| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 204614 = | 389 (0.820) | 16 (0.040) | 5/94 | NT | 5.0% | coding (3002/3483 nt) | dnaE | DNA polymerase III alpha subunit |
| ? | CP009273 | 204648 = | 277 (0.690) | coding (3036/3483 nt) | dnaE | DNA polymerase III alpha subunit | |||||
Only 100 of 123 total aligned reads displayed.
GCCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/204688‑204614‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑gcgcggcaaTCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGATGTTGTTTACTGACGCC > CP009273/204648‑204714 GCCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCTATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:28724461/1‑68GCCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTTACCATAACCCGC > 1:9402446/1‑68GCCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:28833642/1‑68GCCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:4850223/1‑68GCCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:39263918/1‑68GCCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:38994039/1‑68GCCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:2860339/1‑68GCCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:27439185/1‑68GCCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:2632670/1‑68GCCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:26026940/1‑68GCCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:25928421/1‑68GCCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:23772202/1‑68GCCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:1599542/1‑68GCCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGGGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:2678855/1‑68 CCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:30770299/1‑67 CCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:17104843/1‑67 CCGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC > 1:14241166/1‑67 CGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCG < 1:35317710/67‑1 CGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCG < 1:38814216/67‑1 CGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCG < 1:26703207/67‑1 CGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC < 1:9011966/66‑1 CGCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGC < 1:20856609/66‑1 GCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCG < 1:8979008/68‑1 GCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCG < 1:39466576/68‑1 GCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCG < 1:14937099/68‑1 GCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCG < 1:33756705/68‑1 GCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCG < 1:17971787/68‑1 GCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCG < 1:24957891/68‑1 GCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCG < 1:14987630/68‑1 GCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCG < 1:8155059/68‑1 GCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCG < 1:32786960/68‑1 GCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCG < 1:11701490/68‑1 GCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCG < 1:29256859/68‑1 GCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCG < 1:20948449/68‑1 GCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCG < 1:8024075/68‑1 GCCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCG < 1:12037428/68‑1 CCCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCG > 1:4894484/1‑67 CCGGAACTGTCAGCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGC < 1:31602099/68‑1 CCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGC < 1:10143394/68‑1 CCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGC < 1:25066939/68‑1 CCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGC < 1:6780363/68‑1 CCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGC < 1:34719299/68‑1 CCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGC < 1:34151910/68‑1 CCGGAACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATCGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGC < 1:31349327/68‑1 AACGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAAT < 1:22795383/67‑1 CGGTCATCCCGCGTGCAGATACCGAAACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGT < 1:32361775/68‑1 CGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGT < 1:23731720/68‑1 CGGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCGTGGTGACCATACCCCGCGCGGCAATCGT < 1:17382223/68‑1 CGGGCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGT < 1:32115950/68‑1 GGTCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGTA < 1:678924/68‑1 TCATCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGTAT < 1:38502091/67‑1 TCATCCAGCGGGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGTAT < 1:28852167/67‑1 TCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGTATCGGT < 1:17213897/68‑1 TCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGTATCGGT < 1:13175175/68‑1 TCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGTATCGGT < 1:29604265/68‑1 TCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGTATCGGT < 1:20668080/68‑1 TCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGTATCGGT < 1:30217928/68‑1 TCCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGTATCGGT < 1:32810592/68‑1 CCAGCGTGCAGATACCGCTACGATTGCCGCGCTTGGTCACCATAACCCGCGCGGCAATCGTATCGGTA < 1:28461631/68‑1 CCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGTATCGGTA < 1:19712274/68‑1 CCAGCGTGCAGATACCGATACGATTGCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGTATCGGTA < 1:3726322/68‑1 GCCGCGCTTGGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGG > 1:33636274/1‑68 GGTGACCATAACCCGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGA < 1:5876339/68‑1 CCCGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGATGTTGT < 1:14068411/68‑1 CGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGATGTTGTTT > 1:30647420/1‑66 CGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGATGTTGTTT > 1:27770288/1‑66 GCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGATGTTGTTTACT < 1:25538119/68‑1 GCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGATGTTGTTTACT < 1:7755582/68‑1 CGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGATGTTGTTTACTG > 1:1136752/1‑68 CAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGATGTTGTTTACTGAC > 1:29914670/1‑67 CAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGATGTTGTTTACTGAC > 1:28938392/1‑67 AATCGTATCGTTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGATGTTGTTTACTGACGC < 1:17601976/68‑1 AATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGATGTTGTTTACTGACGC < 1:1536483/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |