New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3015939 | 514 (1.340) | 26 (0.080) | 13/96 | NT | 5.9% | coding (1265/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
? | CP009273 | = 3015996 | 392 (1.190) | coding (1322/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
Only 100 of 135 total aligned reads displayed.
CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3015865‑3015939 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccaACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGCGT < CP009273/3015996‑3015931 CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAC > 1:1079459/1‑68 CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAC < 1:18232234/68‑1 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:26534570/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:26441501/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:6606289/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:17227942/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:18775346/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:11560660/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:17615582/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:18036785/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:31810216/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:31518580/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCAAGGGACCATGGCACTTACG > 1:6045123/1‑67 TTTTCTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:26457192/67‑1 TTTACTCGTTTGGACTGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:20678696/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCG < 1:22707412/68‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:23479469/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:24959929/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:25535366/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:23338410/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:23173301/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:21175835/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:29336766/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:26751343/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:31352371/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:9549174/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:9350537/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:6884514/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:636018/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:4854486/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:3770904/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:32039503/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:31878882/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:27162208/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:30889594/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:30399715/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:29703638/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:29587463/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:10202485/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:28315969/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:27776342/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:15883773/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:11726671/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:12996446/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:11348779/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:13616883/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:14137479/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:11240885/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:10758843/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:15849522/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:16404557/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:17100078/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:17772116/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:20412450/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:19468884/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:18335703/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGCTACCATGGCACTTACGCC > 1:17078724/1‑67 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:15542041/68‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:10034920/68‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:27898347/68‑1 TTACTAGAATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTGACGCCGC < 1:21968759/68‑1 ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA < 1:8160824/68‑1 ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA > 1:21485886/1‑68 TTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCACGGCGCTGGGTAATGACATGAACgt > 1:10428798/1‑66 TCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAAGTTTAT > 1:6178550/1‑68 CACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTAT > 1:17996483/1‑66 CCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCACCTCGCTCTGTAATGCCAGGAACTTTTTGCTGgt > 1:51435/1‑66 ACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGGTCTTTTATGACATGAAGTTTATGCTGTTTCAT > 1:7300111/1‑67 CCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCCACGCGCTCTTTAATGACATGCACTTTATGGTGTTTCATGC > 1:16137471/1‑67 CCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTTATGACATGCACTTTATGCTGTTTCATGC > 1:29010729/1‑67 CCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGC > 1:31478228/1‑67 CCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGC > 1:6003002/1‑67 CAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCC > 1:13377567/1‑68 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |