| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3832491 = | 386 (0.810) | 25 (0.060) | 6/96 | NT | 7.8% | coding (884/924 nt) | yicL | EamA family inner membrane putative transporter |
| ? | CP009273 | 3832524 = | 260 (0.640) | coding (917/924 nt) | yicL | EamA family inner membrane putative transporter | |||||
Only 100 of 163 total aligned reads displayed.
TTTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3832565‑3832491‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcgcggcATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT > CP009273/3832524‑3832589 TTTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTG > 1:13539642/1‑68 TTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGG < 1:14508843/68‑1 TTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTG > 1:20680486/1‑67 TTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC < 1:6684697/68‑1 TTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC < 1:36969779/68‑1 TTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC < 1:36582528/68‑1 TTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC > 1:28088082/1‑68 TTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC > 1:19519636/1‑68 TAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC > 1:10284240/1‑67 TAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC > 1:9558329/1‑67 TAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGC > 1:10089529/1‑67 AACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGCTTTATTTTTCTGGCGC > 1:18006820/1‑68 AACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGC > 1:30432330/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:22136591/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:20836487/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:20673988/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:20306502/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:3230788/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:31453938/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:39220264/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:17711462/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:4479154/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:28442686/68‑1 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:17138995/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:7579010/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:8409265/1‑68 ACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG < 1:12044994/68‑1 ACGGTGGCGAGGTGCCTGGCAGGTAATTCTCACTTATGCCGAGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:27990894/1‑68 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGTTTTATTTTTCTGGCGCG > 1:37322019/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:3235485/68‑1 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:13686025/68‑1 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:2104816/68‑1 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:34913915/68‑1 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGG < 1:11057079/68‑1 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:32903147/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:11640837/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:31814617/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:39321666/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:5381839/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:881464/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:13716303/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:26098030/1‑67 CGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCG > 1:23341140/1‑67 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTTATTCTCACTTATGCCGCGCCGGCCGATTTATTTTTCTCGCGCGGC > 1:12929366/1‑68 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:22650852/1‑68 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:24095130/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:30128717/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:33975166/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC > 1:28968213/1‑68 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:28798110/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:12550177/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:7855753/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:17139155/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:28062198/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:27009726/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:23797116/68‑1 GGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTAAGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC < 1:23887641/68‑1 GCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATA < 1:24956826/67‑1 CGCGGTGCCGGGCTGGCAATTCACCCTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAA < 1:8911212/67‑1 GCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:3937485/67‑1 GCGGTGCCGGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:26904315/67‑1 GCGGGGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAG < 1:7504075/67‑1 GGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGA < 1:15944301/68‑1 GGTGCCTGGCTGGTAAATCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGA < 1:18820068/68‑1 TGCCTGGCTGGTACTTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAG < 1:29829354/67‑1 TGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAG < 1:4841224/67‑1 TGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAG < 1:19750260/67‑1 TGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAG < 1:33490194/67‑1 TGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAG < 1:33534801/67‑1 CTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATT < 1:6545355/68‑1 CTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATT < 1:30656473/68‑1 CTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAAT < 1:34458013/67‑1 tgtTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCA < 1:28371636/64‑1 TGGTAATGCTCCCTTATCCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCA < 1:5830775/67‑1 GGTAATTCTCCCTTATGCCCCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:19131108/68‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:10448251/68‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:38324419/68‑1 GGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:38410022/68‑1 GGTAAATCTCACTTCTGCCGCCCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGC < 1:14715743/68‑1 GGCGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTA > 1:37424398/1‑68 CGCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAG < 1:31121653/67‑1 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:30856631/1‑68 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:38132125/1‑68 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:37805772/1‑68 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:28344193/1‑68 GCGGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCG > 1:36547975/1‑68 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGAC < 1:26541704/68‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGAC < 1:3230190/68‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:17535530/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:19720942/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:21997867/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:32353640/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:8292485/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:28284420/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:2558485/67‑1 GGCATAAGTGAGAATTACCACCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:8634837/67‑1 GGCATAACTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGA < 1:13354424/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:38231928/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:16415757/67‑1 CATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT < 1:26369019/67‑1 TTTTAACGGTGGCGCGGTGCCTGGCTGGTAATTCTCACTTATGCCGCGCCGGACGATTTATTTTTCTGGCGCGGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3832565‑3832491‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ggcgcggcATAAGTGAGAATTACCAGCCAGGCACCGCGCCACCGTTAAAAATGGTTTCTGCCGCTTTAGCGACT > CP009273/3832524‑3832589 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |