| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1985565 = | 327 (0.690) | 14 (0.030) | 9/96 | NT | 5.8% | noncoding (34/76 nt) | glyW | tRNA‑Gly |
| ? | CP009273 | = 4382323 | 177 (0.430) | noncoding (35/76 nt) | glyX | tRNA‑Gly | |||||
Only 100 of 245 total aligned reads displayed.
TTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACA > CP009273/4382256‑4382389 | aaaGTTCTGCAAAGCACATACCACCCAAGCGGGAATAGCTCATTTTGTAGAGCACGACCTTGCcaagg > 1:17908403‑M2/1‑63 (MQ=255) aaaGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCcaagg > 1:665773‑M2/1‑63 (MQ=255) aaaGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCcaagg > 1:19699351‑M2/1‑63 (MQ=255) aaaGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCcaagg < 1:6974106‑M2/68‑6 (MQ=255) aaaGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCcaagg > 1:22501689‑M2/1‑63 (MQ=255) aaaGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCcaagg > 1:26085779‑M2/1‑63 (MQ=255) aaaGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCcaagg > 1:25300980‑M2/1‑63 (MQ=255) aaaGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCcaagg > 1:35810752‑M2/1‑63 (MQ=255) aGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCcaaggtc < 1:27616451‑M2/68‑8 (MQ=255) aGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCcaaggtc < 1:30226143‑M2/68‑8 (MQ=255) aGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCcaaggtc < 1:10283161‑M2/68‑8 (MQ=255) gctgaAACGCACAGACCACCCACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCcaaggtcgt > 1:22186544‑M2/1‑58 (MQ=255) aaaGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTcgc > 1:24468014/1‑68 (MQ=35) aaaGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTcgc > 1:23701517/1‑68 (MQ=35) aaaGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTcgc > 1:35990650/1‑68 (MQ=35) aaaGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTcgc > 1:38320470/1‑68 (MQ=35) aaaGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTcgc > 1:39198656/1‑68 (MQ=35) acaGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCcaagg < 1:24908661‑M2/53‑6 (MQ=255) ccaccCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCcaaggtcgtgctctaccaactga > 1:15350908‑M2/1‑43 (MQ=255) cccACGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGCGCACGACCTTGCcaaggtcgtgctctaccaactgagctat > 1:24700676‑M2/1‑40 (MQ=255) tCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGGgaaggtcgtgctgtaccaactgagctattcccgcattcatcaa < 1:17100428‑M2/67‑44 (MQ=255) gTTGGTAGAGCACGACCTTGGcaaggtcgtgctctacccacggagctattcccgcattcatcaagcaa < 1:10981052‑M2/68‑48 (MQ=255) tAGAGCACGACCTTGGcaaggtcgtgctctaccaactgagctattcccgcgtactacttaattttgct < 1:26936742‑M2/68‑53 (MQ=255) tAGAGCACGACCTTGGcaaggtcgtgctctaccaactgagctattcccgcgtactacttaattttgct < 1:29145426‑M2/68‑53 (MQ=255) tAGAGCACGACCTTGGcaaggtcgtgctctaccaactgagctattcccgcgtactacttaattttgct < 1:15526554‑M2/68‑53 (MQ=255) tAGAGCACGACCTTGCCAGGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGATACCCGATCCAAAATTTGAAAg > 1:21594319/1‑68 (MQ=11) tAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAATTTTGAAAg > 1:2922306/1‑68 (MQ=14) tAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTTAAAg > 1:13926913/1‑68 (MQ=14) 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agagCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGt < 1:1208694/68‑1 (MQ=33) agagCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGt < 1:34572129/68‑1 (MQ=33) agagCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGt < 1:11357620/68‑1 (MQ=33) agagCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGt < 1:22321494/68‑1 (MQ=33) agagCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGt > 1:16972416/1‑68 (MQ=33) agagCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGt < 1:17385047/68‑1 (MQ=33) agagCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTCCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGt < 1:23129286/68‑1 (MQ=18) gagCACGACCTTGGcaaggtcgtgctctaccaactgagctattcccgcattcatcaagcaatcagtta < 1:19486169‑M2/68‑55 (MQ=255) gagCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTg > 1:33509492/1‑68 (MQ=35) gagCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTg > 1:32134566/1‑68 (MQ=35) 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gCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGcaca < 1:14724926/68‑1 (MQ=255) | TTTGAAAAGTGCTGCAAAGCACAGACCACCCAAGCGGGAATAGCTCAGTTGGTAGAGCACGACCTTGCCAAGGTCGGGGTCGCGAGTTCGAGTCTCGTTTCCCGCTCCAAAATTTGAAAGTGCTGTAAGGCACA > CP009273/4382256‑4382389 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |