| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 691855 = | 282 (0.730) | 34 (0.100) +TAATG |
4/102 | NT | 9.9% | intergenic (+123/+31) | ubiF/glnX | 2‑octaprenyl‑3‑methyl‑6‑methoxy‑1,4‑benzoquinol oxygenase/tRNA‑Gln |
| ? | CP009273 | 691998 = | 398 (1.030) | noncoding (75/75 nt) | glnV | tRNA‑Gln | |||||
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
CATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/691918‑691855‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCG > CP009273/691998‑692064 ||||| CATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAACCGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTTAA < 1:30474173/67‑1 TTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGG < 1:21744337/67‑1 CTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAACCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGA < 1:26528914/68‑1 atCGAGCTTTTTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGT < 1:22190711/66‑1 acCGATCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAACCAGAATCCGGT < 1:13625316/66‑1 cggGCTTTATTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:15666192/65‑1 CGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGC < 1:19782969/68‑1 ggtCTTTATTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:26468109/64‑1 ctGCTTTTATAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:6466424/66‑1 ccGCTTTTTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:19769470/66‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGTATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:4573257/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGT < 1:17672232/65‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:8214391/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:21721671/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:19184111/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:18055627/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:17608644/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:768357/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:5411198/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:2873515/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:20877296/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:25654868/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:11390063/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCACGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCC < 1:10235025/68‑1 GCTTTTTTAAATTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTT < 1:22516585/68‑1 TTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACC < 1:13267154/68‑1 TTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACC < 1:24328662/68‑1 TTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACC < 1:18402469/68‑1 TTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACC < 1:27863236/68‑1 TTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACC < 1:31238474/68‑1 TTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACC < 1:16816852/68‑1 TTTTTAAAGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACC < 1:5412595/68‑1 TTTTAATGTGGCTGGGGTACGTGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGC < 1:13060211/61‑1 taTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCACAAACCGGTGCCTTACCGC < 1:13848025/66‑1 TTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGC < 1:29469472/68‑1 TTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGC < 1:138670/68‑1 TTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGC < 1:4070915/68‑1 TTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGC < 1:24529366/68‑1 TTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGC < 1:8288272/68‑1 TTTAAAGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGC < 1:28772485/68‑1 TTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT < 1:28925582/68‑1 TTAATGTGGCTGGTGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGC < 1:21864458/67‑1 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCT < 1:11001614/68‑1 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCT < 1:7369352/68‑1 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCc < 1:6214987/68‑2 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT > 1:27223339/1‑68 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT > 1:31949898/1‑68 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT > 1:13056786/1‑68 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT > 1:9948932/1‑68 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT > 1:8001349/1‑68 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT < 1:6850304/68‑1 TTAATGTGGCTGGGGTAAGAGGATTCGAACCTCGGAATGCAGGAATCAGAATAAGGTGCATTACCGCT > 1:22151039/1‑68 AATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTG < 1:10230915/68‑1 ATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGG < 1:25547885/68‑1 ATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGG < 1:15314239/68‑1 ATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGG < 1:18734974/68‑1 ATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGG < 1:17262851/68‑1 ATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCCGTGCCTTACCGCTTGG < 1:16021277/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGTGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:843956/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:17245716/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCATAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:8029346/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:4775069/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:3464510/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:8837497/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:30499902/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:30807596/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:31321983/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:6395495/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:10221619/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:9966442/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:32003768/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:20895418/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:10465403/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:10570137/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:10716541/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:1205724/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:12116521/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:12135078/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:13371806/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:15087776/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:15836421/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:17205815/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:19002263/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:19382776/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:20115932/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:22530687/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:22711209/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:23040970/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:23927391/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:25125430/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:25153447/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:26739139/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:26781585/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:27678014/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:27900217/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:30012335/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCATGtc > 1:9084865/1‑66 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCACAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:30258950/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCACGGAATGCCGGAATCACAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:21538601/68‑1 GTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCACAAACCGGTGCCTTACCGCTTGGCG < 1:27557912/68‑1 ||||| CATTCCGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/691918‑691855‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGCG > CP009273/691998‑692064 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |