| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3202855 = | NA (NA) | 12 (0.030) | 5/94 | NT | NA | intergenic (+9/+34) | ttdT/tsaD | L‑tartrate/succinate antiporte/tRNA(ANN) t(6)A37 threonylcarbamoyladenosine modification protein; glycation binding protein |
| ? | CP009273 | 3202881 = | NA (NA) | intergenic (+35/+8) | ttdT/tsaD | L‑tartrate/succinate antiporte/tRNA(ANN) t(6)A37 threonylcarbamoyladenosine modification protein; glycation binding protein | |||||
Only 100 of 1008 total aligned reads displayed.
ATTCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCGCCAGCGGCCAGCGC > CP009273/3202789‑3202922 | ggatctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattggg < 1:17469704‑M1/2‑1 (MQ=255)ggatctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattggg < 1:8651646‑M1/2‑1 (MQ=255) ttCCTCGTCTTGCTGGTGATTACGGGCTTACTGTGGATGCCCTTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:16227964/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:29697452/68‑1 (MQ=255) ttCCTCGTATTGCGGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt < 1:36311080/68‑1 (MQ=255) tCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGt > 1:12034583/1‑67 (MQ=255) tCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTg < 1:18899994/68‑1 (MQ=255) ccTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGc < 1:5651902/68‑1 (MQ=255) ctcggcgttagcgtgcgtccgcgctggccgctggcggagttaccggctgcgtaaaactattgGGTGcc > 1:25388778‑M1/63‑68 (MQ=255) cGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCgg > 1:359523/1‑68 (MQ=255) gTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGa > 1:29337093/1‑68 (MQ=255) aTTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGaaa > 1:35705875/1‑68 (MQ=255) gCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAAtt > 1:2639952/1‑67 (MQ=255) tGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGc > 1:31393315/1‑67 (MQ=255) tGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGc > 1:33422100/1‑67 (MQ=255) tGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGc > 1:7234811/1‑67 (MQ=255) tGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGc > 1:10685702/1‑67 (MQ=255) taTTACCGGCTTACTCTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTcc < 1:7886308/67‑1 (MQ=255) aTTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCg > 1:21165400/1‑68 (MQ=255) aTTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCg > 1:30987363/1‑68 (MQ=255) tACCGGCTTACTGTGGATTCCCGTGGTGTTGCTTTAAGGGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGc < 1:24997102/68‑1 (MQ=255) tACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGc < 1:15919969/68‑1 (MQ=255) tACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGc < 1:31653959/68‑1 (MQ=255) aCCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGc > 1:37089207/1‑67 (MQ=255) aCCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGc > 1:22745096/1‑67 (MQ=255) ccGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCAc < 1:978360/68‑1 (MQ=255) gcgcgggccgcgggcggagtgcccggctgcgtaaaactattgGGGGCCGGAAATTGCTCTCCGGCAcc > 1:22315756‑M1/43‑68 (MQ=255) cGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCAcc < 1:3994137/68‑1 (MQ=255) cGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCAcc < 1:27345188/68‑1 (MQ=255) cGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCAcc < 1:12924255/68‑1 (MQ=255) ggCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCAccc > 1:14478122/1‑68 (MQ=255) gCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCa > 1:3772241/1‑68 (MQ=255) cTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCaa > 1:18329893/1‑68 (MQ=255) cTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCaa > 1:13981191/1‑68 (MQ=255) cTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCa < 1:30135630/67‑1 (MQ=255) cTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCa < 1:6525871/67‑1 (MQ=255) cTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCa < 1:33007196/67‑1 (MQ=255) ttACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAAt > 1:19126405/1‑68 (MQ=255) ttACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAAt < 1:24693133/68‑1 (MQ=255) tACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATa > 1:24294601/1‑68 (MQ=255) aCTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAg > 1:14962888/1‑68 (MQ=255) cTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGt < 1:6779743/68‑1 (MQ=255) cTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGt < 1:1046891/68‑1 (MQ=255) cTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGt < 1:13264397/68‑1 (MQ=255) tgtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGtt > 1:940012/1‑68 (MQ=255) tgtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGtt > 1:22026169/1‑68 (MQ=255) gtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGttt > 1:2798706/1‑68 (MQ=255) gtgGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGttt > 1:1663129/1‑68 (MQ=255) ggATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGtttt > 1:17779489/1‑67 (MQ=255) ggATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGtttt > 1:21609623/1‑67 (MQ=255) aTGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTAc > 1:10035374/1‑67 (MQ=255) aTGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTAc > 1:4331158/1‑67 (MQ=255) tGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGc > 1:23786183/1‑68 (MQ=255) tGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGc > 1:8943687/1‑68 (MQ=255) tGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGc > 1:10992231/1‑68 (MQ=255) gCCCGTTGTGTTGCTTTAAGTGAGGACTGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCa < 1:36707556/68‑1 (MQ=255) cccGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCa > 1:5139561/1‑67 (MQ=255) cccGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCa > 1:28653949/1‑67 (MQ=255) cccGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTACGGCACCCAATAGTTTTACGCa > 1:30618229/1‑67 (MQ=255) ccGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGc < 1:39081340/68‑1 (MQ=255) ccGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGc < 1:18611171/68‑1 (MQ=255) gtggtgTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCg < 1:18058058/68‑1 (MQ=255) gtggtgTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCg < 1:3038022/68‑1 (MQ=255) gtggtgTTGCTTTAAGTGAGGACGGGGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCg < 1:7576857/68‑1 (MQ=255) ggtgTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGt > 1:2021922/1‑68 (MQ=255) gtgtTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTa > 1:28298145/1‑68 (MQ=255) tgtTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTa > 1:8285606/1‑67 (MQ=255) tgtTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTa > 1:34829540/1‑67 (MQ=255) tgtTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTa > 1:35221284/1‑67 (MQ=255) tgtTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTa > 1:7074704/1‑67 (MQ=255) tgtTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTa > 1:37398556/1‑67 (MQ=255) cggctgcgtaaaactattgGGTGCCGGAAATTGGTCTGCGGCCCCCCATAGTTTTACGCCGCCGgtt < 1:15508101‑M1/48‑2 (MQ=255) gtTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTa > 1:39365027/1‑66 (MQ=255) gtTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTa > 1:11655329/1‑66 (MQ=255) tttAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCg > 1:20561315/1‑67 (MQ=255) tttAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCg > 1:29060831/1‑67 (MQ=255) tttAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCg < 1:5489854/67‑1 (MQ=255) tttAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCg > 1:23378287/1‑67 (MQ=255) tttAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCg > 1:32095827/1‑67 (MQ=255) 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cGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCgccagcggccagc < 1:26217295/67‑1 (MQ=255) | ATTCCTCGTATTGCTGGTGATTACCGGCTTACTGTGGATGCCCGTGGTGTTGCTTTAAGTGAGGACGGTGCCGGAAATTGCTCTCCGGCACCCAATAGTTTTACGCAGCCGGTAACTCCGCCAGCGGCCAGCGC > CP009273/3202789‑3202922 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |