| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 596500 | 172 (0.450) | 9 (0.030) | 5/94 | NT | 6.1% | coding (2331/3144 nt) | cusA | copper/silver efflux system, membrane component |
| ? | CP009273 | = 596517 | 135 (0.420) | coding (2348/3144 nt) | cusA | copper/silver efflux system, membrane component | |||||
GGGGCGATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/596426‑596500‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agctggcgcAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCCCT < CP009273/596517‑596452 GGGGCGATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAA < 1:22859405/67‑1GGGGCGATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAA < 1:21181743/67‑1 GGGCGATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAA > 1:26060690/1‑66 GGCGATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGC < 1:16313416/67‑1 GCGATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTG > 1:10452411/1‑68 GCGATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTG > 1:24847837/1‑68 GCGATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTG > 1:24406150/1‑68 GCGATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTG > 1:5795007/1‑68 gtTGGTTGGCGAAACGGTGGATGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGC < 1:25948222/66‑1 GATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGC < 1:5199957/68‑1 GATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGC < 1:24482951/68‑1 GATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGC < 1:23571895/68‑1 GATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGC < 1:472752/68‑1 GATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGC < 1:17607/68‑1 GATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGC < 1:10314609/68‑1 GATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGC < 1:9228757/68‑1 GATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGC < 1:14007000/68‑1 GATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGC < 1:1382646/68‑1 TGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGCGC < 1:2318203/68‑1 TGGGTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGCGC < 1:1502382/68‑1 TGGGTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGCGC < 1:27149936/68‑1 GGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGCGCAGTGGCTGCGGACTATCGCG > 1:573498/1‑67 GGATTGCCCGTTATCCAATTAATATGCGTTATCCGCAAAGCTGGCGCAGTGCCTGCGGGCTATCGgg > 1:1028691/1‑65 GGATTGCCCGTTATCCAATTAATATGCGTTATACGCAAAGCTGGCGCCGTGCCTGCGGACTATCGCG > 1:17891825/1‑67 ATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCA > 1:2019652/1‑68 CGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGCGCAGTGCCGGCGGGCTATCGCGCCAGCTTT > 1:29671388/1‑67 ATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGCGCAGTGCCTGCGGCCTATCGCGCCAGCTTTGCGGATTAC > 1:4460564/1‑67 CCGCAAAGCTGGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCCGCGTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATA > 1:20163483/1‑68 CCGCAAAGCTGGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGCTAACGCAGATTAATTGGATA > 1:13817169/1‑68 CCGCAAAGCTGGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTTATTGGATA > 1:23710543/1‑68 AGCTGGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGC > 1:8103506/1‑68 AGCTGGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGC > 1:8030842/1‑68 AGCTGGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGC > 1:9087886/1‑68 AGCTGGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGG < 1:14658347/67‑1 AGCTGGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGG < 1:13893068/67‑1 GCTGGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCA > 1:4321934/1‑68 GCTGGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCA > 1:28616091/1‑68 TGGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAAT < 1:12092241/68‑1 TGGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAAT < 1:16854228/68‑1 TGGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAAT < 1:9589259/68‑1 TGGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAAT < 1:19437979/68‑1 GGCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATC < 1:13395754/68‑1 GCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATC > 1:8859415/1‑67 GCGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATC > 1:14943086/1‑67 CGCAGTGCCTGCTGACTATCGGGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTTATTGGATAACGGGCAATCC < 1:8398772/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGTTAACGGGCAATCC < 1:23163030/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:26379248/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:10572404/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:11331933/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:12059550/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:1428522/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:7475020/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:6867422/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:5370435/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:17391713/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:17870987/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:19553981/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:30682983/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:29548615/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:24531504/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:27838962/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:24814326/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCC < 1:26141102/67‑1 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATC > 1:15989677/1‑66 CGCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATC > 1:1126661/1‑66 GCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCACTCCCT > 1:17357176/1‑68 GCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCCCT > 1:19836189/1‑68 GCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCCCT > 1:2184254/1‑68 GCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCCCT > 1:12387960/1‑68 GCAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGAAAACGGGCAATCCCT < 1:15060086/68‑1 CAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCCCT > 1:9612308/1‑67 GGGGCGATGGTTGGCGAAACGGTGGAAGGGATTGCCCGTTATCCAATTAATCTGCGTTATCCGCAAAGCTGGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/596426‑596500‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agctggcgcAGTGCCTGCGGACTATCGCGCCAGCTTTGCGGATAACGCAGATTAATTGGATAACGGGCAATCCCT < CP009273/596517‑596452 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |