| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 4586926 = | NA (NA) | 3 (0.010) | 3/88 | NT | NA | noncoding (13/39 nt) | REP350 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences | REP350 (repetitive extragenic palindromic) element; contains 1 REP sequences |
| ? | CP009273 | 4586955 = | NA (NA) | intergenic (+126/+12) | yjjN/opgB | L‑galactonate oxidoreductase/phosphoglycerol transferases I and II | |||||
Only 100 of 213 total aligned reads displayed.
GCATGGTGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCTACAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4587004‑4586926‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgcgacctacacATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGC > CP009273/4586955‑4587021 GCATGGTGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGT > 1:30885932/1‑68 CATGGTGGAAATTAACGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGT < 1:28937194/67‑1 CATGGTGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGT < 1:30725938/67‑1 CATGGTGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGT > 1:20200227/1‑67 CATGGTGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGT > 1:17752646/1‑67 CATGGTGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGT > 1:27089020/1‑67 ATGGTGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGC > 1:13510927/1‑68 GGTGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGA < 1:17253608/68‑1 GGTGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGA < 1:15519151/68‑1 GGTGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGA < 1:7904624/68‑1 GGTGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGA < 1:27251084/68‑1 TGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGAC < 1:24911157/67‑1 TGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGAC < 1:26775436/67‑1 TGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGAC < 1:12054888/67‑1 TGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGAC < 1:16009057/67‑1 TGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGAC < 1:6015759/67‑1 TGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGAC < 1:3053324/67‑1 TGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATACGGTGCGAC < 1:7096709/67‑1 TGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGAAGGTCGCATAGGGTGCGAC < 1:31531489/67‑1 gtAAATTCACGGGGTCGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTCATGTGTAGGTCGCATAGGGGGCGACCT < 1:24236969/66‑1 GGAAATTAACGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGGCGCATAGGGTGCGACCT < 1:18601800/68‑1 GGAAATTAACGTGGTAGAACGGGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCT < 1:28689710/68‑1 GGAAATTAAAGTGGTAGAACGTTAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCT < 1:28166605/68‑1 GGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTGATTCCTGACTGAAGTGTAGGTCGGATAGGGTGCGACCT > 1:23245395/1‑68 GGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCT < 1:23650227/68‑1 GGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCT < 1:29461987/68‑1 GGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCT > 1:9381407/1‑68 GGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCT < 1:24652216/68‑1 GGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCT < 1:21542747/68‑1 GGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCT < 1:20869279/68‑1 GGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCT < 1:10829360/68‑1 GGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCT < 1:14541018/68‑1 GGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCT < 1:6779853/68‑1 GGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCT < 1:18069715/68‑1 GGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCT > 1:18237911/1‑68 GGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCT < 1:8907356/68‑1 GAAATTAAAGTGGTCGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCT < 1:13300681/67‑1 AATTACAGTGGGAGACCGTGAAGGGGAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCTAC < 1:23786257/67‑1 AATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCTACA < 1:27308625/68‑1 AATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCTAC < 1:4288701/67‑1 AATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCTAC > 1:20100064/1‑67 TTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCTACAC > 1:25165268/1‑67 TTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTACGTCGCATAGGGTGCGACCTACAC > 1:17562099/1‑67 AGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCTACACATCAG < 1:29220793/68‑1 AGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCTACACATCAG < 1:1035006/68‑1 AGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGAC > 1:28841718/1‑57 AGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGGCGCATAGGGTGCGACCTACACATCAG < 1:17708539/68‑1 GGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCTACACATCAGT < 1:21905900/66‑1 TGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATC > 1:29811525/1‑67 TGCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATC > 1:17017424/1‑67 GCGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCC > 1:4079883/1‑68 CGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCCCCATGCCGATCCCG > 1:32090939/1‑68 CGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCG > 1:17107378/1‑68 CGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCG > 1:201620/1‑68 CGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCG > 1:12780956/1‑68 CGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCG > 1:19887390/1‑68 CGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCG > 1:31288026/1‑68 CGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCG > 1:19147109/1‑68 CGACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCC > 1:4728312/1‑67 ACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGCTCCCGA > 1:2046711/1‑67 ACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGA > 1:8740223/1‑67 ACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGA > 1:8874186/1‑67 ACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGA > 1:28500874/1‑67 ACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGA > 1:24467480/1‑67 ACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGA > 1:27394389/1‑67 ACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGA > 1:25962815/1‑67 ACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGA > 1:2308980/1‑67 ACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGA > 1:14242265/1‑67 ACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATG < 1:5050437/57‑1 ACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCAATTTAATTTCCACCAAGCCGATCCCGA > 1:1833740/1‑67 ACCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTAACACTTTAATTTCAACCATGCCGATCCCGA > 1:30366528/1‑67 CCTACCCATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCCCCATGCCGATCCCGAGC > 1:5563388/1‑68 CCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAG < 1:19737116/67‑1 CCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAG < 1:6289348/67‑1 CCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAG < 1:5903577/67‑1 CCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAG < 1:3569649/67‑1 CCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAG < 1:8483168/67‑1 CCTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAG < 1:22566943/67‑1 CTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCATGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCT > 1:1506094/1‑68 CTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGCTCCCGAGat > 1:18819510/1‑66 CTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCT > 1:15316367/1‑68 CTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCT > 1:27965700/1‑68 CTACACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCT > 1:26263172/1‑68 CACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTAC < 1:21803523/68‑1 ACATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACG < 1:6335376/68‑1 CATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCGCGAGCTTGCGC > 1:24087546/1‑68 CATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTCCGC > 1:16281278/1‑68 CATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGC > 1:10596339/1‑68 CATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGC > 1:8355284/1‑68 CATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGC > 1:12284960/1‑68 CATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGC > 1:11405587/1‑68 CATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGC > 1:16916134/1‑68 CATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGC > 1:17082747/1‑68 CATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGC > 1:18737560/1‑68 CATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGC > 1:1948904/1‑68 CATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGC > 1:22790510/1‑68 CATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGC > 1:3024406/1‑68 CATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGC > 1:29633015/1‑68 CATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGC > 1:25413650/1‑68 CATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCA > 1:3826204/1‑45 GCATGGTGGAAATTAAAGTGGTAGAACGTGAAGGGTAATTCCTGACTGATGTGTAGGTCGCATAGGGTGCGACCTACAC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/4587004‑4586926‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑tgcgacctacacATCAGTCAGGAATTACCCTTCACGTTCTACCACTTTAATTTCCACCATGCCGATCCCGAGCTTACGC > CP009273/4586955‑4587021 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |