| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 399208 = | 205 (0.490) | 10 (0.030) | 6/94 | NT | 5.7% | coding (50/1116 nt) | yaiC | diguanylate cyclase, cellulose regualtor |
| ? | CP009273 | 399297 = | 161 (0.460) | coding (139/1116 nt) | yaiC | diguanylate cyclase, cellulose regualtor | |||||
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
GACGCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGTGCG‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/399281‑399208‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ccccgtgcgGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCGGGCTGGT > CP009273/399297‑399363 GACGCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCC < 1:19255991/68‑1GACGCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCC < 1:30689675/68‑1GACGCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCC < 1:33984254/68‑1GACGCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCC > 1:28545551/1‑67GACGCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCC > 1:18666703/1‑67 CGCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCG > 1:24497010/1‑68 CGCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCG > 1:25468936/1‑68 CGCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCG > 1:26692344/1‑68 CGCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCG > 1:20632385/1‑68 CGCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCG > 1:19285017/1‑68 CGCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCG > 1:18583759/1‑68 CGCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCG > 1:16760395/1‑68 CGCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCC < 1:32883673/67‑1 GCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGCGGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGT > 1:2572785/1‑68 GCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGT > 1:24193590/1‑68 GCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGT > 1:29021500/1‑68 GCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGT > 1:14517287/1‑68 GCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGT > 1:31701689/1‑68 GCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGT > 1:1750822/1‑68 GCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGT > 1:11750331/1‑68 GCGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGT > 1:29065817/1‑68 CGACGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGTGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGT > 1:13394558/1‑67 CGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGTGCG > 1:8657347/1‑67 CGGGCGAAGCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGTGCG > 1:24983403/1‑67 GCGCAGCCCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGTGCGGTTGGCCTG > 1:22888659/1‑68 CCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGG < 1:15182901/66‑1 CCGGACCGCTGATGTTCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGG < 1:25492888/66‑1 GGACCGCTGATGTGCGTTTTGAGGAGTTAACGGAGGTTCCACCCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATG < 1:27740213/68‑1 CCGCTGATGTGCGTTTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTT < 1:1862803/67‑1 TGTTCGATTTGAGGAGTTAAAGGAGGTTCCTCCCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGA < 1:10944884/68‑1 CCCGTGCGGTTGGCCTGGTTGGCATGTTCTTACCGATTGTTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:23902293/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:9136801/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:27156957/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:10082003/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:9649289/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:8255866/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:29517159/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:744709/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:7193708/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:30547239/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:596396/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:31181541/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:4092009/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:4623452/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:544262/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:5470506/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:12770937/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:1764952/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:17859906/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:18877142/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:16310638/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:19612185/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:16456989/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:12271502/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:16922598/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:23416822/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:2277570/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTAAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:16184345/1‑68 CCCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGA > 1:21305816/1‑36 CCCGTGCGGCTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCG > 1:29043365/1‑68 CCGTGCGGTTGGCCTGGCTTGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCGG < 1:34359126/68‑1 CCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCGG > 1:6925073/1‑68 CCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCGG > 1:6180557/1‑68 CCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCGG > 1:15486649/1‑68 CCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCGG > 1:17783442/1‑68 CCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCGG < 1:29804087/68‑1 CCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCGG > 1:23199460/1‑68 CCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCGG > 1:34649292/1‑68 CCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCGG > 1:21669788/1‑68 CCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCGG > 1:22572450/1‑68 CCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCGG > 1:22360153/1‑68 CCGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCGG > 1:1152835/1‑68 CCGTGCGGTTGGCCGGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCGG > 1:25367409/1‑68 CGTGCGGTTGGCCTGGCTGGCATGTTCTTACCGATTGCTTCAACGCTGGTTTCACACCCGCCGCCGGG < 1:30725496/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |