New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 442683 | 374 (0.900) | 25 (0.070) | 12/90 | NT | 6.3% | coding (479/891 nt) | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase |
? | CP009273 | = 442722 | 441 (1.320) | coding (440/891 nt) | cyoE | protoheme IX farnesyltransferase |
Only 100 of 175 total aligned reads displayed.
TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/442606‑442683 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgctgcgccgcCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTATCT < CP009273/442722‑442657 TAAAGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC < 1:13416705/68‑1 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT < 1:14033192/68‑1 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:7344656/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:17631840/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:20892185/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:34005293/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:22270190/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:8823302/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:22624464/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:33391614/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:2501286/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:26050505/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:26661374/1‑65 AGCGGAAAATGGCGATGGCATACGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATC > 1:4825466/1‑65 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:10033421/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:20933033/1‑67 GCGGAAAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCT > 1:3106116/1‑67 AAATGGCGATGGCATAGGAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCC < 1:12413533/67‑1 GAGTGAGGCATCTGCCACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCT > 1:25506795/1‑64 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGTCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAG > 1:31827012/1‑68 ACAGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAG > 1:12951497/1‑68 AGGCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGCGCGGCTACTGTGCGGTAGCCGGTGAGT > 1:28200880/1‑67 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCG > 1:23074359/1‑68 GCTGAAGATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACAGTGCGGGAACCGGTGAGTTCG > 1:26340134/1‑68 GATAGCCAGCAGGTTCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCG > 1:10574724/1‑68 GATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCG > 1:11720909/1‑68 GATAGCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTACGATAGCG > 1:2940629/1‑68 GCCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGC > 1:31472835/1‑68 CCAGCAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCA > 1:18639431/1‑68 CAGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGC > 1:27834503/1‑66 CAGGATCGCTGCGCCGCCGGGGATCGGCTACTGTGCGGGAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGC > 1:10424994/1‑66 AGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCGACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTAGATATCGGCGCAGCGA > 1:14503597/1‑67 AGGATCGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCGACTGTGCGGTAAACGGTGAGTTAGATAGCGGCGCAGCGA > 1:19044478/1‑67 GGATCGCTGCGCCGCCGGTGATAGGCTAATGTGCGGTAACCGGTGAGTTAGATAGCGGCGCAGCCAT > 1:1439229/1‑67 CGCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCCGCGATCCT > 1:29911212/1‑66 tCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGC < 1:24895082/66‑1 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCT < 1:28154709/68‑1 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCT < 1:14870469/68‑1 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGC < 1:11564119/67‑1 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:3263908/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:28607477/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:11339761/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:14700361/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:33321201/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:24213647/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:23002029/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:33476709/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:6319653/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:16799673/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:17844539/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:13734530/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:3841712/1‑65 GCTGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCT > 1:18869215/1‑65 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG < 1:29287804/67‑1 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG < 1:15442212/67‑1 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:30543311/1‑67 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:2640073/1‑67 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:13254572/1‑67 TGCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGGGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTG > 1:21614502/1‑67 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTTACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:2182817/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:9396955/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:3552360/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:7321066/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:5361801/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:33005879/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:20612622/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:10184870/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:17813166/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:184609/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:19262848/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:27572195/68‑1 GCGCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTGCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGC < 1:7389522/68‑1 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:25256805/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:7908485/1‑68 GCCGCCGGTGATCGGCTACTGTGCGGTAACCGGTGAGTTCGATAGCGGCGCAGCGATCCTGCTGGCTA > 1:23144875/1‑68 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |