| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2499292 | 362 (0.760) | 21 (0.050) | 12/98 | NT | 5.8% | coding (820/1086 nt) | ypdF | Xaa‑Pro aminopeptidase |
| ? | CP009273 | = 2499321 | 364 (0.880) | coding (791/1086 nt) | ypdF | Xaa‑Pro aminopeptidase | |||||
Only 100 of 104 total aligned reads displayed.
CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2499220‑2499292‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cccggcgTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT < CP009273/2499321‑2499256 CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACC < 1:28735889/68‑1CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACC < 1:17370008/68‑1CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:13525179/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:875040/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:1427199/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:26048992/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:21713651/1‑67CTTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:8202865/1‑67 TTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCC > 1:25087832/1‑68 TTCAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCC > 1:7547454/1‑68 CAATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGG < 1:3215382/68‑1 AATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:10476537/68‑1 AATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:9235043/68‑1 AATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:32998184/68‑1 AATGCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGC < 1:28201840/68‑1 GCCGATAGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGAC > 1:32777577/1‑60 AGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGC < 1:25147120/68‑1 AGCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGC < 1:14801334/68‑1 GCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCC > 1:10115064/1‑68 GCGTGACCGGTGTTATGACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGC > 1:34916418/1‑67 GACCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATG > 1:19161731/1‑67 CCGAAATAGTCGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCC > 1:22193437/1‑67 CGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGT > 1:26684981/1‑68 CGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGG > 1:17352214/1‑67 CGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGG > 1:14419256/1‑67 CGCCATAACCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCGGCCAGCACGTTGACGATGCCCCGCGGCGGG > 1:5790947/1‑67 CCTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAG > 1:17309781/1‑68 CTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTGATTACAGA > 1:33643893/1‑68 CTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTTCAGA > 1:38940113/1‑68 CTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGA > 1:28232689/1‑68 CTGCTTCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGA > 1:29588756/1‑68 TCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAG > 1:22271239/1‑68 TCTGTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAG > 1:17328163/1‑68 GTAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTT > 1:39336185/1‑68 TAATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTA > 1:28223619/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTAT > 1:26394340/1‑68 AATGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTAT > 1:19882714/1‑68 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGG > 1:11983172/1‑68 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:34455862/1‑67 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:22195502/1‑67 TGACCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATG > 1:4080263/1‑67 CCCGGCGTGCGGTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTGTTTACAGAAGCTGGTTATGGCGA < 1:7586810/68‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGCAGCAGGTTATGGCG > 1:5467427/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGACGCAGGTTATGGCG > 1:11840953/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGGAGGTTATGGCG > 1:20839160/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGA < 1:27212392/68‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:29092937/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:31315039/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:33288724/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:10732969/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:8649518/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:33744929/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:12610345/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:14359149/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:16499161/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:2476463/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:5516796/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:616518/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:6547594/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:21511203/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:15604221/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:18084423/1‑67 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:17529983/67‑1 CCCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG < 1:16451070/67‑1 CCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:27569497/1‑66 CCGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCG > 1:22299585/1‑66 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:31493887/68‑1 CGGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:13777209/68‑1 CGGCGTGCGCAGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACT < 1:6782199/68‑1 GGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGGCGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTA > 1:33521087/1‑68 GGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGCCGATGCCGCGCGCCGGGTCCTTACAGAAGCAGGGTATGGCGACTA > 1:27272082/1‑68 GGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTA > 1:9246566/1‑68 GGCGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTA < 1:21511382/68‑1 CGTGCGCTGCCAGCTGGTTGACGATGCAGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:22675898/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:3104607/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:32369052/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:14406473/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:8372622/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:21396756/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:33529009/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:7351888/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:31192645/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:22225194/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:27939289/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:596413/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:5684361/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:22825890/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTATT > 1:24660840/1‑68 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:5551188/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:419217/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:4091656/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:8147436/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:25097229/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:2596393/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:26950700/67‑1 CGTGCGCTGCCAGCAGGTTGACGATGCCGCGCGCCGGGTCATTACAGAAGCAGGTTATGGCGACTAT < 1:8660742/67‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |