| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4306574 = | 158 (0.410) | 13 (0.040) | 10/98 | NT | 8.6% | coding (462/1137 nt) | phnM | ribophosphonate triphosphate hydrolase |
| ? | CP009273 | 4306632 = | 138 (0.410) | coding (404/1137 nt) | phnM | ribophosphonate triphosphate hydrolase | |||||
ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4306644‑4306574‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcagcgcAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT > CP009273/4306632‑4306696 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAG < 1:26089606/68‑1ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCA > 1:22163814/1‑67 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:7824071/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:24797859/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:25331164/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:5589006/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:13794733/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:17711467/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGC < 1:3582458/68‑1 CCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTG‑AAAACTGGTGCAGCG < 1:1187977/68‑1 CGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCG < 1:8610768/68‑1 GTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGC < 1:4426462/68‑1 CTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCA < 1:28965762/67‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:7042161/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:1185711/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:21413886/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:23510770/68‑1 TGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGA < 1:9092496/68‑1 TGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGA < 1:6745232/68‑1 TGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAG > 1:4407345/1‑67 GCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGG > 1:11587046/1‑68 GCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGG > 1:21374022/1‑68 GAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTC > 1:14902129/1‑68 GCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGC > 1:5646164/1‑68 ATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTG > 1:12010618/1‑68 ACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCC > 1:16430607/1‑68 ACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCG > 1:11757990/1‑68 GCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTT > 1:29729399/1‑68 GCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTT > 1:821771/1‑65 GCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTT > 1:2745444/1‑65 GCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTT > 1:27860709/1‑65 gatGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:5006833/4‑68 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA < 1:17629544/68‑1 GCAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATCGCGTTGA > 1:10521697/1‑68 CAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA > 1:21425805/1‑67 CAGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGA < 1:20990104/67‑1 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATC > 1:24460457/1‑68 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:27897735/67‑1 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:29576356/67‑1 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:28044856/67‑1 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:17011149/67‑1 AGCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAT < 1:1311698/67‑1 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:28207086/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:27883107/1‑68 GCGCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:30235622/1‑68 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT < 1:30480250/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:23009080/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:8899993/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:11748117/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:24536132/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:12268902/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:20123386/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:26981960/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:4218283/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCA > 1:29588868/1‑66 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGAGCAT < 1:26103054/67‑1 GCAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTGGATCA > 1:8311830/1‑66 ACCGTCTGCATCTGCGCTGCGAACTGCCGCATCACACCACGCTGCCGCTGTTTGAAAAACTGGTGCAGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4306644‑4306574‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcagcgcAGATGCAGACGGTGCTCGGCGCGGTTGACGCCGCGTTTCTGCGTCTCTTCGATGGCGTTGATCAT > CP009273/4306632‑4306696 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |