| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1985565 = | 327 (0.690) | 14 (0.030) | 9/96 | NT | 5.8% | noncoding (34/76 nt) | glyW | tRNA‑Gly |
| ? | CP009273 | = 4382323 | 177 (0.430) | noncoding (35/76 nt) | glyX | tRNA‑Gly | |||||
ACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/1985639‑1985565‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgaccttgGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGCTTTGCAGCACTTTTC < CP009273/4382323‑4382259 ACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCAC > 1:20356740/1‑68ACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCAC > 1:21086153/1‑68ACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCAC > 1:21875448/1‑68ACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCAC > 1:2776545/1‑68ACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCAC > 1:29797887/1‑68ACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCAC > 1:16826223/1‑68ACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCAC > 1:12499888/1‑68ACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCAC > 1:12546206/1‑68ACGATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCAC > 1:13837187/1‑68 GATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA < 1:925754/68‑1 GATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA < 1:5523204/68‑1 GATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA < 1:5062256/68‑1 ATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA > 1:14851667/1‑67 ATAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGA > 1:3456174/1‑67 tacTAAAATCAAGTGATTAACTGAAAGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGGTGGTAGAGCACGAC < 1:32930527/64‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:37576380/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:36381245/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:35117121/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:6178877/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:38854299/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:4447022/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:3257487/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:6379114/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:28976137/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:27821546/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:865733/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:8695851/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:21756715/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:881526/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:9829178/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:1906153/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:15083196/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:17771874/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:10969369/67‑1 TAATAAAATCAAGTGATTAACAGATTGCTTGATGAATGCGGCAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGAC < 1:26604489/67‑1 AATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCT < 1:13405695/68‑1 ATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTT > 1:26781155/1‑68 ATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTT > 1:4036104/1‑68 ATAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTT > 1:452104/1‑68 TAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTG < 1:5636395/68‑1 TAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTG < 1:21526163/68‑1 TAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTG < 1:4499229/68‑1 TAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTG < 1:28306685/68‑1 TAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTG < 1:4366900/68‑1 TAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTG < 1:39586279/68‑1 TAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTG < 1:17037293/68‑1 TAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTG < 1:34615429/68‑1 TAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTG < 1:23744262/68‑1 TAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTG < 1:10299439/68‑1 TAAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTT > 1:33145790/1‑67 AAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTG > 1:26940295/1‑67 AAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTG > 1:37226632/1‑67 AAAATCAAGTGATTAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTG > 1:30558537/1‑67 AAAATCAAGTGAATAACTGATTGCTTGATGAAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCAAGACCTTa > 1:7193120/1‑66 TAACTGATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGTGCTC < 1:19486169/68‑1 GATTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGCTCTACCA < 1:14765202/68‑1 TTGCTTGATGAATGCGGGAATAGCTCCGTGGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGTGCTCTACCAAC < 1:10981052/68‑1 TTGATGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTACAGCACGACCTTCCCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGA < 1:17100428/67‑1 TGAATGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTAT < 1:33394313/68‑1 ATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGGCAAGGTCGTGCGCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTGGG > 1:24700676/1‑68 CTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGG > 1:14966287/1‑67 CTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGG > 1:11002854/1‑67 TCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGG > 1:15350908/1‑66 TGGTAGAGCACGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTA‑CAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGCT > 1:10723018/1‑68 TAGAGCACGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTGCCGCGTGGGTGGTCTGTGCTTT > 1:2721818/1‑68 TAGAGCACGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGCTTT > 1:36066199/1‑68 TAGAGCACGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTGGGTGGTCTGTGCTgt > 1:1724231/1‑66 TAGAGCACGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTGGGTGGTCTGTGCTTT > 1:16424115/1‑68 ACGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGCTTTGCAGC > 1:10757403/1‑67 ACGACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCGTGGGTGGTCTGTGCGTTTCAGC > 1:22186544/1‑67 ACGACCTTGGCAAGGTCGGGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGGTTTGCAGC > 1:33934573/1‑67 GACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGCTTTGCAGCACT < 1:10283161/68‑1 GACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGCTTTGCAGCACT < 1:31139497/68‑1 GACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGCTTTGCAGCACT < 1:27616451/68‑1 GACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGCTTTGCAGCACT < 1:30646087/68‑1 GACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGCTTTGCAGCACT < 1:1883908/68‑1 GACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGCTTTGCAGCACT < 1:30226143/68‑1 ACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGCTTTGCAGGACTT > 1:35797412/1‑68 ACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGCTTTGCAGCACTa > 1:9729010/1‑67 ACCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGCTTTGCAGCACTT > 1:30367283/1‑68 CCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTTTGCTTTGCAGCACTTT > 1:35810784/1‑68 CCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTTCTTTGCAGCACTTT > 1:18869929/1‑68 CCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGCTTTGCAGCACTTT > 1:35810752/1‑68 CCTTGGCAAGGTCGTGCTCTACCAACTGAGCTATTCCCGCTTGGGTGGTCTGTGCTTTGCAGCACTTT > 1:19699351/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 21 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |