| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 204614 = | 389 (0.820) | 16 (0.040) | 5/94 | NT | 5.0% | coding (3002/3483 nt) | dnaE | DNA polymerase III alpha subunit |
| ? | CP009273 | 204648 = | 277 (0.690) | coding (3036/3483 nt) | dnaE | DNA polymerase III alpha subunit | |||||
Only 100 of 510 total aligned reads displayed.
GTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGATGTTGTTTACTGACGCCC > CP009273/204581‑204715 | gTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAAt < 1:19560901/68‑1 (MQ=255) ggTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATc < 1:8593444/67‑1 (MQ=255) ggTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATc < 1:35841781/67‑1 (MQ=255) gTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGt > 1:39319046/1‑68 (MQ=255) gTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGt > 1:4885082/1‑68 (MQ=255) tAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGt < 1:36195262/67‑1 (MQ=255) tAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGt < 1:37142278/67‑1 (MQ=255) tAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGt < 1:32641285/67‑1 (MQ=255) tAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGt < 1:33646897/67‑1 (MQ=255) aaaGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGGCACCAAGCGCGGCAATCGTAt < 1:25059400/68‑1 (MQ=255) tcatccagcgtgcagataccgatacgattgccgcgcttggtgaccataacccgcgcggcaaTCGTAt < 1:38502091‑M2/6‑1 (MQ=255) aGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCg > 1:19995968/1‑68 (MQ=255) aGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCg > 1:32293654/1‑68 (MQ=255) gTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCgg > 1:33807462/1‑68 (MQ=255) tccagcgtgcagataccgatacgattgccgcgcttggtgaccataacccgcgcggcaaTCGTATCGGt < 1:17213897‑M2/10‑1 (MQ=255) catcaCGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGt < 1:32723465/67‑1 (MQ=255) catcaCGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGt < 1:34113854/67‑1 (MQ=255) catcaCGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGt < 1:31071337/67‑1 (MQ=255) catcaCGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGt < 1:232036/67‑1 (MQ=255) catcaCGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGt < 1:10051392/67‑1 (MQ=255) catcaCGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGt < 1:15482604/67‑1 (MQ=255) catcaCGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGt < 1:5483274/67‑1 (MQ=255) catcaCGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGt < 1:7112630/67‑1 (MQ=255) catcaCGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTa < 1:9400072/68‑1 (MQ=255) catcaCGGACGCCGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGt < 1:28598172/67‑1 (MQ=255) tcaCGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATc < 1:34966527/68‑1 (MQ=255) caCGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCt < 1:25337338/68‑1 (MQ=255) cGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGc > 1:6608679/1‑68 (MQ=255) cGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGc > 1:27479236/1‑68 (MQ=255) gCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCAc > 1:19327084/1‑68 (MQ=255) tGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACg < 1:30063879/67‑1 (MQ=255) tGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGAAATCGTATCGGTATCTGCAc > 1:2936304/1‑66 (MQ=255) gCGGGTCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCt < 1:22278959/68‑1 (MQ=255) gCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCTATCGTATCGGTATCTGCACGCt < 1:12370075/68‑1 (MQ=255) gCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCt < 1:12931738/68‑1 (MQ=255) gCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCt < 1:233372/68‑1 (MQ=255) gCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCt < 1:26240117/68‑1 (MQ=255) gCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCt < 1:4249300/68‑1 (MQ=255) gCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCt < 1:15696324/68‑1 (MQ=255) taccgatacgaTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTgg < 1:3086880‑M1/57‑1 (MQ=255) taccgatacgaTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTgg < 1:28720927‑M1/57‑1 (MQ=255) ggggCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTgg < 1:27221761/68‑1 (MQ=255) ggggCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTgg < 1:18695214/68‑1 (MQ=255) accgatacgaTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGa < 1:13175175‑M1/58‑1 (MQ=255) cTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATg < 1:22860327/67‑1 (MQ=255) ttgttgCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGt > 1:15943708/1‑68 (MQ=255) tgttgCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGt < 1:10791254/67‑1 (MQ=255) tgttgCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGt < 1:16232488/67‑1 (MQ=255) gttgCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGtt > 1:28458908/1‑67 (MQ=255) gttgCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATATGCACGCTGGATGACCGtt > 1:332707/1‑67 (MQ=255) aTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGtt < 1:22795383‑M1/66‑1 (MQ=255) GCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCgg < 1:29635760‑M1/68‑1 (MQ=255) CGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGggc < 1:8155059‑M1/68‑1 (MQ=255) CGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGggc < 1:14937099‑M1/68‑1 (MQ=255) CGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGggc < 1:29256859‑M1/68‑1 (MQ=255) CGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGggcg < 1:35317710‑M1/67‑1 (MQ=255) CGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGggcg < 1:38814216‑M1/67‑1 (MQ=255) GCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGggcggc > 1:23772202‑M1/1‑68 (MQ=255) GCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGggcggc > 1:28833642‑M1/1‑68 (MQ=255) GCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGggcggc > 1:3992881‑M1/1‑68 (MQ=255) GCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGggcgg > 1:14241166‑M1/1‑67 (MQ=255) gTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGa > 1:17036823/1‑68 (MQ=255) ttATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCt < 1:37806332/43‑1 (MQ=255) aTGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGt < 1:13629601/68‑1 (MQ=255) aTGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGt < 1:34473966/68‑1 (MQ=255) ggTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGa > 1:17858170/1‑68 (MQ=255) gTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGAt > 1:13940237/1‑68 (MQ=255) gTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGAt > 1:17545442/1‑68 (MQ=255) gTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGAt > 1:37376327/1‑68 (MQ=255) 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aTCGTATCGGTAGCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGATGTTGTTTACTGACGcc < 1:18071230‑M2/67‑1 (MQ=255) | GTGGTAAAGTCATCACGGCTGCGGGGCTCGTTGTTGCCGCGCGGGTTATGGTCACCAAGCGCGGCAATCGTATCGGTATCTGCACGCTGGATGACCGTTCCGGGCGGCTGGAAGTGATGTTGTTTACTGACGCCC > CP009273/204581‑204715 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |