| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2636459 | 363 (0.760) | 20 (0.060) | 6/84 | NT | 5.8% | intergenic (‑256/+29) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent |
| ? | CP009273 | = 2636469 | 373 (1.050) | intergenic (‑266/+19) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
Only 100 of 339 total aligned reads displayed.
TAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2636379‑2636459‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cattacgccacggtTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATT < CP009273/2636469‑2636403 TAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAAC < 1:3071849/68‑1TAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAAC < 1:37497460/68‑1TAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAAC < 1:36707398/68‑1TAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAAC < 1:32227182/68‑1TAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAAC < 1:8652984/68‑1 AAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACA > 1:11831599/1‑68 AAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACA < 1:19860279/68‑1 AAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACA > 1:18403558/1‑68 AAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACA > 1:8921223/1‑68 AGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGCCCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATT > 1:14553222/1‑68 AGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATT > 1:7780701/1‑68 AGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATT > 1:3993998/1‑68 AGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATT > 1:17778240/1‑68 AGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATT > 1:36061684/1‑68 AGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATT > 1:7695368/1‑68 AGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATT < 1:11552209/68‑1 AGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATT > 1:30906454/1‑68 AGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATT > 1:10002792/1‑68 AAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCAC < 1:16308900/68‑1 AAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCAC < 1:35896342/68‑1 AAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCAC < 1:38990623/68‑1 AAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCC < 1:9476099/66‑1 AAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCC < 1:12630028/66‑1 AAAAACGCACCGTTAATATTGACCACACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCC < 1:30022102/66‑1 AAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG < 1:34686681/68‑1 AAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGG < 1:10633093/68‑1 AACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT < 1:16883452/68‑1 AACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT < 1:21090072/68‑1 AACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT < 1:21548692/68‑1 TATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCCCGGGTTCTTTATGTTCC > 1:3569157/1‑68 TATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTTACTTTATGTACC > 1:32759630/1‑68 TATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTTACTTTATGTACC > 1:4818959/1‑68 TATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTTACTTTATGTACC > 1:38879191/1‑68 TATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGGTTCTTTATGTACC > 1:14019807/1‑68 TTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTTACTTTATGTACCGT > 1:30967787/1‑68 ACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATT < 1:28956257/40‑1 CCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGC < 1:2440498/67‑1 CAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATG > 1:29479712/1‑68 CATTACGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTG < 1:21313236/68‑1 CATTACGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTG < 1:15124248/68‑1 CATTACGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATT < 1:34929551/67‑1 CATTACGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGCTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTG < 1:19730095/68‑1 CATTACGCCACGGTTACTTTATGTACCGTAGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTG < 1:32031328/68‑1 CATTACGCCACGGGTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTG < 1:38140870/68‑1 TACGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTG > 1:33100032/1‑65 ctCCACGGTTACTTTTTGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAATTTGCAATTGTCTGG < 1:1320611/66‑1 CGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATTAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG < 1:23598136/68‑1 CGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG < 1:8260989/68‑1 CGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG < 1:29214202/68‑1 CGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG > 1:33661800/1‑68 CGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG < 1:34384373/68‑1 CGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG < 1:7068699/68‑1 CGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG < 1:3932606/68‑1 CGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG < 1:36724463/68‑1 CGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG < 1:17578076/68‑1 CGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG < 1:27992122/68‑1 CGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG < 1:18841917/68‑1 CGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG < 1:19221493/68‑1 CGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG < 1:15502728/68‑1 CGCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG < 1:20788833/68‑1 GCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG > 1:30223961/1‑67 GCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG > 1:4497176/1‑67 GCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG > 1:20658811/1‑67 GCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG > 1:26080953/1‑67 GCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG > 1:10992830/1‑67 GCCACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGG > 1:11907104/1‑67 CACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTC < 1:23322325/67‑1 CACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTC < 1:379980/67‑1 ACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAA > 1:1222781/1‑68 ACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAA < 1:26668161/68‑1 ACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAA < 1:33965280/68‑1 ACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAA > 1:22079184/1‑68 ACGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAA < 1:23943818/68‑1 CGGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAAT < 1:2034973/68‑1 tGTTACTTTCTGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:37837442/67‑1 tGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:8428626/67‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCGATA > 1:27071126/1‑68 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:12700297/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:8801343/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:7281529/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:16760340/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:12284561/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:6837096/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:5520800/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:5040052/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:9819390/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:18290071/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:2020773/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA > 1:38272696/1‑68 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:37705785/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:37122386/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA > 1:36988824/1‑68 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:21803637/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:22474733/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:35417928/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:25507480/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:26504981/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:28232380/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:28738998/68‑1 GGTTACTTTATGTACCGCGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATA < 1:27386095/68‑1 TAAAGTCAGCAAAAACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2636379‑2636459‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cattacgccacggtTACTTTATGTACCGTGGCGTAATGTTTTATGAATGAAGTATTAAGTTGCAATTGTCTGGTCAATATT < CP009273/2636469‑2636403 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |