| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3015939 | 514 (1.340) | 26 (0.080) | 13/96 | NT | 5.9% | coding (1265/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
| ? | CP009273 | = 3015996 | 392 (1.190) | coding (1322/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding | |||||
Only 100 of 638 total aligned reads displayed.
ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGG > CP009273/3015872‑3016005 | aCTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA > 1:21485886‑M1/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:4990530/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:18893831/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:4521073/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:29708636/1‑68 (MQ=255) cGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGt < 1:27708935/68‑1 (MQ=255) cGTATGGACGGCGAGCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGt < 1:24741266/68‑1 (MQ=255) tGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgc > 1:22625855/1‑67 (MQ=255) tGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgc > 1:15928680/1‑67 (MQ=255) tGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgc > 1:28211560/1‑67 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg < 1:21755964/67‑1 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg > 1:12644251/1‑67 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg > 1:16986930/1‑67 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg > 1:13920618/1‑67 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg > 1:5091376/1‑67 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg < 1:26286950/67‑1 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg < 1:16082303/67‑1 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg > 1:22220171/1‑67 (MQ=255) cGGCGTTCGGCTGGGTTTCCACCCCTGCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:23670516/68‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:24286906/68‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:1003651/68‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:26437397/68‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCGGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:1561828/68‑1 (MQ=255) ggCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc > 1:23927448/1‑67 (MQ=255) ggCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc > 1:18155774/1‑67 (MQ=255) cGATCGTCTGGTGATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTc < 1:4682706/67‑1 (MQ=255) tCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTgg < 1:18702235/68‑1 (MQ=255) gTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:25176593/68‑1 (MQ=255) gTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:3513499/68‑1 (MQ=255) gTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:12035925/68‑1 (MQ=255) gTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:5443078/68‑1 (MQ=255) tCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCa > 1:1848496/1‑68 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa < 1:24908010/67‑1 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa < 1:16788344/67‑1 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa > 1:9092102/1‑67 (MQ=255) tATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAAc < 1:21271106/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:959088/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:30327997/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:10986563/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCACGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:23054223/68‑1 (MQ=255) cACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCa > 1:12406861/1‑68 (MQ=255) aCGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCAt < 1:20006781/68‑1 (MQ=255) aCGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCAt < 1:5730425/68‑1 (MQ=255) aCGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCAt < 1:3004150/68‑1 (MQ=255) gCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATaa > 1:407933/1‑68 (MQ=255) ccTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATaaa > 1:24471818/1‑68 (MQ=255) ccTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAAGCCGCCAacgcgcgcgttaatgacatgtactttatgctgtt > 1:13609835‑M1/1‑34 (MQ=255) cTCGACCCAGGTACAATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATaaa < 1:19634791/67‑1 (MQ=255) cTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:3668766/62‑1 (MQ=255) tCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTTGGCATGAAACAGCATAAAGt < 1:17601346/68‑1 (MQ=255) tCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGt < 1:31391832/68‑1 (MQ=255) tCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGt > 1:19212055/1‑68 (MQ=255) cccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCAt > 1:30762166/1‑68 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgc > 1:6003002‑M1/1‑27 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg > 1:6548231/1‑68 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg < 1:31604301/68‑1 (MQ=255) cAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgccc > 1:13377567‑M1/1‑26 (MQ=255) cAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg > 1:14615348/1‑67 (MQ=255) cAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg > 1:19357319/1‑67 (MQ=255) ttccATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:30570180/63‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAgctcgctctttaatgccatgaactttatgctgtttcatgcccgcga > 1:7391010‑M1/1‑22 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:29192491/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:6982455/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:25572201/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:29541092/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:17845217/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:25871458/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:27908564/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:5600590/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:27319062/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAtt > 1:16573002/1‑68 (MQ=255) tACCATAGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt < 1:23321012/67‑1 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATTAAGTTCATGTCAtga > 1:30948494/1‑66 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:8371448/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:10230032/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:12222700/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:5190566/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:10741375/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:13058186/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:28781042/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGCTCGCGCGACTCCTGGGGAGGAAACCGCATAAAGTACATGTCAtaa > 1:32128133/1‑66 (MQ=255) cATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTaaa < 1:22921163/68‑1 (MQ=255) aTGGCACTTACGCCGCCAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggc > 1:14329565‑M1/1‑18 (MQ=255) aTGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAag > 1:12845863/1‑68 (MQ=255) tGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAaga > 1:20786860/1‑68 (MQ=255) tGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAaga > 1:14842719/1‑68 (MQ=255) tGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAaga > 1:1624383/1‑68 (MQ=255) ggCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAaga > 1:1055048/1‑67 (MQ=255) aCTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTGATGTCATTAAAGCGCGa > 1:27009723/1‑68 (MQ=255) aCTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGa > 1:26711696/1‑68 (MQ=255) aCGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:8586823/38‑1 (MQ=255) cgccgcCAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctgg < 1:15398115‑M1/68‑61 (MQ=255) gccgccAactcgctctttaatgacatgaactatatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggc > 1:6350729‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggc < 1:14935912‑M2/68‑5 (MQ=255) gccAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggc < 1:32012564‑M1/68‑65 (MQ=255) ccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggcggcg < 1:17412956‑M2/68‑9 (MQ=255) ccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggcggcg < 1:5863513‑M2/68‑9 (MQ=255) cAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggcg < 1:20567518‑M1/67‑66 (MQ=255) cAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggcggcgt > 1:11385086‑M2/1‑59 (MQ=255) cAGGTCGCGCGCCGCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggcggcg > 1:31841207‑M2/1‑59 (MQ=255) | ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGG > CP009273/3015872‑3016005 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |