| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 521461 | NA (NA) | 5 (0.010) | 4/102 | NT | 100% | coding (2745/4281 nt) | rhsD | Rhs family putative polymorphic toxin |
| ? | CP009273 | = 521483 | 0 (0.000) | coding (2767/4281 nt) | rhsD | Rhs family putative polymorphic toxin | |||||
GGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACccggc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/521395‑521461‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCGC < CP009273/521483‑521413 GGGCAGGCTTGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACC < 1:6302033/68‑1GGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACC < 1:19958202/68‑1GGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACC < 1:37187856/68‑1GGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACC < 1:37308204/68‑1GGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACC < 1:18670825/68‑1 GGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCC > 1:18361217/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCCTCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:9890772/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCGCGGACCCG > 1:23021249/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:26039708/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:3952705/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:4946504/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:25995192/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:17110282/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:3762982/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:4296467/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:14838102/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:14328786/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:14044776/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:30439197/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCC < 1:31483936/67‑1 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCC < 1:707557/67‑1 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCC < 1:38147276/67‑1 CAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:961825/1‑67 CAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG < 1:35903264/67‑1 CAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG < 1:5786339/67‑1 CAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG < 1:12052588/67‑1 CTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGC < 1:6969208/65‑1 CTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGC < 1:31788393/65‑1 CTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGAACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGC < 1:32389719/65‑1 CCCGTATGCCACGGACCCGGCAGCCGGTTGGCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGCTGCGGGTGTCCAG > 1:34535309/1‑68 CCCGTATGCCACGGACCCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGGTGGGGGTGTGCAG > 1:34583364/1‑68 CGTATGCCACGGACCCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGGCTTCGGGGTGGGGATGTCCAGG > 1:27521627/1‑67 TGCCACGGACCCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGGCTGG > 1:25286218/1‑68 GCCACGGACCCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGGCGATGTCCAGGTCTGGT > 1:29621601/1‑68 gCCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGG < 1:7565012/66‑1 gCCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGG < 1:33328761/66‑1 gCCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGCCCAGGTCTGGTGCGAGGG < 1:33478368/66‑1 aaCGGCAGCCGGTTGCCGGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGG < 1:1536480/65‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCTTACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:24334806/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTTGTGCGAGGGT < 1:24094853/67‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:35670874/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:31995940/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:39203146/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:39199200/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:35205680/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:34331786/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:30692458/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:32517400/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:29556718/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:11181876/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:14329220/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:15395656/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:7632701/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:17956144/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:20002819/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:6666256/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:5950495/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:36966615/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:23172695/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:23780538/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:24351678/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:28743900/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:29216980/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:29986395/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGT < 1:35947508/67‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGT > 1:38535131/1‑67 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGT < 1:31620846/67‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGT < 1:4029082/67‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGT > 1:23003861/1‑67 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGT > 1:1948080/1‑67 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGT < 1:8392400/67‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGGCTGGTGCGAGGGTG < 1:19231719/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGGGGCATACGGGGGGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:24990299/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGGCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:11518990/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCACGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:31407145/68‑1 CCGGAAGCCGGTTGACCGCCGGGACCGGGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:17936369/68‑1 CGGCAGCCGTTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:20238596/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGC < 1:38318539/68‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:9989989/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:3843722/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:15478865/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:21495918/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:22077588/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:22719360/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:10978791/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:39598400/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:39517959/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:33644062/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:39149380/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGGGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:32268498/67‑1 cGCAGCCGGTTTCCCTCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:6841036/67‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:29206916/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:24584885/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:22890192/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:21921012/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:15561354/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:34309700/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAAGGTGCG < 1:5926913/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGG < 1:15306990/51‑1 GCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCGC > 1:23728459/1‑68 GGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACccggc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/521395‑521461‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCGC < CP009273/521483‑521413 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |