| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4501871 = | 270 (0.700) | 26 (0.080) | 9/92 | NT | 6.8% | coding (361/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit |
| ? | CP009273 | 4501966 = | 494 (1.560) | coding (266/957 nt) | fecD | iron‑dicitrate transporter subunit | |||||
Only 100 of 609 total aligned reads displayed.
CAGCACCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCAC > CP009273/4501899‑4502033 | aCCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAac < 1:12675938/68‑1 (MQ=255) ccATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCATTCTGGCGGCATGGTTAaca < 1:15867619/68‑1 (MQ=255) ccATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAaca < 1:30886166/68‑1 (MQ=255) acttcttatgccgtcactgcccgtgatggtgctgccgctgctggcctttgcgggcggcatggTTAaca < 1:14987395‑M2/6‑1 (MQ=255) tCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCg < 1:3685926/68‑1 (MQ=255) cACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGCGCCCCCACAGAGCCCAGGCAGGCGCCATGGTTAACACCga > 1:18231862/1‑68 (MQ=255) cACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCga > 1:10993432/1‑68 (MQ=255) gggCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa < 1:9333325/68‑1 (MQ=255) gggCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa < 1:23623003/68‑1 (MQ=255) gggCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa > 1:24666857/1‑68 (MQ=255) gggCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGaa < 1:29426358/68‑1 (MQ=255) tgccggcactgcccgtgatggggctgccgctgctggcctttgcgggcggcatggTTAACACCGAGAat < 1:31698736‑M2/14‑1 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata > 1:22155791/1‑68 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata > 1:21064525/1‑68 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata > 1:4730865/1‑68 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata > 1:27800392/1‑68 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata > 1:15619204/1‑68 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata > 1:8879145/1‑68 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAata > 1:7962954/1‑68 (MQ=255) gCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAat < 1:11895827/67‑1 (MQ=255) cAGTGACGTTATAAGAAGTAGATCCCCCCCAGAGCCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACAGAGActa < 1:27983809/67‑1 (MQ=255) gACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCgg < 1:20305057/68‑1 (MQ=255) cacagcccgtgatggtgctgccgctgctggcctttgcgggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCgg < 1:13928741‑M2/20‑1 (MQ=255) aCGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGt > 1:28968286/1‑68 (MQ=255) aCGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGt > 1:3428306/1‑68 (MQ=255) aCGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGt > 1:26785152/1‑68 (MQ=255) ggCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGa > 1:17806064/1‑68 (MQ=255) cATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGAt > 1:6631049/1‑67 (MQ=255) cATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGAt > 1:13762578/1‑67 (MQ=255) cATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGAt > 1:8615965/1‑67 (MQ=255) cATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGAt < 1:23355522/67‑1 (MQ=255) ccgtgatggtgctgccgctgctggcctttgcgggcggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATg < 1:2537121‑M2/25‑1 (MQ=255) aTAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATg < 1:21377186/67‑1 (MQ=255) tAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGcc < 1:19331066/68‑1 (MQ=255) tAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGcc > 1:5408675/1‑68 (MQ=255) tAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGcc < 1:25132164/68‑1 (MQ=255) tAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGcc < 1:21912857/68‑1 (MQ=255) tAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGcc < 1:22942717/68‑1 (MQ=255) agaagTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCag > 1:744723/1‑68 (MQ=255) acaagTAGAGCCCCCACAGAGGACAGGCTGGAGGCATGGATAACACCGAGAATATCCGCTGATGCCag > 1:26575872/3‑68 (MQ=255) agTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAgg < 1:14492643/68‑1 (MQ=255) gTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAggg > 1:12042206/1‑68 (MQ=255) tAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATGCGGTGATGCCAGAGGGt > 1:23170347/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:10051671/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:10519794/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:13498637/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:20123359/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:1967645/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:4940459/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGtt > 1:16464792/1‑68 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:27051884/67‑1 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:8322950/67‑1 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:7111336/67‑1 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:6346580/67‑1 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:24909268/67‑1 (MQ=255) agagCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:31447068/67‑1 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:26276774/1‑68 (MQ=255) agCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:18441852/1‑68 (MQ=255) gCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgc > 1:30740332/1‑67 (MQ=255) cccccACACAGGCCAGGCTGGCGTCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgcgc < 1:11516813/68‑1 (MQ=255) ccccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgcgc > 1:2839669/1‑67 (MQ=255) ccccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTgcgc > 1:13249750/1‑67 (MQ=255) ccACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGcaca < 1:16761377/68‑1 (MQ=255) cacaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACaa > 1:17320638/1‑68 (MQ=255) acaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACaa > 1:4462238/1‑67 (MQ=255) acaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACaa > 1:28563504/1‑67 (MQ=255) acaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt < 1:27551856/68‑1 (MQ=255) acaGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt < 1:5860173/68‑1 (MQ=255) caGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAAt > 1:29185165/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:32071154/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:7602545/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:2550769/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:14309994/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:27203030/1‑67 (MQ=255) agagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATc > 1:23834257/1‑67 (MQ=255) gagGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:12825654/68‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:11232027/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATccc < 1:2614844/66‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:9115010/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:16233015/1‑65 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:6802726/65‑1 (MQ=255) ggCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc < 1:5650280/65‑1 (MQ=255) gCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:12255942/1‑64 (MQ=255) gCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATcc > 1:658539/1‑64 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGTTGATGCCAGATGGTTGCGCACAATCCCCTGTa < 1:6084810/68‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:13084762/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:3127851/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGt < 1:30045376/67‑1 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATc < 1:25758725/66‑1 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:22629184/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:17105/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:24361844/1‑67 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa < 1:4164628/67‑1 (MQ=255) cTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCa > 1:30419917/1‑67 (MQ=255) ggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcg > 1:20629574‑M2/8‑67 (MQ=255) ggcatggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcg > 1:14703105‑M2/8‑67 (MQ=255) tggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcgcccgc < 1:15203317‑M2/65‑1 (MQ=255) ggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcgcccgcc > 1:28145265‑M2/3‑68 (MQ=255) ggTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCAcgcccgcc < 1:31918862‑M2/66‑1 (MQ=255) gTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGt < 1:9650898‑M2/34‑1 (MQ=255) | CAGCACCATCACGGGCAGTGACGGCATAAGAAGTAGAGCCCCCACAGAGGCCAGGCTGGCGGCATGGTTAACACCGAGAATATCCGGTGATGCCAGAGGGTTGCGCACAATCCCCTGTATCAGCACGCCCGCCAC > CP009273/4501899‑4502033 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |