| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3851553 = | 429 (1.110) | 36 (0.120) | 16/86 | NT | 10.8% | coding (212/1494 nt) | yidJ | sulfatase/phosphatase superfamily protein |
| ? | CP009273 | 3851602 = | 266 (0.900) | coding (163/1494 nt) | yidJ | sulfatase/phosphatase superfamily protein | |||||
Only 100 of 336 total aligned reads displayed.
CCTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3851631‑3851553‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agtccggcccgtgCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAGACTATC > CP009273/3851602‑3851668 CCTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTTTCTACGCTAACCAG > 1:30208871/1‑68 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGT < 1:3717078/68‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:10059134/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:443778/67‑1 CTACACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAG < 1:11931015/67‑1 ACCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG < 1:112672/68‑1 ACCTGGTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTAATTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG < 1:8014344/68‑1 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGC < 1:334628/68‑1 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGC < 1:13313179/68‑1 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:1650585/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:10120690/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:16575340/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:23148484/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:23744518/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:24548779/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:24639200/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:25338918/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:26372151/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:28789915/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:7913440/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGG > 1:15293655/1‑67 CCTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACAAGTCCGG > 1:24915663/1‑67 CTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCC < 1:32049502/68‑1 CTGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGC > 1:7490440/1‑67 CTGTTCACCGGTTTCAACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCC < 1:4644548/68‑1 CTGATCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCC < 1:14543758/68‑1 TGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCC > 1:28874825/1‑68 TGTTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCC < 1:2801324/68‑1 GTTCACCGGTTTGTACGCCTGCCCGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCC < 1:22475872/67‑1 TTCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGT > 1:21328358/1‑68 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG < 1:28061659/68‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG < 1:8082713/68‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG > 1:18168865/1‑68 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG < 1:30555297/68‑1 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG > 1:6336094/1‑68 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTG > 1:16316295/1‑68 TCACCGGTTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGT < 1:11571502/67‑1 CGGTTGGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGG < 1:18511679/68‑1 ttgGTACGCCTGCCCGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCCGTCCGGCCCGTGCAGGCG < 1:20461823/64‑1 TTTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCG < 1:19229992/67‑1 TTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGT < 1:1969335/67‑1 TTGTACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCAAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGT < 1:31573274/67‑1 ACGCCTGCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAA < 1:14310463/68‑1 tcCACGGGCCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGT > 1:697089/3‑68 CCGGACTATTTACCTGTATCAACGCTAACCTGTCCTGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGG < 1:13103341/67‑1 CCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTCCCCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGG < 1:11750150/67‑1 CCGGACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGT > 1:6109548/1‑68 CCGGACTATTTACCGCAATCTACGCTACCCCGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGG < 1:27236129/67‑1 CGGCCTATTTACCGGTATCTACGCAACCCAGCCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGT < 1:28323785/67‑1 GACTATTTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTA > 1:1950345/1‑68 ttcCCGGTATCTACGCAAACCAGCCCGGCCCGGGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGA < 1:10715882/65‑1 tacCCGGTATCAACGCTAACCCGCCCGGCCCGTGCAGGCGAACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGA < 1:29144018/65‑1 TTACCGGTATCTACGCTAACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGA < 1:8672351/68‑1 cccAACCAGCCCGGCCCGCGCAGGCGAACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATAC < 1:21839359/65‑1 ACCAGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTC < 1:26657516/68‑1 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGATTTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:5447639/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:31914219/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:16883140/1‑67 AGTCCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCG > 1:13431811/1‑67 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATCCCTTCCGCCG > 1:17275947/1‑67 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGC < 1:26107885/68‑1 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCG > 1:23491420/1‑67 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCG < 1:22802280/67‑1 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC < 1:26831575/66‑1 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC < 1:8311020/66‑1 CCGGCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCC < 1:19080723/66‑1 CGGCCCGTGCCGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCC < 1:3462772/68‑1 GGCCCGTGCAGGCTTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCA < 1:20795699/68‑1 GCCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAG > 1:14689638/1‑68 CCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAG > 1:10943484/1‑67 CCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAG > 1:9094076/1‑67 CCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAG > 1:12529808/1‑67 CCCGTGCAGGCGTACAAACCGGTGAACAGGTGTAGGCGGAATTAAAGCGAATACCTTCCGCCGCCAG > 1:18918021/1‑67 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |