| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 2279605 = | 339 (0.710) | 21 (0.060) | 9/86 | NT | 8.7% | coding (1751/1761 nt) | yejM | essential inner membrane DUF3413 domain‑containing protein; lipid A production and membrane permeability factor |
| ? | CP009273 | 2279638 = | 179 (0.490) | intergenic (+23/‑52) | yejM/proL | essential inner membrane DUF3413 domain‑containing protein; lipid A production and membrane permeability factor/tRNA‑Pro | |||||
Only 100 of 202 total aligned reads displayed.
GGCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTTAGCGA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/2279683‑2279605‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑aatcagttagcgaAATATCTTACTTGCAATCGGTGTGGAAAACGGTAGTATTAGCAGCCACGAGTCGGCACGTAGCGCA > CP009273/2279638‑2279703 GGCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:32800069/1‑68GGCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:33299139/1‑68GGCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:18563370/1‑68GGCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTA < 1:27580032/67‑1GGCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTA < 1:29100661/67‑1 GCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:29410863/1‑67 GCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:4430176/1‑67 GCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:13606282/1‑67 GCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:18776491/1‑67 GCTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAA > 1:18379696/1‑67 CTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATC > 1:10732674/1‑68 CTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATC > 1:20444142/1‑68 CTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATC > 1:18990382/1‑68 CTGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGAGTTATAATTAATC > 1:28363087/1‑68 CTGCTAATACTACCGTATTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATC > 1:17537802/1‑68 TGCTAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCA < 1:9527225/68‑1 TAATACTACCGTTTTCCACACCGTTTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGT < 1:17709020/67‑1 TAATACTACCGTTTTCCACACCGATTGCAAGTAAGATATTTCGCTAACTGATTTATAATTAATCAGTT > 1:35405729/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |