| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 1805559 | 372 (0.780) | 16 (0.040) | 11/90 | NT | 5.4% | coding (369/1392 nt) | ydjN | putative transporter |
| ? | CP009273 | 1806322 = | 259 (0.680) | coding (1132/1392 nt) | ydjN | putative transporter | |||||
Only 100 of 581 total aligned reads displayed.
GGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGT > CP009273/1806255‑1806389 | ggTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTa < 1:26361616/68‑1 (MQ=255)ggTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTa < 1:3805561/68‑1 (MQ=255)ggTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTa < 1:16508457/68‑1 (MQ=255)ggTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTa < 1:37571294/68‑1 (MQ=255)ggTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTa < 1:13412427/68‑1 (MQ=255)ggTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTa > 1:5348208/1‑68 (MQ=255)ggTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTa < 1:19810743/68‑1 (MQ=255) gATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTAtt < 1:11884934/67‑1 (MQ=255) gATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTAtt < 1:13834723/67‑1 (MQ=255) tGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGt < 1:34807872/67‑1 (MQ=255) tGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGt < 1:14172298/67‑1 (MQ=255) ggTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTa < 1:3525099/68‑1 (MQ=255) ttGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTAcc > 1:27791657/1‑68 (MQ=255) tGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCg < 1:32899990/68‑1 (MQ=255) tGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCg < 1:18349823/68‑1 (MQ=255) tGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCg > 1:21388581/1‑68 (MQ=255) tGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCg < 1:9827458/68‑1 (MQ=255) cTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAg < 1:6878634/67‑1 (MQ=255) cGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTcc < 1:23209925/68‑1 (MQ=255) cGGTTGGCAGTAACCCGCTGGCCCCGAGGTGGAGTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTcc < 1:18650606/68‑1 (MQ=255) ggTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTcc > 1:35606725/1‑67 (MQ=255) ggTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTcc > 1:21821833/1‑67 (MQ=255) ggTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTcc > 1:33926963/1‑67 (MQ=255) cATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGGAGGCg > 1:8274208/1‑68 (MQ=255) cATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCg > 1:4903250/1‑68 (MQ=255) cATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCg > 1:33661634/1‑68 (MQ=255) ttAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGtt < 1:25272826/68‑1 (MQ=255) tacgcttttgtttaccacgctgattgcggcgctggtcggtATTGTTACCGTTAGGGCCGCAGGCgtg > 1:28575454‑M2/41‑66 (MQ=255) gcttttgtttaccacgctgattgcggcgctggtcggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCg > 1:5141264‑M2/38‑68 (MQ=255) cccGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCg > 1:15773807/1‑68 (MQ=255) cccGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCg > 1:19257962/1‑68 (MQ=255) cccGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGCTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCg > 1:22541993/1‑68 (MQ=255) cGCTGGACCCGAGGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGgt < 1:30778866/68‑1 (MQ=255) gCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGgtg > 1:7768929/1‑68 (MQ=255) gCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGgtg < 1:13246765/68‑1 (MQ=255) ttgtttaccacgctgattgcgacgctggtcggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCg < 1:38314963‑M2/25‑1 (MQ=255) ctgttaaccacgctgattgcgacgctggtcggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGgtgt < 1:24554696‑M2/35‑1 (MQ=255) tGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGgtgt < 1:21494426/67‑1 (MQ=255) tGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGgtgt < 1:18797276/67‑1 (MQ=255) tGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGgtgt < 1:9061782/67‑1 (MQ=255) tGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGgtgt < 1:1740187/67‑1 (MQ=255) tGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTc > 1:28342348/1‑68 (MQ=255) tGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTc > 1:10830969/1‑68 (MQ=255) ggACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCg < 1:6330759/68‑1 (MQ=255) ttaccacgctgattgcggcgctggtcggtTTTGTTAGCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCggt > 1:12498236‑M2/30‑68 (MQ=255) cccGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCggtg > 1:19494446/1‑68 (MQ=255) cccGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCggtg > 1:2997176/1‑68 (MQ=255) cccGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCggt < 1:9589627/67‑1 (MQ=255) cccGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCggt < 1:36373629/67‑1 (MQ=255) ccGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCggtgg > 1:22106213/1‑68 (MQ=255) gATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCggtggtg < 1:24135011/68‑1 (MQ=255) aTGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCggtggtgg > 1:15295482/1‑68 (MQ=255) tgtgGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCggtggtggt < 1:20299872/68‑1 (MQ=255) gtgGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCggtggtggt > 1:10343377/1‑67 (MQ=255) aTTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCa > 1:29221658/1‑66 (MQ=255) aTTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCa > 1:7226817/1‑66 (MQ=255) aTTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCa > 1:22698164/1‑66 (MQ=255) aTTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCa > 1:27461978/1‑66 (MQ=255) aTTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCa > 1:11262691/1‑66 (MQ=255) gCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACtt > 1:21193396/1‑67 (MQ=255) gACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTc < 1:35779478/67‑1 (MQ=255) gACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTc > 1:36045713/1‑67 (MQ=255) gACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTc < 1:38894484/67‑1 (MQ=255) gACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTc > 1:16233319/1‑67 (MQ=255) gACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTc > 1:6054972/1‑67 (MQ=255) gACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTc > 1:8110065/1‑67 (MQ=255) gctggtcggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTcgcc > 1:33404945‑M2/11‑67 (MQ=255) gctggtcggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTcgcc > 1:33177918‑M2/11‑67 (MQ=255) gctggtcggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTcgcc > 1:29714287‑M2/11‑67 (MQ=255) gctggtcggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTcgcc > 1:9340600‑M2/11‑67 (MQ=255) tggtcggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGGGGTGCAACTTTcgccgc < 1:3412314‑M2/59‑1 (MQ=255) tgggcggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTcgccgc < 1:14999996‑M2/59‑1 (MQ=255) ggtcggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTcgccgc > 1:12112994‑M2/8‑66 (MQ=255) ggtcggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTcgccgc > 1:10005413‑M2/8‑66 (MQ=255) cggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTTGTGCAACTTTCGCCGCACTg < 1:32172568‑M2/63‑1 (MQ=255) cggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCTACTTTCGCCGCACTg < 1:30964295‑M2/63‑1 (MQ=255) cggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTg < 1:11509590‑M2/63‑1 (MQ=255) cggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTg < 1:4618653‑M2/63‑1 (MQ=255) cggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTg < 1:4114105‑M2/63‑1 (MQ=255) cggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTg < 1:17761071‑M2/63‑1 (MQ=255) cggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTg < 1:16684341‑M2/63‑1 (MQ=255) cggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTg < 1:23581368‑M2/63‑1 (MQ=255) cggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTg < 1:34639408‑M2/63‑1 (MQ=255) cggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTg < 1:20586856‑M2/63‑1 (MQ=255) cggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTg < 1:20732024‑M2/63‑1 (MQ=255) cggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTg < 1:38659663‑M2/63‑1 (MQ=255) cggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTg < 1:2571336‑M2/63‑1 (MQ=255) cggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTg < 1:28876064‑M2/63‑1 (MQ=255) cggtATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGa < 1:26811065‑M2/64‑1 (MQ=255) 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aTTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGt > 1:39230157/1‑68 (MQ=255) | GGTGATGGTTGCGCCTACGGTTGGCATTAACCCGCTGGACCCGATGTGGATTGCGACGCTGGTCGGTATTGTTACCGTTAGTTCCGCAGGCGTTGCCGGTGTCGGTGGTGGTGCAACTTTCGCCGCACTGATTGT > CP009273/1806255‑1806389 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |