| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2636459 | 363 (0.760) | 20 (0.060) | 6/84 | NT | 5.8% | intergenic (‑256/+29) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent |
| ? | CP009273 | = 2636469 | 373 (1.050) | intergenic (‑266/+19) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
Only 100 of 953 total aligned reads displayed.
AACGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCG > CP009273/2636392‑2636526 | aCGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTa < 1:10405347/68‑1 (MQ=255) aCGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTa < 1:33562406/68‑1 (MQ=255) aCGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTa < 1:31642338/68‑1 (MQ=255) aCGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTa < 1:29794522/68‑1 (MQ=255) aCGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTa < 1:25896516/68‑1 (MQ=255) aCGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTa < 1:19289888/68‑1 (MQ=255) cGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAATCATTACGCCACGGTAc > 1:29332247/1‑68 (MQ=255) cGCACCGTTAATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTAc < 1:34189691/68‑1 (MQ=255) 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cAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTCCGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggcgtaat > 1:28263738‑M2/1‑54 (MQ=255) cAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCTACGGTACATAAAGTAaccgtggcgtaatg < 1:32031328‑M2/68‑15 (MQ=255) aaTTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATgg < 1:35219996/68‑1 (MQ=255) aaTTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATgg < 1:31118379/68‑1 (MQ=255) ttGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCt < 1:11972481/68‑1 (MQ=255) ttGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCt < 1:35524214/68‑1 (MQ=255) ttGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCt < 1:26214434/68‑1 (MQ=255) ttGCAACTTAATACTACATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCt < 1:18571637/68‑1 (MQ=255) gCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTa > 1:7409881/1‑67 (MQ=255) aaCTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCa > 1:10003400/1‑68 (MQ=255) 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |