New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3999963 | 514 (1.340) | 20 (0.060) | 6/98 | NT | 5.0% | coding (740/1830 nt) | recQ | ATP‑dependent DNA helicase |
? | CP009273 | = 4000007 | 304 (0.900) | coding (784/1830 nt) | recQ | ATP‑dependent DNA helicase |
CTCGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3999893‑3999963 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgcgcTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGATAA < CP009273/4000007‑3999942 CTCGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCC > 1:30705106/1‑67 TCGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGC < 1:29924146/68‑1 TCGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGC < 1:17672099/68‑1 TCGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGC < 1:15434592/68‑1 CGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCG < 1:14129933/68‑1 CGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCG < 1:3205194/68‑1 CGATCAGTTGAGGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCG < 1:438995/68‑1 AACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAG > 1:5008805/1‑37 ACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATATACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGGAGGCGCGCA > 1:6106194/1‑68 ATTATCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTC > 1:881609/1‑67 TCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCGTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCG > 1:20951723/1‑68 TCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTGTTCTACTTTCGCGCG > 1:18022692/1‑68 TCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCG > 1:18029481/1‑68 TCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCG > 1:22859240/1‑68 TCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCG > 1:17437839/1‑68 TCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCG > 1:17039144/1‑68 TCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCG > 1:4826516/1‑68 TCTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCG > 1:4826525/1‑68 CTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTGTACTTTCGCGgg > 1:24528619/1‑65 CTACTGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCG > 1:12201370/1‑67 TGCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGT > 1:30100679/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTGTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:19469654/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTAGTTTCGCGCGGCTGTT > 1:14550901/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:4653658/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:25458985/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:10027139/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:2336260/1‑68 GCAACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTT > 1:12425673/1‑68 AACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGC > 1:29588082/1‑68 AACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGC > 1:11254132/1‑68 AACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGC > 1:2421034/1‑68 AACAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGC > 1:30742066/1‑68 CAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAG > 1:30284870/1‑68 CAGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAG > 1:12259557/1‑68 AGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGT > 1:5527535/1‑68 AGCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGT > 1:20403134/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:20396502/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:5174821/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:1438746/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA < 1:5428451/68‑1 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:23996633/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:23677694/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:12902243/1‑68 GCCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTA > 1:4106803/1‑68 CCGCGCTCATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG > 1:13116264/1‑68 CCGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG > 1:10760475/1‑68 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:4332073/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:31960501/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:3251369/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:9060223/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:10162629/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:10206571/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:28125409/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:25869891/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:10255180/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:22928075/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:20694992/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:14520350/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:1468928/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:1817764/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:14796102/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGA < 1:14823680/68‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:29357874/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:7580614/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:6369221/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:12189478/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:12805249/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:4801014/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:20311407/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:20579748/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:21994201/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:3134294/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:23797370/67‑1 CGCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:29397342/67‑1 CGCGCCAATTCCCTTGCTTTGCAGGTGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAG < 1:13947810/67‑1 GCGCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGAT < 1:3713223/68‑1 GCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGGGGTGTCGTCTACATTCGCGCGGCGGTTGCAGTAGATAA > 1:21860082/1‑68 GCTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGATAA > 1:9450258/1‑68 CTCGATCAGTTGATGCGCTACGTGCAGGAACAGCGCGGTAAGTCAGGCATTATCTACTGCAACAGCCGCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3999893‑3999963 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gccgcgcTAATTCCCTTGCTTTGCAGGCGCGCAGCGGTGTCTTCTACTTTCGCGCGGCTGTTGCAGTAGATAA < CP009273/4000007‑3999942 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |