| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 204614 = | 389 (0.820) | 16 (0.040) | 5/94 | NT | 5.0% | coding (3002/3483 nt) | dnaE | DNA polymerase III alpha subunit |
| ? | CP009273 | 204648 = | 277 (0.690) | coding (3036/3483 nt) | dnaE | DNA polymerase III alpha subunit | |||||
Only 100 of 490 total aligned reads displayed.
GGCGTAAGGCTGAAAGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTT > CP009273/204547‑204679 | ggcgtcggtaaacaacatcacttccagccgcccggaacggtcatccagcgtgcagataccgatacgat < 1:28586016‑M1/1‑1 (MQ=255)ggcgtcagtaaacaacatcacttccagccgcccggaacggtcatccagcgtgcagataccgatacgat < 1:7969577‑M1/1‑1 (MQ=255)ggCGTAAGGCTGAAAGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCgttgt > 1:93041/1‑68 (MQ=255) gcgtcagtaaacaacatcacttccagccgcccggaacggtcatccagcgtgcagataccgatacgatt < 1:8628128‑M1/2‑1 (MQ=255) gcgtcagtaaacaacatcacttccagccgcccggaacggtcatccagcgtgcagataccgatacgatt < 1:6488006‑M1/2‑1 (MQ=255) gcgtcagtaaacaacatcacttccagccgcccggaacggtcatccagcgtgcagataccgatacgatt < 1:22016625‑M1/2‑1 (MQ=255) gcgtcagtaaacaacatcacttccagccgcccggaacggtcatccagcgtgcagataccgatacgatt < 1:28807398‑M1/2‑1 (MQ=255) gCGTAAGGCTGAAAGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCgttgtt > 1:34454012/1‑68 (MQ=255) cgtcagtaaacaacatcacttccagccgcccggaacggtcatccagcgtgcagataccgatacgatt > 1:32484145‑M1/66‑67 (MQ=255) cggaaGGCGGAAAGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCgttgt < 1:35222710/63‑1 (MQ=255) cagtaaacaacatcacttccagccgcccggaacggtcatccagcgtgcagataccgatacgaTTGCcg > 1:1136752‑M1/63‑68 (MQ=255) gCTGAAAGACATGCACCCGACAGAACGTGCTAAAGTCATCACGGCTCCGGGGCTCGATGTTGCcgcgc > 1:32678378/1‑68 (MQ=255) aaacaacatcacttccagccgcccggaacggtcatccagcgtgcagataccgatacgaTTGCcgcg > 1:27770288‑M1/59‑66 (MQ=255) tGAAAGACATGCACCCGACGGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCgg < 1:521865/68‑1 (MQ=255) tGAAAGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCgg < 1:23034526/68‑1 (MQ=255) tGAAAGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCgg < 1:31781652/68‑1 (MQ=255) tGAAAGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCgg < 1:34173479/68‑1 (MQ=255) gAAAGACATGGACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCggg < 1:22528923/68‑1 (MQ=255) gAAAGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCggg < 1:5931630/68‑1 (MQ=255) gAAAGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCggg < 1:24942272/68‑1 (MQ=255) gAAAGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCggg < 1:29624141/68‑1 (MQ=255) aaGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGt < 1:39273073/67‑1 (MQ=255) aGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTa > 1:12594748/1‑68 (MQ=255) aGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTa > 1:38447019/1‑68 (MQ=255) aGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTa > 1:25593134/1‑68 (MQ=255) aGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTa > 1:21389458/1‑68 (MQ=255) gACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTAt > 1:6203725/1‑68 (MQ=255) gACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTAt > 1:20919855/1‑68 (MQ=255) aCATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATg > 1:23336274/1‑68 (MQ=255) aTGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGt < 1:14766924/68‑1 (MQ=255) aTGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGt < 1:36252178/68‑1 (MQ=255) gCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCa < 1:20060492/68‑1 (MQ=255) aCCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCAcc > 1:1887060/1‑68 (MQ=255) gAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGcgcg > 1:14360189/1‑67 (MQ=255) gAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGcgcg > 1:34897626/1‑67 (MQ=255) gAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGcgcg > 1:17441073/1‑67 (MQ=255) aCGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGcgcg < 1:16211652/65‑1 (MQ=255) aCGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCa > 1:31092546/1‑68 (MQ=255) aCGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCa > 1:21592601/1‑68 (MQ=255) aCGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCa > 1:4498053/1‑68 (MQ=255) aCGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCa > 1:7507661/1‑68 (MQ=255) cGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCaa > 1:25404731/1‑68 (MQ=255) cGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCaa > 1:19768263/1‑68 (MQ=255) gTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCaa > 1:22962027/1‑67 (MQ=255) gTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCaa > 1:32843125/1‑67 (MQ=255) gTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCaa > 1:37360238/1‑67 (MQ=255) gTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAAt < 1:24083676/68‑1 (MQ=255) ggTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATc < 1:35841781/67‑1 (MQ=255) gTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGt > 1:4885082/1‑68 (MQ=255) tAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGt < 1:3955828/67‑1 (MQ=255) tAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGt < 1:19266953/67‑1 (MQ=255) tAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGt < 1:3388178/67‑1 (MQ=255) tAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGt < 1:33646897/67‑1 (MQ=255) tAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGt < 1:13648723/67‑1 (MQ=255) tAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGGTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGt < 1:33349457/67‑1 (MQ=255) tAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCGCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGt < 1:6898690/67‑1 (MQ=255) aaaGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTa > 1:8379762/1‑67 (MQ=255) aaaGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTAt < 1:25181773/68‑1 (MQ=255) aGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCg > 1:13296206/1‑68 (MQ=255) 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catcaCGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGt < 1:15482604/67‑1 (MQ=255) catcaCGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGt < 1:5483274/67‑1 (MQ=255) catcaCGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTCATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGt < 1:31891489/67‑1 (MQ=255) catcaCGGCTGCGGGGCGCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCgg < 1:9596589/66‑1 (MQ=255) catcaCGGCTGCGGGGCGCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGt < 1:3864833/67‑1 (MQ=255) tcccGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATc < 1:18615304/65‑1 (MQ=255) aCGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCt > 1:2227252/1‑67 (MQ=255) cGGCTGCGTGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGc < 1:4095056/68‑1 (MQ=255) cGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGc > 1:20598487/1‑68 (MQ=255) gCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCAc > 1:38828251/1‑68 (MQ=255) 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aTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGtt < 1:22795383‑M1/66‑1 (MQ=255) | GGCGTAAGGCTGAAAGACATGCACCCGACAGAACGTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTT > CP009273/204547‑204679 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |