New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 1805559 | 372 (0.780) | 16 (0.040) | 11/90 | NT | 5.4% | coding (369/1392 nt) | ydjN | putative transporter |
? | CP009273 | 1806322 = | 259 (0.680) | coding (1132/1392 nt) | ydjN | putative transporter |
Only 100 of 342 total aligned reads displayed.
GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/1805482‑1805559 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgctggtcggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATT > CP009273/1806322‑1806387 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC < 1:9526603/68‑1 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC < 1:24279589/68‑1 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC > 1:23504163/1‑68 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC < 1:23150180/68‑1 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC > 1:25381965/1‑68 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC < 1:26268694/68‑1 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC < 1:28613680/68‑1 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC < 1:168636/68‑1 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC > 1:450778/1‑68 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC > 1:15330596/1‑68 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC > 1:5335869/1‑68 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC > 1:10730298/1‑68 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC < 1:12648976/68‑1 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC > 1:628204/1‑68 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC > 1:13468979/1‑68 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC < 1:12127482/68‑1 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC > 1:6874923/1‑68 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTCATTGCGGC > 1:7261739/1‑68 TCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCGTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGAGCa > 1:37080663/1‑67 TCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGG > 1:39465845/1‑68 TCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGG > 1:34969606/1‑68 TCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGG > 1:18044563/1‑68 TCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGG < 1:1433398/68‑1 TCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGG > 1:21152041/1‑68 TCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGG < 1:31981313/68‑1 TCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGG < 1:20534525/68‑1 TCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGG < 1:23385953/68‑1 gaTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACTCTTTTGTTTACAACGCTGATTGCGGCGCTGGTCG > 1:4283926/3‑68 GTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCG > 1:14510424/1‑68 GTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCG > 1:3228809/1‑68 GTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCG > 1:35314845/1‑68 TAGGCTAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTC < 1:32531502/65‑1 TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:9030212/68‑1 TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT > 1:24720537/1‑68 TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:10530176/68‑1 TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:28358108/68‑1 TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:29810253/68‑1 TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:29916291/68‑1 TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT > 1:31171138/1‑68 TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:5546516/68‑1 TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:17215954/68‑1 TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:16204735/68‑1 TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:15750752/68‑1 TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:11921709/68‑1 TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTC < 1:3295099/65‑1 TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTC < 1:27717208/65‑1 CAAAATCAGTTTTCTGACCATCCGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGCCGCTGGTCGGTATT < 1:4997373/67‑1 TTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGC < 1:17545805/45‑1 CCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTTTTGTTAACGGTAGTTCC > 1:4666982/1‑65 TTGTTTACCACGCGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGT < 1:38565530/68‑1 TTGCGCCGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAAC < 1:34900250/67‑1 TGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGGGGTGCAACTTTCGCCGC < 1:3412314/67‑1 TGGGCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGC < 1:14999996/67‑1 TGGACGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGC < 1:27044694/67‑1 GGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGC > 1:10005413/1‑66 TCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG > 1:22640030/1‑68 TCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG > 1:35776103/1‑68 TCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACT < 1:16570945/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGA < 1:7064814/68‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGA < 1:18469166/68‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGA > 1:33178527/1‑68 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGA < 1:26811065/68‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGA < 1:29375534/68‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:38004772/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:35549591/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:9718635/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:38786569/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:16293590/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:4114105/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:11509590/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:7786268/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:22866183/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:15043696/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:5749314/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:13293473/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:21270379/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:23958183/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:26032375/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:22029277/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:26580893/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:21684380/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:28493935/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:21461623/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:28876064/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:34639408/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:20732024/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:30333766/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:20198761/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:19286071/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:18750308/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:32788732/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:33487446/67‑1 CGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:33783320/67‑1 CGGTATGGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTG < 1:34442238/67‑1 GGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTTGTGCAACTTTCGCCGCACTGAT < 1:9226980/68‑1 GGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGAT < 1:30824407/68‑1 GGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGAT < 1:8204619/68‑1 GGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGAT < 1:25053538/68‑1 GGTATTGTTACCGTTAGCTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGAT < 1:31304023/68‑1 GTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATT > 1:13902075/1‑68 GCATCTCAGTTAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/1805482‑1805559 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgctggtcggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATT > CP009273/1806322‑1806387 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |