| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1723413 = | 244 (0.630) | 10 (0.030) | 5/94 | NT | 5.3% | coding (70/4617 nt) | lhr | putative ATP‑dependent helicase |
| ? | CP009273 | 1723475 = | 154 (0.480) | coding (132/4617 nt) | lhr | putative ATP‑dependent helicase | |||||
CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/1723488‑1723413‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcgcgaagCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTACGCCCTC > CP009273/1723475‑1723541 CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:11650765/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:1249971/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:6558950/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:5407413/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:4445963/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:31610369/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:29671357/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAG > 1:24869351/1‑68CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCAGTTTAAAG > 1:9937362/1‑68 CAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGG < 1:6746734/68‑1 AGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:22311558/1‑68 AGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:22612391/1‑68 AGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:20038444/1‑68 AGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:24376924/1‑68 AGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:19240395/1‑68 AGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:11105306/1‑68 GCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:26077507/1‑67 GCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:26738140/1‑67 GCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:25104877/1‑67 GCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:27024160/1‑67 GCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:3826817/1‑67 GCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:9971358/1‑67 GCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:10518189/1‑67 GCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:21451432/1‑67 GCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGC > 1:16564730/1‑67 CGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGC > 1:9981219/1‑68 CGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGC > 1:19229650/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:30129854/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG < 1:16488061/68‑1 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:31376337/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:3337032/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:15786467/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:5125554/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:19691034/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:24628990/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:9218437/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:9257210/1‑68 GCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCG > 1:995103/1‑68 CATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGA > 1:17918105/1‑68 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAA < 1:8017916/68‑1 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAA > 1:28255566/1‑68 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAA < 1:29222419/68‑1 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAA > 1:9830903/1‑68 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGA < 1:7393625/67‑1 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGA < 1:4371297/67‑1 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGA < 1:9236840/67‑1 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGA < 1:21734669/67‑1 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGA < 1:28437070/67‑1 ATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGA < 1:28244156/67‑1 CGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAA < 1:10267477/68‑1 CGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAA < 1:11814427/68‑1 CGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAA < 1:490682/68‑1 CGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGCCAGCGGGCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGC < 1:9059241/68‑1 GCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGC < 1:4127729/67‑1 GCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGCGC < 1:23771535/67‑1 CGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGCGCTGG < 1:4735110/68‑1 CGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGCGCTG < 1:22251413/67‑1 CGCCACATCCCAGGTTTGCGCCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGCGCTGG < 1:23863405/68‑1 CACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTG < 1:9930961/67‑1 CACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGATTAAAGGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTG < 1:30869307/67‑1 CACATCCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTG < 1:8706915/67‑1 CACATCCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGATTAAAGGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTG < 1:3946963/67‑1 GGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCT > 1:31159282/1‑68 GGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTC < 1:29401328/67‑1 GGCGCGAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTC < 1:16337537/67‑1 CGCGAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCAAC > 1:10613377/1‑68 GCGAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTAC > 1:14107186/1‑67 GAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGTAGCATTTCTCTACGCC < 1:22158244/68‑1 GAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTACGCC < 1:26708667/68‑1 GAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTACGCC < 1:19893888/68‑1 GAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTACGCC < 1:2446690/68‑1 GAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTACGCC < 1:21178140/68‑1 GAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTACGCC < 1:7034979/68‑1 GAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTACGCC < 1:30520641/68‑1 GAAGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTACGC < 1:19457934/67‑1 AGCGAAGATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTACGCCCT < 1:20644238/68‑1 AGCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTACGCCC > 1:13380761/1‑67 AGCGAAAATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTACGCCCT < 1:8547491/68‑1 GCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTACGCCCTC > 1:15411668/1‑68 CCAGCGCATGTTCGCTTCGCGCCGCCACATGCCAGGTTTGCGGCTGGACAGCGGTCGGCTGTTTAAAGGCGCGAAG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/1723488‑1723413‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcgcgaagCGAACATGCGCTGGTGATTGCACCGACCGGCTCCGGGAAAACGCTGGCAGCATTTCTCTACGCCCTC > CP009273/1723475‑1723541 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |