New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | = 521461 | NA (NA) | 4 (0.010) | 3/102 | NT | 100% | coding (2745/4281 nt) | rhsD | Rhs family putative polymorphic toxin |
? | CP009273 | = 521483 | 0 (0.000) | coding (2767/4281 nt) | rhsD | Rhs family putative polymorphic toxin |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
GGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACccggc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/521395‑521461 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCGC < CP009273/521483‑521413 GGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACC < 1:18321529/68‑1 GGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACC < 1:14462884/68‑1 GGGCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACC < 1:14832923/68‑1 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:16615816/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:2899173/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:1718802/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:8195491/1‑68 GCAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCAGTATGCCACGGACCCa > 1:18757508/1‑67 CAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGG > 1:31285606/1‑68 CAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:17724079/1‑67 CAGGCTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCG > 1:19635816/1‑67 CTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGC < 1:9819648/65‑1 CTGGAGAGTGTGCGCACCCTCGCACCAGACCTGGACATCCGCATCCCGTATGCCACGGACCCGGC < 1:28288883/65‑1 CCCGTATGCCACGGACCCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATTCGGGGTGGGGATGTCCAG > 1:6110045/1‑68 CCGTATGCCACGGACCCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTGCAGG > 1:9381693/1‑68 GCCACGGCCCCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGT > 1:22378829/1‑68 GCCACGGACCCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGT > 1:15915750/1‑68 gCCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGG < 1:4882292/66‑1 gCCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGG < 1:24598043/66‑1 CCCGGCAGCCGTTTGCCCGCCGGGGCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGG < 1:21577826/67‑1 cctGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:14155309/65‑1 CCGGCAGCCGTTTTCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:31468932/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGGCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGTTGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:6109465/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:25141136/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:34621860/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:22542662/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:22789475/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:23527986/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:7615781/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:24198623/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:13068975/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:32448936/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:8521085/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:2562567/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:25852619/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:26510835/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:9408574/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:28454754/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:2987676/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:30518734/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:4472332/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:1079269/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:32737043/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:20852575/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:4909936/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:161669/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:20275563/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:7752585/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:14358452/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:5035733/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:19386927/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:7916573/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:8164098/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:15369256/68‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGT > 1:15314979/1‑67 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGT > 1:6558262/1‑67 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGT < 1:34423161/67‑1 CCGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGT < 1:20521918/67‑1 CCGGCACGCGGGTGGCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGT < 1:27318330/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGC < 1:34756571/68‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGC < 1:34319364/68‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:5450197/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:34119079/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:21079467/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:6253456/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:30770163/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:24789431/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:21424600/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:19421092/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:17385428/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:16191379/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:16059182/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:13786649/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:1323086/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:11486290/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:10817171/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:10385905/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGGCTGGTGCGAGGGTGC < 1:20632743/68‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGGGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:10429426/67‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGGCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGC < 1:12909122/68‑1 CGGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGGCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:19093264/67‑1 CGGCAGCAGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTG < 1:23750341/67‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATGCGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:33576843/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGGGGGTGCG < 1:6621016/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:7877306/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:9841984/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:13550695/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:18026476/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:18134682/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:2009704/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:5940236/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:28120483/68‑1 GGCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCG < 1:31969793/68‑1 GCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCGC > 1:332666/1‑68 GCAGCCGGTTGCCCGCCGGGTCCGTGGCATACGGGATGCGGATGTCCAGGTCTGGTGCGAGGGTGCGC > 1:17343314/1‑68 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Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |