| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 3015939 | 513 (1.080) | 33 (0.080) | 14/96 | NT | 7.4% | coding (1265/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding |
| ? | CP009273 | = 3015996 | 385 (0.950) | coding (1322/2871 nt) | xdhD | putative hypoxanthine oxidase, molybdopterin‑binding/Fe‑S binding | |||||
Only 100 of 673 total aligned reads displayed.
ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGT > CP009273/3015872‑3016006 | tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGGCAgg > 1:27042693/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:22235006/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:17560481/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:39599838/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:13375061/1‑68 (MQ=255) tCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCAACCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:25897824/1‑68 (MQ=255) cGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAgg > 1:36742249/1‑67 (MQ=255) tGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCCCTTACGCCGCCAGGTcgc > 1:27569647/1‑67 (MQ=255) tGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgc > 1:5834983/1‑67 (MQ=255) tGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcga > 1:3013181/1‑66 (MQ=255) ggACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgc > 1:8680844/1‑68 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCCCGCCTCCACCCCGGGACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg > 1:35247276/1‑67 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg > 1:22958561/1‑67 (MQ=255) aCGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTcgcgcg < 1:21474201/67‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:1273104/68‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:14470223/68‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:680085/68‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:15488934/68‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGcc < 1:17113848/68‑1 (MQ=255) cGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGGCGCGCGcc < 1:1257025/68‑1 (MQ=255) cGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTc < 1:23801427/67‑1 (MQ=255) cGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTc < 1:16673298/67‑1 (MQ=255) cGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTc < 1:34542215/67‑1 (MQ=255) cGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTc < 1:6504424/67‑1 (MQ=255) tCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTgg < 1:29864932/68‑1 (MQ=255) gTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGc < 1:19123747/68‑1 (MQ=255) cTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCAt < 1:33155368/68‑1 (MQ=255) ggTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGa > 1:16868440/1‑68 (MQ=255) ggTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGa > 1:22529612/1‑68 (MQ=255) gTTGTCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa > 1:3364616/1‑68 (MQ=255) gTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa > 1:3091871/1‑68 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa < 1:30549759/67‑1 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa < 1:31441711/67‑1 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa < 1:16069419/67‑1 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa > 1:25705040/1‑67 (MQ=255) ttATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGaa < 1:4552629/67‑1 (MQ=255) tATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAAc > 1:7032860/1‑68 (MQ=255) tATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAAc > 1:19475196/1‑68 (MQ=255) tCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAg < 1:38718471/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCGTCGTGGGGATGAAACCGc > 1:18005629/1‑68 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:23722424/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:21772474/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:34784837/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:16332050/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:38036716/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:13961665/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:11292038/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:28119466/68‑1 (MQ=255) ccACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGc < 1:10323911/68‑1 (MQ=255) cACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGct > 1:34978591/1‑67 (MQ=255) cACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCa > 1:8958198/1‑68 (MQ=255) aCGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCAt > 1:26824927/1‑68 (MQ=255) aCGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCAt < 1:2082408/68‑1 (MQ=255) aCGCCTCCACCCAGGTACCATGGAACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAACCACCAt > 1:7903434/1‑68 (MQ=255) ccTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAactcgctggtttatgacatgaactttatgctgtt > 1:28811070‑M1/1‑34 (MQ=255) ccTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATaaa > 1:28433510/1‑68 (MQ=255) cTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAg < 1:27886504/68‑1 (MQ=255) cTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAg < 1:24481755/68‑1 (MQ=255) cTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGGGGGCATGAAACAGCATTAAg > 1:37468487/1‑68 (MQ=255) tCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTTGGCATGAAACAGCATAAAGt < 1:6155095/68‑1 (MQ=255) tCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATATAGt < 1:8301493/68‑1 (MQ=255) tCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGt < 1:2735505/68‑1 (MQ=255) tCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGt < 1:23239055/68‑1 (MQ=255) aCCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCGTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCa > 1:18757277/1‑68 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg < 1:25040223/68‑1 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg > 1:111063/1‑68 (MQ=255) ccAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGGGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATg > 1:29489670/1‑68 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCGGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAtt > 1:38245469/1‑68 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:11791141/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:15040251/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:38959483/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:21166027/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:25393896/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTc < 1:31797469/65‑1 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAtt > 1:32630244/1‑68 (MQ=255) tACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCAt < 1:12292401/67‑1 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATTAAAACGCAGAATGTTCATGTCATTa > 1:26390531/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACATCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:9654230/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:13712961/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:39144996/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:30302964/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:12177963/1‑68 (MQ=255) aCCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTa > 1:1983780/1‑68 (MQ=255) cATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTaaa > 1:1774742/1‑68 (MQ=255) cATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTaaa > 1:10559589/1‑68 (MQ=255) aTGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAag > 1:32149036/1‑68 (MQ=255) aTGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAag > 1:34068506/1‑68 (MQ=255) tGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAaga > 1:10014772/1‑68 (MQ=255) tGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAag > 1:27466333/1‑67 (MQ=255) ggCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAaga > 1:5179485/1‑67 (MQ=255) aCTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTTAAGAGCGa > 1:20308586/1‑68 (MQ=255) cgccgcCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtg < 1:15837433‑M2/67‑3 (MQ=255) gccgccAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgccctggc > 1:24114028‑M1/1‑7 (MQ=255) gccgccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggc < 1:36436489‑M2/68‑5 (MQ=255) gccAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggc < 1:36055454‑M1/68‑65 (MQ=255) gccAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTGCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggcggc > 1:14740060‑M2/1‑61 (MQ=255) ccAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggcg > 1:37890835‑M1/1‑3 (MQ=255) cAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggcgt < 1:35666442‑M1/68‑67 (MQ=255) cAactcgctctttaatgacatgaactttatgctgtttcatgcccacgaggcgcgcgacctggcggcgt < 1:24655754‑M1/68‑67 (MQ=255) cAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTtggcggcg > 1:13121413‑M2/1‑59 (MQ=255) | ACTCGTATGGACGGCGATCGTCTGGTTATCCACGCCTCCACCCAGGTACCATGGCACTTACGCCGCCAGGTCGCGCGCCTCGTGGGCATGAAACAGCATAAAGTTCATGTCATTAAAGAGCGAGTTGGCGGCGGT > CP009273/3015872‑3016006 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |