| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 403544 | 424 (1.100) | 23 (0.070) | 9/96 | NT | 5.2% | coding (661/678 nt) | aroM | AroM family protein |
| ? | CP009273 | = 403571 | 472 (1.430) | intergenic (+10/‑62) | aroM/yaiE | AroM family protein/UPF0345 family protein | |||||
Only 100 of 591 total aligned reads displayed.
GATTTACTGCAAAAACAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCTATAGTGAAGTAGATGTTCA > CP009273/403478‑403611 | aTTTACTGCAAAAACAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCg > 1:13824273/1‑68 (MQ=255) tttACTGCAAAAACAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCg < 1:22245865/67‑1 (MQ=255) ttACTTCAAAAACATCTCGATGTTCCTGTCTTGCTTTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGa < 1:16664957/68‑1 (MQ=255) ttACTGCAAAAACAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGa < 1:12680851/68‑1 (MQ=255) tACTGCAAAAACAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGaa < 1:25057178/68‑1 (MQ=255) cTGCAAAAACAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAAtt < 1:8115788/68‑1 (MQ=255) gCAAAAACAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAAtt > 1:30381693/1‑66 (MQ=255) aaaCAGCTCGATTTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGgt < 1:23093220/68‑1 (MQ=255) aaaCAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTggg < 1:6577492/68‑2 (MQ=255) aaaCAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGgt < 1:27002571/68‑1 (MQ=255) aaaCAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGgt < 1:17596772/68‑1 (MQ=255) aaaCAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGgt < 1:31342960/68‑1 (MQ=255) aaaCAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGgt < 1:9516518/68‑1 (MQ=255) aaaCAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGgt < 1:5391120/68‑1 (MQ=255) aaaCAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGgt < 1:450382/68‑1 (MQ=255) aaaCAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGgt < 1:9268576/68‑1 (MQ=255) aaaCAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGgt < 1:15615956/68‑1 (MQ=255) aaaCAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGgt < 1:4260927/68‑1 (MQ=255) aaaCAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCGGGCTGCGGAATTACTGgt < 1:2820392/68‑1 (MQ=255) gTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGt > 1:24498882/1‑68 (MQ=255) gTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTAATGGTGTAATTTTGCGt > 1:384766/1‑68 (MQ=255) ccTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGAc > 1:14569762‑M2/1‑67 (MQ=255) tGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGAca < 1:26650203‑M2/67‑3 (MQ=255) gTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGAcagc > 1:31093418‑M2/1‑64 (MQ=255) gTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGAcagc > 1:28431402‑M2/1‑64 (MQ=255) tCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGAcagcc < 1:21726163‑M2/68‑6 (MQ=255) cTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGAcagcca < 1:26305524‑M2/68‑7 (MQ=255) tGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGAcagccagc > 1:32127833‑M2/1‑60 (MQ=255) tGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGtcccgcaaaattaccccagtaattacgcagccagccgg > 1:2197531‑M1/1‑30 (MQ=255) tGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAgcgc < 1:20145669/67‑1 (MQ=255) tGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAgcg > 1:11755015/1‑66 (MQ=255) tGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGcc < 1:21460659/68‑1 (MQ=255) cTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGcc > 1:25556095/1‑65 (MQ=255) cTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGcc > 1:5133010/1‑65 (MQ=255) cTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCctc < 1:23832554/67‑1 (MQ=255) aaCGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTgg < 1:19721075/68‑1 (MQ=255) aaCGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTgg < 1:11203462/68‑1 (MQ=255) aaCGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTgg < 1:8841579/68‑1 (MQ=255) aCGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGc < 1:762906/68‑1 (MQ=255) cGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc < 1:1654909/68‑1 (MQ=255) cGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc < 1:24652146/68‑1 (MQ=255) cGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc < 1:14378853/68‑1 (MQ=255) cGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc < 1:25210580/68‑1 (MQ=255) cGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc < 1:25686295/68‑1 (MQ=255) cGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc < 1:27724583/68‑1 (MQ=255) cGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc < 1:30844468/68‑1 (MQ=255) cGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc < 1:20647302/68‑1 (MQ=255) cGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc < 1:6169941/68‑1 (MQ=255) gTATTGATTGCAGGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGccc < 1:8661551/68‑1 (MQ=255) gTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc > 1:10026848/1‑67 (MQ=255) gTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc > 1:27231565/1‑67 (MQ=255) gTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc > 1:29803518/1‑67 (MQ=255) gTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc > 1:15029314/1‑67 (MQ=255) gTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc > 1:14884854/1‑67 (MQ=255) gTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc > 1:23631340/1‑67 (MQ=255) gTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc > 1:18330782/1‑67 (MQ=255) gTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcc > 1:15829952/1‑67 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcccgt < 1:29948932/68‑3 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGcccc < 1:12784003/67‑1 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCt < 1:19384073/68‑1 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCt < 1:5659657/68‑1 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCt < 1:11925289/68‑1 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCt > 1:31837477/1‑68 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCt < 1:28836525/68‑1 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCt > 1:13079355/1‑68 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCt < 1:17929144/68‑1 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCt < 1:27422509/68‑1 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCt < 1:17380268/68‑1 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCt < 1:6764837/68‑1 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCt < 1:16211249/68‑1 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCt < 1:13721236/68‑1 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCt < 1:3466432/68‑1 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCt > 1:25863598/1‑68 (MQ=255) attgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCt < 1:24164862/68‑1 (MQ=255) tgattgCACGGCTGGCTGtcccgcaaaattacaccagttattccgcagccagccgtgcaatcaatacg > 1:7446787‑M1/1‑18 (MQ=255) tgattgCACGGCTGGCTGtcacgcaaaattaccccagtaattccgcagccagccgtgcaatcaagacg > 1:10163077‑M1/1‑18 (MQ=255) tgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCtat > 1:13485410/1‑68 (MQ=255) tgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCtat < 1:24240629/68‑1 (MQ=255) tgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCtat > 1:14256922/1‑68 (MQ=255) tgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCtat < 1:10871134/68‑1 (MQ=255) tgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCtat > 1:5006372/1‑68 (MQ=255) tgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCtat < 1:15348083/68‑1 (MQ=255) tgattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCtat < 1:18770114/68‑1 (MQ=255) gattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCtata > 1:829953/1‑68 (MQ=255) gattgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCtata > 1:26747474/1‑68 (MQ=255) ttgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCTATAGt < 1:21038736/68‑1 (MQ=255) ttgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCTATAGt < 1:7367166/68‑1 (MQ=255) ttgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCTATAGt < 1:13134603/68‑1 (MQ=255) ttgCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCTATAGt < 1:26103481/68‑1 (MQ=255) gCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCTATAGTGa < 1:22277212/68‑1 (MQ=255) aCGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCTATAGTGaa < 1:16994529/67‑1 (MQ=255) aCGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCTATAGTGaa < 1:23419634/67‑1 (MQ=255) cGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCTATAGTGAAGt < 1:22715180/68‑1 (MQ=255) cGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCTATAGTGAAGt > 1:10523243/1‑68 (MQ=255) tggctgCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCTATAGTGAAGTAGAt < 1:31609895/68‑1 (MQ=255) ggctgtcacgcaaaattacaccagtaattccgcagccagccgtgcaatcaatacgttagacagcaaga < 1:18526415‑M1/68‑64 (MQ=255) gctgtcacgcaaaattacaccagtaattccgcagccagccgtgcaatcaatacgttagacagcaagac > 1:7170384‑M1/1‑4 (MQ=255) gtcacgcaaaattacaccagtaattccgcagccagccgtgcaatcaatacgttagacagcaagacagg > 1:22901281‑M1/1‑1 (MQ=255) gtcacgcaaaattacaccagtaattccgcagccagccgtgcaatcaatacgttagacagcaagacagg > 1:29351908‑M1/1‑1 (MQ=255) gCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCTATAGTGAAGTAGATGTTCa > 1:14054554/1‑68 (MQ=255) | GATTTACTGCAAAAACAGCTCGATGTTCCTGTCTTGCTGTCTAACGTATTGATTGCACGGCTGGCTGCGGAATTACTGGTGTAATTTTGCGTGACAGCCAGCGCCTCTGGCCCCTATAGTGAAGTAGATGTTCA > CP009273/403478‑403611 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |