New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 282361 | 259 (0.550) | 18 (0.050) | 9/92 | NT | 6.6% | coding (1256/1383 nt) | yagG | CP4‑6 prophage; putative sugar transporter |
? | CP009273 | = 282393 | 298 (0.760) | coding (1288/1383 nt) | yagG | CP4‑6 prophage; putative sugar transporter |
Only 100 of 146 total aligned reads displayed.
GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/282288‑282361 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acgcgggcatCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < CP009273/282393‑282328 cTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGC > 1:38895429/2‑68 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTAC < 1:25364418/66‑1 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTAC < 1:32800930/66‑1 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTAC < 1:7707625/66‑1 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTAC < 1:11373051/66‑1 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTAC < 1:5005187/66‑1 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTAC < 1:4498006/66‑1 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTGCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTAC < 1:33116981/66‑1 GTGCAGCCGGTAGAGGGGCTCACCACCATCAAAATTGTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTAC < 1:21138412/66‑1 AGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGG < 1:442824/67‑1 AGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGG < 1:31143309/67‑1 AGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGG < 1:4170972/67‑1 AGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGG < 1:16538906/67‑1 AGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGG < 1:4319097/67‑1 AGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGG < 1:26169588/67‑1 AGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGGGCCGGTGGTGCTCTACGCGGG < 1:38151472/67‑1 AGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGAGCCGGTGGTGCTCTACGCGGG < 1:38107300/67‑1 GCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCA > 1:5101576/1‑68 GCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCA > 1:697797/1‑68 GCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCA > 1:8215707/1‑68 GCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCA > 1:25949605/1‑68 GCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCA > 1:21388301/1‑68 CCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCAT > 1:5486918/1‑68 CGGTTGAGGTGCTCCCCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCA < 1:7141461/66‑1 CGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATC > 1:2728118/1‑68 CGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCAT < 1:5372960/67‑1 CGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCAT < 1:3651946/67‑1 CGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCA < 1:17982212/66‑1 CGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCA < 1:8370346/66‑1 GGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAG < 1:26532549/67‑1 GGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAG < 1:1357470/67‑1 AATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATG < 1:28848045/68‑1 CTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGA < 1:31151927/68‑1 CTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGA < 1:1021919/68‑1 CTGTGCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGA < 1:376205/68‑1 CTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATG < 1:29510157/68‑1 CTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATG < 1:22399656/68‑1 CTGCGGGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATG < 1:38499396/68‑1 GGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCG < 1:31744995/68‑1 GCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACGGCATGATGAACATGCCCGCGTgg > 1:10372402/1‑66 TGGTGCTCTACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTGGAGgcc > 1:1517821/1‑65 TGGTGCTCCACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCA > 1:6627580/1‑67 ACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCA > 1:4171262/1‑67 ACGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCA > 1:35393442/1‑67 CGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCTCCACCGGCAac > 1:21825088/1‑66 CGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:24474808/1‑68 CGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC < 1:30646463/68‑1 CGCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:35234456/1‑68 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCTCCACCGGCACC > 1:637251/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:34282045/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:12722775/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:20387663/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:12431761/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:29549896/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:29733833/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:23061444/1‑67 GCGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACC > 1:3896105/1‑67 CGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC > 1:3632356/1‑68 CGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC > 1:24765123/1‑68 CGGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC > 1:28431407/1‑68 gtGCATCTGGGAGCATGTATATCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:10005269/65‑1 GGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:29544663/67‑1 GGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:24691672/67‑1 GGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:20008676/67‑1 GGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:8993321/67‑1 GGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:10928624/67‑1 GGGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCAC < 1:29518006/67‑1 GGCATCGGTGAGCTTGTAGCGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCCCCGGCACCACGC > 1:29156964/1‑68 GGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGC > 1:15358858/1‑68 GGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGC > 1:25563511/1‑68 GGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGC > 1:18509500/1‑68 GGCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGC > 1:17055272/1‑68 GCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGC < 1:34566332/67‑1 GCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGC < 1:16108075/67‑1 GCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGC > 1:21604459/1‑67 GCATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGC < 1:38832122/67‑1 CATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCCCCGGCACCACGCAG > 1:11073588/1‑68 CATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAG > 1:5520093/1‑68 CATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAG > 1:25037395/1‑68 CATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAG > 1:22614732/1‑68 CATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAG > 1:27896760/1‑68 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:19300477/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:8690541/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:10654253/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:7717712/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:28499143/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:21947049/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:31053927/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:31299092/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:32269924/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:20242698/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:14602614/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:5213672/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:14728802/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:36025013/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:19622549/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:15798275/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:19312749/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:39558403/68‑1 ATCGGTGAGCTTGTAGAGCGAAAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < 1:26519301/68‑1 GTGCAGCCGGTTGAGGTGCTCACCACCATCAAAATTCTGTTCTGCGTGGTGCCGGTGGTGCTCTACGCGGGCAT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/282288‑282361 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑acgcgggcatCGGTGAGCTTGTAGAGCGACAGCATGATGAACATGCCCGCGTAGAGCACCACCGGCACCACGCAGA < CP009273/282393‑282328 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |