| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2636459 | 363 (0.760) | 20 (0.060) | 6/84 | NT | 5.8% | intergenic (‑256/+29) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent |
| ? | CP009273 | = 2636469 | 373 (1.050) | intergenic (‑266/+19) | rodZ/rlmN | MreB assembly cytoskeletal protein/dual specificity 23S rRNA m(2)A2503, tRNA m(2)A37 methyltransferase, SAM‑dependent | |||||
Only 100 of 871 total aligned reads displayed.
AATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGG > CP009273/2636403‑2636536 | aaTATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAa > 1:32427183‑M2/1‑67 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:22025634‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:22474733‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:5520800‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:27216787‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:38287645‑M2/68‑4 (MQ=255) tatTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAacc < 1:8801343‑M2/68‑4 (MQ=255) atTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccg < 1:2034973‑M2/68‑5 (MQ=255) ttGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgt < 1:37624467‑M2/68‑6 (MQ=255) ttGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgt > 1:1222781‑M2/1‑63 (MQ=255) gACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtg < 1:23322325‑M2/67‑7 (MQ=255) ccATACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggcg > 1:27974435‑M2/1‑59 (MQ=255) ccAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggcg < 1:7837379‑M2/68‑10 (MQ=255) ccAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggcg < 1:17951981‑M2/68‑10 (MQ=255) ccAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggc > 1:30200781‑M2/1‑59 (MQ=255) ccAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggc > 1:26080953‑M2/1‑59 (MQ=255) ccAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggc > 1:4497176‑M2/1‑59 (MQ=255) ccAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggc > 1:21385200‑M2/1‑59 (MQ=255) cAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggcgt < 1:24219814‑M2/68‑11 (MQ=255) cAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggcgt > 1:19157258‑M2/1‑58 (MQ=255) cAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggcgtaat > 1:32020040‑M2/1‑54 (MQ=255) aaTTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATgg < 1:11052417/68‑1 (MQ=255) ttGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCt < 1:28304223/68‑1 (MQ=255) gCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTa > 1:10621971/1‑67 (MQ=255) gCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTa > 1:20024200/1‑67 (MQ=255) aaCTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCa > 1:21685841/1‑68 (MQ=255) aaCTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCa > 1:10003400/1‑68 (MQ=255) aTACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGc < 1:17308891/68‑1 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCt < 1:20608913/68‑1 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCt < 1:26728157/68‑1 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCt < 1:25516938/68‑1 (MQ=255) tACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCt < 1:4814358/68‑1 (MQ=255) aCTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCtt > 1:8365061/1‑68 (MQ=255) aCTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCtt > 1:650503/1‑68 (MQ=255) aCTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCtt > 1:19482115/1‑68 (MQ=255) aCTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCtt > 1:3736776/1‑68 (MQ=255) cTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCttt < 1:24551073/68‑1 (MQ=255) cTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCttt > 1:12427248/1‑68 (MQ=255) cTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCttt > 1:34415394/1‑68 (MQ=255) attcatAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATg > 1:25247921/1‑68 (MQ=255) aaaaCATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATg < 1:16772899/68‑1 (MQ=255) aaaCATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGAGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATgg < 1:33925671/68‑1 (MQ=255) cATTACGCCACGGTACATAAAGTAaccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattg > 1:29479712‑M2/1‑24 (MQ=255) cATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCt > 1:37876825/1‑67 (MQ=255) tACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCAc < 1:33005669/68‑1 (MQ=255) tACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCAc < 1:21132347/68‑1 (MQ=255) aCGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCAcc < 1:15595390/68‑1 (MQ=255) aCGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCAcc < 1:15044249/68‑1 (MQ=255) aCGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCAc > 1:28498761/1‑67 (MQ=255) gCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCAc > 1:12720159/1‑65 (MQ=255) gCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCAc > 1:13996236/1‑65 (MQ=255) gCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCAc > 1:21861209/1‑65 (MQ=255) gCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCt < 1:16402904/68‑1 (MQ=255) ccACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCt > 1:5020996/1‑67 (MQ=255) aCGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCa > 1:35621479/1‑68 (MQ=255) cGGTACATAAAGTAcccgtggcgtaatgttttatgaatgaagtattaagttgcaattgtctggtcaat > 1:11898039‑M2/1‑14 (MQ=255) ggTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAAGGTCGATGGCTTCACCCTGCAt > 1:1527445/1‑67 (MQ=255) aCATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCg < 1:6892072/67‑1 (MQ=255) 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aaCCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAgg < 1:33257214/68‑1 (MQ=255) aaCCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAg < 1:37127778/67‑1 (MQ=255) | AATATTGACCAGACAATTGCAACTTAATACTTCATTCATAAAACATTACGCCACGGTACATAAAGTAACCGTGGCGTAATGGCTATCAGACCGCTTTAATGTCGATGGCTTCACCCTGCATCCGTTTACGCAGG > CP009273/2636403‑2636536 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |