (MQ=255) tGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCt < 1:23374739/68‑1 (MQ=255) tGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCt < 1:31326125/68‑1 (MQ=255) tGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCt < 1:25397418/68‑1 (MQ=255) tGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCt < 1:27448487/68‑1 (MQ=255) tGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATACCTCCCTCTCGCCAGACAAAAATCGTCAGATGACCATCt < 1:15011889/68‑1 (MQ=255) gCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTa < 1:16214862/68‑1 (MQ=255) gCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTa < 1:33047918/68‑1 (MQ=255) gCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTa < 1:32163758/68‑1 (MQ=255) gCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTa < 1:31058842/68‑1 (MQ=255) gCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTa < 1:28883719/68‑1 (MQ=255) gCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTa < 1:28018631/68‑1 (MQ=255) cTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTa > 1:18419462/1‑67 (MQ=255) | GGCACTCTCCTGTCCGGTAGGTTTTAAAAATGGTACCGATGGCAATACGCGGATTGCTGTGGATGCTATCCGCGCAGCCCGCGCCAGCCATATGTTCCTCTCGCCAGACAAAAATGGTCAGATGACCATCTATC > CP009273/1783219‑1783352 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |