| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 108768 = | 280 (0.730) | 22 (0.060) | 7/100 | NT | 8.4% | coding (319/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
| ? | CP009273 | 108799 = | 228 (0.660) | coding (288/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer | |||||
GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/108840‑108768‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > CP009273/108799‑108864 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:9751107/1‑68GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:5840240/1‑68GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:21353530/1‑68GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:7572517/1‑68GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGAGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:3263865/1‑68 GGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGC < 1:1623000/68‑1 GGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGC < 1:2358526/68‑1 GACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCATATTAATTTCCGCGC < 1:15384492/67‑1 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:348047/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:22094849/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:25667322/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC < 1:25201240/67‑1 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:14750713/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATAAATTTCCGCGCC > 1:17577245/1‑67 ACCACAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTCCCGCGCC < 1:21968711/67‑1 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:507783/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:3814323/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:29296157/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC < 1:30838582/68‑1 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:31304780/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC < 1:20658184/68‑1 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC < 1:5900540/68‑1 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:29778227/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC < 1:1553726/68‑1 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:12461478/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:9638031/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:14485617/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCG < 1:9274438/67‑1 CCAGAGCCGAATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGa > 1:10928717/1‑67 GTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACT < 1:16292822/68‑1 ATTGAAGCATTAATTCCGCAGTTAAACGCGGCGGGGAGCGTATTAATATCCGCGCCGCTTTTAACTGC < 1:24084329/68‑1 ATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAACGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGC < 1:4335353/68‑1 AGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAA < 1:4609626/67‑1 ATTCCGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:6214540/68‑1 ATTCAGCAGTTACCAGCGGCGGGGCGCGTACTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:27639567/68‑1 ATTCAGCAGTTAAACGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:24575243/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:3358858/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:14494823/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:24862201/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:10860310/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:19489321/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:7551133/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:16113443/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:21040504/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:17391083/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:18616779/68‑1 ATTCAGCAGTAAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:2395667/68‑1 CAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCA < 1:6664592/68‑1 AGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAAT < 1:7779050/66‑1 TAAACGCGGCGGGGAGCGTATTAATATCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGC < 1:6440372/68‑1 TAAAAGGGGCGGGGAGCGTATTAATTCCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGC < 1:28430823/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:7270899/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:5101963/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:7234843/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:10566370/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:20393940/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:10450273/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:14778417/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:15704605/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:15916289/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:20000185/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:20357282/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:3107110/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:20685018/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:23833010/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:30371551/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:29216583/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:29204328/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:25975519/68‑1 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGT < 1:23459946/68‑1 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:3903534/1‑67 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:4267720/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:13245114/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:12748758/1‑66 CGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCT < 1:1709945/68‑1 CGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCT < 1:3387051/68‑1 CGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTC < 1:17203402/67‑1 GCTTTTTACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:5922572/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:20670230/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG < 1:13303893/68‑1 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:24295824/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/108840‑108768‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > CP009273/108799‑108864 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |