| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3615265 | NA (NA) | 5 (0.010) | 3/100 | NT | 100% | coding (2714/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | = 3615283 | 0 (0.000) | coding (2732/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
GGCAGGCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAAC > CP009273/3615198‑3615332 | gCAGGCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCG < 1:3017799‑M2/68‑1 (MQ=255) gCAGGCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCG < 1:14522862‑M2/68‑1 (MQ=255) cAGTCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCG > 1:23672989‑M2/1‑67 (MQ=255) cAGGCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCCCAGACCCG < 1:4808040‑M2/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCG < 1:2215186‑M2/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCG > 1:29165855‑M2/1‑67 (MQ=255) cAGGCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCG < 1:18690112‑M2/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCG > 1:15145615‑M2/1‑67 (MQ=255) cAGGCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCG < 1:14822329‑M2/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCG > 1:9033859‑M2/1‑67 (MQ=255) cAGGCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCG < 1:22965474‑M2/67‑1 (MQ=255) cAGGCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCG > 1:25791277‑M2/1‑67 (MQ=255) ggCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCA < 1:20352804‑M2/68‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCCTCCCGTATGCCACAGCCCCGGCAG < 1:11630072‑M2/68‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGCCCCGGCAG < 1:27320999‑M2/68‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGgag < 1:22372249‑M2/68‑4 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGgag < 1:22180628‑M2/68‑4 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCtg < 1:18928681‑M2/68‑3 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCgg < 1:19740306‑M2/68‑3 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAG < 1:23756624‑M2/68‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAG < 1:22470784‑M2/68‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAG < 1:28266035‑M2/68‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAG < 1:26943094‑M2/68‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAG < 1:23136927‑M2/68‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAG < 1:912623‑M2/68‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAG < 1:26084236‑M2/68‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAG < 1:807955‑M2/68‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAG < 1:4383454‑M2/68‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAG < 1:31392522‑M2/68‑1 (MQ=255) gCTGACCGGCGTTCAAAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCACGTATGCCACAGAAACGGCAG < 1:17219900‑M2/68‑1 (MQ=255) cTGACCGGCGTTCACACACCACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGC > 1:24094270‑M2/1‑67 (MQ=255) cTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAG > 1:25946009‑M2/1‑67 (MQ=255) cTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGC > 1:25158926‑M2/1‑65 (MQ=255) cTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGC > 1:22677957‑M2/1‑65 (MQ=255) cTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGC > 1:14293503‑M2/1‑65 (MQ=255) cTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGC > 1:31362396‑M2/1‑65 (MQ=255) cTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGC > 1:21029738‑M2/1‑65 (MQ=255) cTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGC > 1:19852840‑M2/1‑65 (MQ=255) cTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGC > 1:300988‑M2/1‑65 (MQ=255) cTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGC > 1:19149114‑M2/1‑65 (MQ=255) cTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGC > 1:30515112‑M2/1‑65 (MQ=255) tGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGG > 1:12871235‑M2/1‑67 (MQ=255) cGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGC > 1:6878842‑M2/1‑67 (MQ=255) gTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCC > 1:16553627‑M2/1‑67 (MQ=255) gTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCC > 1:24100113‑M2/1‑67 (MQ=255) gTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCC > 1:8272414‑M2/1‑67 (MQ=255) tCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGC > 1:29306574‑M2/1‑68 (MQ=255) tCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGC > 1:22855891‑M2/1‑68 (MQ=255) tCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGC > 1:16881721‑M2/1‑68 (MQ=255) tCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTG < 1:10972937‑M2/67‑1 (MQ=255) tCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTG < 1:27640046‑M2/67‑1 (MQ=255) tCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAAAAGCCTG < 1:30956167‑M2/67‑1 (MQ=255) aGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCgggtctgtgg > 1:27721933‑M2/1‑57 (MQ=255) gATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaa < 1:6122910‑M2/68‑34 (MQ=255) cGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgc < 1:9613252‑M2/67‑39 (MQ=255) cccGTATGCCACAGACCCGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcg < 1:5122084‑M2/68‑45 (MQ=255) gCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattc < 1:22498979‑M2/65‑37 (MQ=255) gCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCgggtctgtggcatacgggatgcggatatccagattc < 1:10917064‑M2/65‑37 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:13550079‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:31815721‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:23334304‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:3207859‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:3216109‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc > 1:3734760‑M2/1‑9 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:12483231‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:4685940‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:12201222‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:5415326‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:5553463‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:1179108‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:6679232‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:7244302‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:743816‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:7628415‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:8928347‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:10467161‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:28513819‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:26297711‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:22285505‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:28184469‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:18357648‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:1820322‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:17634102‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:17550880‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:17105181‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:16362038‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:16053851‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagatgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:20736632‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacagccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:10054328‑M2/68‑60 (MQ=255) cccGGCAGGggtataagcgatggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc < 1:5812310‑M2/68‑60 (MQ=255) ccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcg < 1:2863805‑M2/68‑61 (MQ=255) ccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcg < 1:10264992‑M2/68‑61 (MQ=255) ccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcg < 1:11571450‑M2/68‑61 (MQ=255) ccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcg < 1:1907364‑M2/68‑61 (MQ=255) ccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcg < 1:21484484‑M2/68‑61 (MQ=255) ccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc > 1:31178563‑M2/1‑8 (MQ=255) ccGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggc > 1:19531687‑M2/1‑8 (MQ=255) cGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcgg > 1:10573677‑M2/1‑7 (MQ=255) cGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcagcgtttcccggtgcaggcgg > 1:3056114‑M2/1‑7 (MQ=255) cGGCAGGggtataagcggtggtgagttcataacggccgaagctgcgcaccgtttcccggtgcaggcgg < 1:1886010‑M2/68‑62 (MQ=255) | GGCAGGCTGACCGGCGTTCACAC‑‑CACCGCAGCGAATCTGGATATCCGCATCCCGTATGCCACAGACCCGGCAGGTAACCGCCTGCCCGACCCGGAGCTGCACCCGGACAGCACCCTCAGCATGTGGCCGGATAAC > CP009273/3615198‑3615332 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |