| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1805559 | 372 (0.780) | 16 (0.040) | 11/90 | NT | 5.4% | coding (369/1392 nt) | ydjN | putative transporter |
| ? | CP009273 | 1806322 = | 259 (0.680) | coding (1132/1392 nt) | ydjN | putative transporter | |||||
Only 100 of 656 total aligned reads displayed.
TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCA > CP009273/1805492‑1805625 | tAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:9030212‑M1/68‑1 (MQ=255)tAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:17215954‑M1/68‑1 (MQ=255)tAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:38810517‑M1/68‑1 (MQ=255)tAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:38363469‑M1/68‑1 (MQ=255)tAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT > 1:21617801‑M1/1‑68 (MQ=255)tAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:6201463‑M1/68‑1 (MQ=255)tAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT > 1:24720537‑M1/1‑68 (MQ=255)tAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT < 1:3421747‑M1/68‑1 (MQ=255)tAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGT > 1:7509244‑M1/1‑68 (MQ=255) gCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGgtgt > 1:24163550/1‑67 (MQ=255) gCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGgtgt > 1:35057497/1‑67 (MQ=255) gCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTATTGTATACCACGCTCATTGCGTCGCTGGTCGgtgt > 1:25933240/1‑67 (MQ=255) cAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGgtgt < 1:27284635/66‑1 (MQ=255) aaTCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTgg < 1:3470981/68‑1 (MQ=255) aaTCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTgg < 1:1403072/68‑1 (MQ=255) tCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTc < 1:18187107/68‑1 (MQ=255) tCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTc < 1:29135433/68‑1 (MQ=255) tCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTc < 1:4017403/68‑1 (MQ=255) tCTGTCCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGTTTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAAcc < 1:32539889/68‑1 (MQ=255) cTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCt < 1:5150852/68‑1 (MQ=255) gACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTgt > 1:36444490/1‑68 (MQ=255) cGGTACGCTTTTGTTTACCTCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTgtttggtt < 1:36670019/68‑1 (MQ=255) gCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACg > 1:20481588/1‑67 (MQ=255) gCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACg > 1:16890040/1‑67 (MQ=255) gCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACg > 1:548812/1‑67 (MQ=255) gCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACg > 1:37881224/1‑67 (MQ=255) gCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACg > 1:19465679/1‑67 (MQ=255) ttttGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGc < 1:3035822/67‑1 (MQ=255) ttttGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCt < 1:12126834/68‑1 (MQ=255) ttttGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCt < 1:7092227/68‑1 (MQ=255) gTTTACCTCTCTGATTGATGCGCTTGTCGTTGTGCTTGTCACGTACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAg < 1:12732860/68‑1 (MQ=255) gTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAg > 1:34502059/1‑68 (MQ=255) tttACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGCCGGCTGAAgg > 1:29458655/1‑68 (MQ=255) tttccACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGt < 1:793220/65‑1 (MQ=255) ttACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAgg > 1:35628619/1‑67 (MQ=255) aCCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGAGGGCTCAAgg > 1:35427209/1‑65 (MQ=255) cACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTgg < 1:2078185/68‑1 (MQ=255) cACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTgg < 1:15437815/68‑1 (MQ=255) cACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTgg < 1:26873852/68‑1 (MQ=255) cACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTgg < 1:10690434/68‑1 (MQ=255) cACGCTGATTGCGGCGCGGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTgg < 1:31686882/68‑1 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTTGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGt < 1:27492426/68‑1 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGt < 1:6920594/68‑1 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGt < 1:5813730/68‑1 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGt < 1:37086035/68‑1 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGt > 1:37376533/1‑68 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGt < 1:38193455/68‑1 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGt < 1:38570101/68‑1 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGt > 1:29858325/1‑68 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGt < 1:4767653/68‑1 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGt < 1:10450108/68‑1 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGt < 1:24540134/68‑1 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGt < 1:15684038/68‑1 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGt < 1:13482715/68‑1 (MQ=255) aCGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGt < 1:13237962/68‑1 (MQ=255) ttGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGggt < 1:8614848/68‑1 (MQ=255) tGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGggtg > 1:11711467/1‑68 (MQ=255) gcggcgCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGggtgg < 1:28798383/68‑1 (MQ=255) gcggcgCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGCTTTGACGGCTCAAGGTCTGGTTCAGggtgg > 1:25024852/1‑68 (MQ=255) ggcgCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGggtggt < 1:9516294/67‑1 (MQ=255) ggcgCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGgtggtg < 1:30732287/68‑1 (MQ=255) ggcgCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGgtggtg < 1:15196599/68‑1 (MQ=255) ggcgCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGgtggtg < 1:25565976/68‑1 (MQ=255) ggcgCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGgtggtg < 1:4591103/68‑1 (MQ=255) gcgcTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGc > 1:23396975/1‑68 (MQ=255) gcgcTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGc > 1:13914696/1‑68 (MQ=255) gcgcTGGTCGATGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGc > 1:19200291/1‑68 (MQ=255) gcTGGTCGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgcc > 1:35995794‑M1/1‑10 (MQ=255) gcTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAg > 1:30062288/1‑68 (MQ=255) tGGTCGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgc < 1:11400251‑M1/67‑60 (MQ=255) tGGTCGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgc < 1:27954774‑M1/67‑60 (MQ=255) ggTCGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgc > 1:10005413‑M1/1‑7 (MQ=255) tCGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg > 1:22640030‑M1/1‑5 (MQ=255) cgttatttttaccgtttgttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcggcgcactg < 1:18642889‑M1/64‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgctactttcgccgcactg < 1:30964295‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactga > 1:33178527‑M1/1‑4 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactga < 1:18469166‑M1/68‑65 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:4889974‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:4269654‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:20198761‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:14827656‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:9338113‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:9718635‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:22356373‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:28410715‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:26580893‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:32819856‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:33463508‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:33830279‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:23581368‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:16519223‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:22029277‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:21436927‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:21169712‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:38659663‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:17761071‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactg < 1:39170473‑M1/67‑64 (MQ=255) cGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACt < 1:16236109/67‑1 (MQ=255) ggTattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactgat < 1:22954277‑M1/68‑66 (MQ=255) tattgttaccgttagttccgcaggcgttgccggtgtcggtggtggtgcaactttcgccgcactgatt < 1:31272209‑M1/67‑67 (MQ=255) | TAGGCAAAATCAGTTTTCTGACCATCGGTACGCTTTTGTTTACCACGCTGATTGCGGCGCTGGTCGGTGTGCTGGTCACCAACCTGTTTGGTTTGACGGCTGAAGGTCTGGTTCAGGGTGGTGCAGAAACTGCA > CP009273/1805492‑1805625 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |