| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3147712 | 307 (0.740) | 19 (0.050) | 9/94 | NT | 6.3% | coding (866/957 nt) | yqhC | transcriptional activator of yqhD |
| ? | CP009273 | = 3147725 | 307 (0.880) | coding (853/957 nt) | yqhC | transcriptional activator of yqhD | |||||
Only 100 of 537 total aligned reads displayed.
TCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACG > CP009273/3147658‑3147791 | ccccGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgc > 1:5366258‑M2/1‑66 (MQ=255) ccccGGCGTCACACCGAACTAACGTTTAAACTCCCGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgc > 1:14971456‑M2/1‑66 (MQ=255) ccGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgc < 1:16485356‑M2/68‑5 (MQ=255) ggatgatgatgatccatgacggcatgaaggccagcgcagcaGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCa > 1:20170440‑M1/42‑68 (MQ=255) cacaCCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAGATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgct < 1:33007536/67‑1 (MQ=255) cacaCCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcgca > 1:30823979‑M2/1‑57 (MQ=255) cacaCCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgct < 1:32066843/67‑1 (MQ=255) cacaCCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgct < 1:21880145/67‑1 (MQ=255) cacaCCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgct < 1:19941086/67‑1 (MQ=255) cacaCCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgct < 1:16683524/67‑1 (MQ=255) cacaCCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgct < 1:16299508/67‑1 (MQ=255) cacaCCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgct < 1:28486949/67‑1 (MQ=255) cacaCCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgct < 1:14311706/67‑1 (MQ=255) cacaCCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgct < 1:11240838/67‑1 (MQ=255) acacCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgctgc < 1:10639601/68‑1 (MQ=255) acCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgctgct > 1:24385970/1‑67 (MQ=255) acCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCgctgct > 1:24828357/1‑67 (MQ=255) ccGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCtgctgc < 1:25200101/68‑1 (MQ=255) cGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcgcaatttag > 1:23860209‑M2/1‑52 (MQ=255) gTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGAGCATCGCTGCTGCGCTg > 1:8125822/1‑67 (MQ=255) aaCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTgg > 1:5951311/1‑66 (MQ=255) aaCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTgg > 1:34130605/1‑66 (MQ=255) aaCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTgg < 1:11724780/66‑1 (MQ=255) aaCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGc < 1:7836980/67‑1 (MQ=255) aaCGTTTAAACTAACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTgg > 1:1219865/1‑66 (MQ=255) aCGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCt < 1:4371665/68‑1 (MQ=255) cGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcgcaatttagccgtgagt > 1:16931823‑M2/1‑44 (MQ=255) cGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACgcgcatcgcaatttagccgtgagt > 1:10856890‑M2/1‑44 (MQ=255) cGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCt > 1:15764749/1‑67 (MQ=255) gTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCTCTGGCCTTc > 1:12020220/1‑68 (MQ=255) gTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATCCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCAGCCCTGGCCTTc > 1:26799544/1‑68 (MQ=255) ttAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCAt < 1:23559366/68‑1 (MQ=255) aaCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGcc < 1:19043323/68‑1 (MQ=255) aCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCg > 1:22783828/1‑68 (MQ=255) aCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCg > 1:10338786/1‑68 (MQ=255) aCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCg > 1:7446276/1‑68 (MQ=255) aCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCg < 1:9115652/68‑1 (MQ=255) aCTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCg > 1:20371118/1‑68 (MQ=255) cTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGt < 1:21037444/68‑1 (MQ=255) cTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGt < 1:12646240/68‑1 (MQ=255) cTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGt < 1:31210161/68‑1 (MQ=255) cTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGt < 1:19623592/68‑1 (MQ=255) cTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGt < 1:22016758/68‑1 (MQ=255) cACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCa < 1:17386883/68‑1 (MQ=255) cACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCa < 1:34441638/68‑1 (MQ=255) ccagcgcagcaGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTGATGCCGTCAt < 1:1925285‑M1/57‑1 (MQ=255) aCGGCTAAATTGCGATGCTCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCCTCGCTGGCCTTCATGCCGTCAt < 1:14596543/68‑1 (MQ=255) cGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATg < 1:9370706/68‑1 (MQ=255) tAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGgat < 1:13440617/67‑1 (MQ=255) aaTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGgatgat < 1:33190425/68‑1 (MQ=255) aaTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGgatgat < 1:25031481/68‑1 (MQ=255) aaTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGgatgat < 1:4882304/68‑1 (MQ=255) aaTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGgatgat < 1:6389504/68‑1 (MQ=255) aaTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGgatgat < 1:29814400/68‑1 (MQ=255) aaTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGgatgat < 1:6903193/68‑1 (MQ=255) aaTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGgatgat < 1:33838746/68‑1 (MQ=255) aaTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGgatgat < 1:1588805/68‑1 (MQ=255) aTTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatc > 1:1862376/1‑68 (MQ=255) tGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatca > 1:13225721/1‑67 (MQ=255) tGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatca > 1:28047705/1‑67 (MQ=255) aGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatca < 1:28703835‑M1/66‑1 (MQ=255) aGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCAAGGAAGatcat < 1:8362486‑M1/67‑1 (MQ=255) GATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatcatcat > 1:26578535‑M1/1‑68 (MQ=255) GATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGatcatca < 1:3681825‑M1/67‑1 (MQ=255) TGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATcc < 1:13838668‑M1/68‑1 (MQ=255) TGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATcc < 1:15225167‑M1/68‑1 (MQ=255) GCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCcgc < 1:23333765‑M1/67‑1 (MQ=255) tttCATATCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCgcgc < 1:26367753/67‑1 (MQ=255) tttCATAGCCGACGGGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCgcgc < 1:15647783/67‑1 (MQ=255) tttCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCgcgc < 1:30309669/67‑1 (MQ=255) tttCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCgcgc < 1:22887056/67‑1 (MQ=255) tttCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGcc < 1:10018577/68‑1 (MQ=255) ttCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCt < 1:25864925/68‑1 (MQ=255) tCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCtt < 1:31713505/68‑1 (MQ=255) cATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCtga > 1:20725544/1‑66 (MQ=255) aTAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCGTTAt > 1:12399511/1‑68 (MQ=255) aTAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTAt < 1:3997883/68‑1 (MQ=255) aGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGc > 1:21275644/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCa > 1:15358206/1‑67 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCa > 1:27545607/1‑67 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:5240086/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:9585873/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:8614443/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:22277499/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:32333946/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:31438613/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:31012226/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:2951009/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:33482535/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:28996753/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:18341316/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:18175213/1‑68 (MQ=255) ccGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGAAGATCATCATCCGCGCCTTATGCAg > 1:7156678/1‑68 (MQ=255) cGACgcgcatcgcaatttagccgtgagtttaaacgttacttcggtgtgacgccgggggaagatgcggc > 1:32773578‑M2/1‑4 (MQ=255) cGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGCTCATCATCCGCGCCTTATGCAGa < 1:21567290/68‑1 (MQ=255) cGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGa < 1:1294321/68‑1 (MQ=255) cGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGa < 1:8791660/68‑1 (MQ=255) cGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGa < 1:25380324/68‑1 (MQ=255) cgcgCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACg < 1:17732556/67‑1 (MQ=255) cgcgCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACg < 1:33354740/67‑1 (MQ=255) | TCCCCCGGCGTCACACCGAAGTAACGTTTAAACTCACGGCTAAATTGCGATGCGCTTTCATAGCCGACGCGCATCGCTGCTGCGCTGGCCTTCATGCCGTCATGGATGATCATCATCCGCGCCTTATGCAGACG > CP009273/3147658‑3147791 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |