New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 3015939 | 513 (1.080) | 33 (0.080) | 14/96 | NT | 7.4% | coding (1265/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
? | CP009273 | = 3015996 | 385 (0.950) | coding (1322/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3015865‑3015939 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccaACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGCGT < CP009273/3015996‑3015931 CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCCCCCAGGTACCATGGCACTTAC > 1:12813935/1‑68 CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAC > 1:3066057/1‑68 CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAC > 1:17885867/1‑68 TGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG < 1:38406096/68‑1 TGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTAC > 1:34698564/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTTCCATGGCACTTACG > 1:9154312/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:21379451/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:27762985/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:34120508/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:34848696/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:36407028/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:12025505/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:5444522/1‑67 GCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCAGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACG > 1:17844401/1‑67 TTTACTGGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:34680303/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCG < 1:18597156/68‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:24929665/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:7413761/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:22582016/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:21745234/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:21418640/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:33785679/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:28352272/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:293321/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:30126221/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:30188306/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:3245948/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:25618892/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:3658097/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:39139088/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:5020243/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:5170791/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:5461200/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:5519962/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:21187369/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:14666765/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:15511330/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:14214326/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:7981549/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:7755720/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:16188709/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:16880323/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:13094749/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:12407175/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:19247628/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:20414902/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:11093065/67‑1 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:11446555/1‑67 TTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCAACCAGGTACCATGGCACTTACGCC > 1:33269725/1‑67 TTTACTCGTATCGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:28381117/67‑1 TTTACTCGTATCGACGGCGATCGTCTGGGTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCC < 1:31021680/67‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCTTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCtc < 1:10892246/68‑3 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:34351791/68‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:771722/68‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:16256438/68‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:4210506/68‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:26889157/68‑1 TTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGC < 1:24831201/68‑1 TACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCC > 1:6152179/1‑68 ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA > 1:10141741/1‑68 TCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTAT < 1:7277442/68‑1 TCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCGCGTTAATGACATGAACTTTAT > 1:29587196/1‑68 CCTCCACCCCGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGGTGTTTAATGGCATGAAATTTTTGCTGTT > 1:13314656/1‑68 CCTCCACCCAGGTACCATGGCGCTTACGCCGCCAACTCGGGCGTTAATGACATGACCTGTATGCTGTT > 1:20053715/1‑68 CCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCCACTCGCTCGTTAATGACATGAACTTTAGGCTGTT > 1:37629292/1‑68 CCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCACCTCGCTCTTTAATGCCATGAACTTTATGCTGTT > 1:38728564/1‑68 ACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCAT > 1:10298271/1‑67 CCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGC > 1:25937582/1‑67 TACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGA > 1:6674438/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGGTCTTTAATGACATGCTCTTTATGCTGGTTCATGCCCACGAG > 1:1167162/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCCTGCCCACGAG > 1:30899821/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAG > 1:32820363/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAG > 1:2161647/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAG > 1:10534041/1‑68 ACCATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAG > 1:31591511/1‑68 CATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGC > 1:28051717/1‑68 ATGGCACTTACGCCGCCATCTCGCTCGTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCGCACGAGGC > 1:4244751/1‑67 ATGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGC > 1:22320673/1‑67 TGGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGC > 1:26539855/1‑68 TGGCACTAACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTCTGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGC < 1:17417305/68‑1 GGCACTTACGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGC > 1:11914885/1‑67 CGCCGCCATCTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:24571587/68‑1 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:39004376/68‑1 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:24616438/68‑1 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGG < 1:6936925/68‑1 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTG > 1:13121413/1‑67 CGCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTG > 1:38093134/1‑67 GCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGCACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGC > 1:14740060/1‑68 GCCGCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGC < 1:19633522/68‑1 GCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGC < 1:28013347/68‑1 GCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGC < 1:36436489/68‑1 GCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGC < 1:36055454/68‑1 GCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGC < 1:34673334/68‑1 GCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGC < 1:23955671/68‑1 GCCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGC < 1:11194097/68‑1 GCCAACTCGATCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTGATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGC < 1:16107867/68‑1 CCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGCG > 1:23007298/1‑68 CCAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGCG > 1:9386349/1‑68 CAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGCGT < 1:34540154/68‑1 CAACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGCG < 1:15837433/67‑1 CTGCTTTACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/3015865‑3015939 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgccaACTCGCTCTTTAATGACATGAACTTTATGCTGTTTCATGCCCACGAGGCGCGCGACCTGGCGGCGT < CP009273/3015996‑3015931 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |