New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 108768 = | 280 (0.730) | 22 (0.060) | 7/100 | NT | 8.4% | coding (319/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
? | CP009273 | 108799 = | 228 (0.660) | coding (288/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
Only 100 of 397 total aligned reads displayed.
CTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGG > CP009273/108702‑108835 | cagacctggattggcgtgcctggcgtggaccagagccgtattgaagcattaattcagcagttaaaagc > 1:24295824‑M1/67‑68 (MQ=255) cagacctggattggcgtgcctggcgtggaccagagccgtattgaagcattaattcagcagtaaaaagc > 1:5922572‑M1/67‑68 (MQ=255) cTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATAcgc > 1:29120213/1‑68 (MQ=255) agacctggattggcgtgcctggcgtggaccagagccgtattgaagcattaattcagcagttaaaagcg < 1:3387051‑M1/3‑1 (MQ=255) gggATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATAcgcg > 1:19548123/1‑67 (MQ=255) gATGCTCAGGCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATAcgcggc < 1:21382394/67‑1 (MQ=255) cctggattggcgtgcctggcgtggaccagagccgtattgaagcattaattcagcagttaaaagcggcg < 1:15916289‑M1/6‑1 (MQ=255) cctggattggcgtgcctggcgtggaccagagccgtattgaagcattaattcagcagttaaaagcggcg < 1:5101963‑M1/6‑1 (MQ=255) cctggattggcgtgcctggcgtggaccagagccgtattgaagcattaattcagcagttaaaagcggcg < 1:20393940‑M1/6‑1 (MQ=255) cctggattggcgtgcctggcgtggaccagagccgtattgaagcattaattcagcagttaaaagcggc > 1:3903534‑M1/63‑67 (MQ=255) aTGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATAcgcggcgc > 1:24438972/1‑68 (MQ=255) aTGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATAcgcggcgc > 1:15210698/1‑68 (MQ=255) tCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGaa > 1:27390775/1‑68 (MQ=255) tCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGaa > 1:18166581/1‑68 (MQ=255) tCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGaa > 1:30965730/1‑68 (MQ=255) tCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGaa > 1:20044905/1‑68 (MQ=255) tCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGaa < 1:23909050/68‑1 (MQ=255) tCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGa < 1:12748259/67‑1 (MQ=255) tCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGa < 1:21756468/67‑1 (MQ=255) tCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGa < 1:29949368/67‑1 (MQ=255) cAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGaaa < 1:11292808/68‑1 (MQ=255) cAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGaaa < 1:22558004/68‑1 (MQ=255) cAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGaaa < 1:30804496/68‑1 (MQ=255) cAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGaaa < 1:10517932/68‑1 (MQ=255) cAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGaaa < 1:10324954/68‑1 (MQ=255) gTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAAtt > 1:26777703/1‑68 (MQ=255) gTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAAtt > 1:29262956/1‑68 (MQ=255) cGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAAtt < 1:2068069/66‑1 (MQ=255) cGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTaa > 1:28675621/1‑68 (MQ=255) cGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTaa < 1:12469990/68‑1 (MQ=255) gCTGACGCCCCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAAt > 1:6042103/1‑68 (MQ=255) aCGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATAc > 1:14296481/1‑66 (MQ=255) aCCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTcc > 1:18650118/1‑67 (MQ=255) aCCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTcc < 1:19287060/67‑1 (MQ=255) agagCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCccg > 1:5285489/1‑67 (MQ=255) gCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCccgccga > 1:15401980/1‑67 (MQ=255) gCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCccgcc > 1:31206660/1‑66 (MQ=255) gCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCccgcc > 1:22223843/1‑66 (MQ=255) gCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCccgcc > 1:6825417/1‑66 (MQ=255) gCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCccgcc > 1:28065877/1‑66 (MQ=255) gCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCccgcc > 1:2589093/1‑66 (MQ=255) aaTCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCcgccgc < 1:1604042/66‑1 (MQ=255) aaTCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCtt > 1:108044/1‑68 (MQ=255) aaTCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCtt > 1:23564337/1‑68 (MQ=255) aaTCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCt < 1:19779452/67‑1 (MQ=255) aaTCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCt < 1:18464284/67‑1 (MQ=255) tCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCtttt > 1:967173/1‑68 (MQ=255) gccgtattgaagcattaattcagcagttaaaaGCGGCGCGGGAATTAATACGCTCCCCGCCCCTTTTa < 1:28430823‑M1/36‑1 (MQ=255) cAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTa > 1:11152347/1‑68 (MQ=255) cAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTACACGCCGCTTTTa > 1:4155499/1‑68 (MQ=255) cAAAAGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGCAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTa > 1:29590581/1‑68 (MQ=255) aCGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAAct < 1:12196825/68‑1 (MQ=255) aCGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAAct < 1:3725069/68‑1 (MQ=255) aCGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAAct < 1:21901217/68‑1 (MQ=255) aCGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAAct < 1:7958796/68‑1 (MQ=255) gATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAActgc > 1:27079039/1‑68 (MQ=255) gATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAAct > 1:25218741/1‑66 (MQ=255) gATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAAct > 1:25607332/1‑66 (MQ=255) gATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAAct > 1:23367948/1‑66 (MQ=255) cTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGa < 1:30539032/68‑1 (MQ=255) cTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGa < 1:18751477/68‑1 (MQ=255) cTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGa < 1:28851614/68‑1 (MQ=255) ttCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGaa < 1:6425605/68‑1 (MQ=255) ttCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGaa > 1:24887516/1‑68 (MQ=255) tCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAAt < 1:26615575/68‑1 (MQ=255) agcattaattcagcagttaaaaGCGGCGCGGAAATTAGTACGCGCCCCGCCGCTGGTAACTGCTGAAt < 1:27639567‑M1/46‑1 (MQ=255) agcattaattcagcagttaaaaGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCGGAAt < 1:6214540‑M1/46‑1 (MQ=255) cGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTaa > 1:7141903/1‑68 (MQ=255) cGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTaa > 1:23145346/1‑68 (MQ=255) cGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTaa > 1:5449006/1‑68 (MQ=255) gCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAAt > 1:8901524/1‑68 (MQ=255) ttcagcagttaaaaGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:4609626‑M1/53‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:17054711/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:9330075/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:13188587/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:13598369/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:8161561/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:7733364/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:14718482/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:17163213/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:16732567/66‑1 (MQ=255) gcagttaaaaGCGGCGCGGATATTAATACGCTCCCCGCCGCGTTTAACTGCGGAATTAATGCTTCAAt < 1:24084329‑M1/58‑1 (MQ=255) gcagttaaaaGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCGTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAAt < 1:4335353‑M1/58‑1 (MQ=255) cccGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATAc > 1:17805378/1‑68 (MQ=255) cccGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATAc > 1:26291045/1‑68 (MQ=255) cccGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATAc > 1:18894217/1‑68 (MQ=255) agttaaaaGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATAc < 1:16292822‑M1/60‑1 (MQ=255) gATACGCTGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:1575483/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:11454063/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:11687882/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:31966102/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:7510363/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:17656285/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:19156262/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:20726869/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:9572306/68‑1 (MQ=255) tACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGct < 1:10132905/67‑1 (MQ=255) cgcggcgcggAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTACCTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTg > 1:17374742/1‑68 (MQ=255) GCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTgg > 1:14485617‑M1/1‑68 (MQ=255) GCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTgg > 1:31304780‑M1/1‑68 (MQ=255) | CTGGGATGCTCAGTCGCTGACGCACCAGAGCAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGG > CP009273/108702‑108835 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |