| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4501871 = | 270 (0.700) | 26 (0.080) | 9/92 | NT | 6.8% | coding (361/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit |
| ? | CP009273 | 4501966 = | 494 (1.560) | coding (266/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit | |||||
Only 100 of 113 total aligned reads displayed.
TCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4501946‑4501871‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC > CP009273/4501966‑4502031 TCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:20319761/1‑67TCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:30322989/1‑67TCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:26663560/1‑67TCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGG > 1:29831858/1‑67 CTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGC < 1:12353485/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:11859674/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:1779954/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:30115832/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:28859268/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:26004652/68‑1 TGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG < 1:8018461/68‑1 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 1:31288692/68‑1 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGG < 1:19608958/68‑1 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG > 1:26664054/1‑67 GTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCG > 1:16198219/1‑67 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCA > 1:6575691/1‑68 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCA > 1:13005116/1‑68 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCA > 1:28080567/1‑68 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:26274556/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:28719429/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:31597033/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:20451659/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:19319680/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:18429456/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:27311237/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:3468522/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:9182247/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:5269147/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:8994955/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:15437023/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:8289340/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGGCACTGCCCGTGCTGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:26842480/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGGCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:14951106/67‑1 GGGGGCTCTACTTCTTATGCCGGCACTGCCCGTGATGGTGCGGCCGCTGCGGGCCTTTGCGGGCGGC < 1:6590443/67‑1 GGGGGCTCTACTACTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTTGCCTTTGCGGGCGGC < 1:548175/67‑1 GGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:16408937/1‑68 GGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCAT < 1:24181044/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:6264421/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:12251334/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:26121140/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:25474619/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:14149836/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:3628527/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:3035707/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:2171658/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:21565554/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:31673161/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG < 1:3320499/67‑1 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:15644612/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:19320551/1‑67 GGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATG > 1:3779050/1‑67 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:6559441/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:22658662/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:6198388/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:8046914/67‑1 GCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATCGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG < 1:964814/67‑1 ACTTCTTCTGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACA < 1:15831961/68‑1 ACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACA < 1:14987395/68‑1 ACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACA < 1:26652068/68‑1 ACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACA < 1:7397109/68‑1 ACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTAATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACA < 1:24602129/68‑1 ACTTCTTAAGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACA < 1:32009674/68‑1 CTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGA < 1:10506626/68‑1 TTATGCCGGCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAG < 1:15936822/68‑1 ATGCCGTCACTGCCCGTGATGGGGCTGCCGCTGCGGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAA < 1:18344123/68‑1 TGCCGTCACTGCCCGTGAGGGTTCGGCCGCCGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAAT < 1:21291024/68‑1 TGCCGGCACTGCCCGTGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAAT < 1:31698736/68‑1 CACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGG < 1:4180869/68‑1 CACAGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGG < 1:13928741/68‑1 CTGCCCGTGATGGTCCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTG < 1:30854499/68‑1 CCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATG < 1:2537121/67‑1 CCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATG < 1:20582521/67‑1 CCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATG < 1:6105585/67‑1 CCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATG < 1:28281832/67‑1 CCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATG < 1:12005057/67‑1 CCGTGATGGTGCGGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATG < 1:23402656/67‑1 CCGTGATGGGGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATG < 1:2303380/67‑1 CCGGGATGGTGCGGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATG < 1:6103085/67‑1 CGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCC < 1:4835144/68‑1 CGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAC > 1:6600068/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:14703105/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:3031283/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:14531028/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG < 1:27807992/67‑1 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:31922129/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:20629574/1‑67 GGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACG > 1:13247375/1‑67 GCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGC > 1:1782847/1‑67 GCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGC > 1:3957296/1‑67 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGC < 1:15203291/68‑1 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGC < 1:15203317/68‑1 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGC < 1:20406526/68‑1 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGC < 1:22891548/68‑1 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCG > 1:3152749/1‑67 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCG > 1:13648283/1‑67 TGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCG > 1:13107885/1‑67 GGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC < 1:31918862/68‑1 GGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC > 1:28145265/1‑68 GGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC < 1:27146714/68‑1 GGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCATGTATCAGCACGCCCGCC > 1:13746085/1‑68 TCTGTGGGGGCTCTACTTCTTATGCCGTCACTGCCCGTGATGGTGCTGCCGCTGCTGGCCTTTGCGGGCGGCATGG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4501946‑4501871‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCC > CP009273/4501966‑4502031 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |