| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 691855 = | 313 (0.750) | 38 (0.100) +TAATG |
3/102 | NT | 10.9% | intergenic (+123/+31) | ubiF/glnX | 2‑octaprenyl‑3‑methyl‑6‑methoxy‑1,4‑benzoquinol oxygenase/tRNA‑Gln |
| ? | CP009273 | 691998 = | 369 (0.880) | noncoding (75/75 nt) | glnV | tRNA‑Gln | |||||
Only 100 of 140 total aligned reads displayed.
CGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTT‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/691913‑691855‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > CP009273/691998‑692063 ||||| CGAGGTTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTTAATGTGGC < 1:17703618/68‑1 TTCGAATCCTCGTACCCCAGCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGG < 1:4870749/67‑1 TCGAATCCTCGTACCCCACCCACATTAAAAAAGCTCGCTTCGGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGT < 1:15442416/68‑1 acCCACATTAAAAAAGCGCGCTGCGGCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTC < 1:14779374/66‑1 GCGAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGT > 1:24758597/1‑67 gtGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:6786042/66‑1 gtGCTTTATTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:16883317/66‑1 gatCTTTTTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCC < 1:3083381/65‑1 gatCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCC < 1:2544780/65‑1 GAGCTTTTTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGC < 1:13230153/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:28038352/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:2244993/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:25762605/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:17739807/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:3011530/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:33767089/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:7246740/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:20112588/68‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:894469/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:21158928/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:24893403/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGC < 1:13375308/67‑1 GAGCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCAGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGC < 1:26990489/67‑1 tGCTTTTATAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:2496341/66‑1 tGCTTTTATAAAGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCC < 1:11173089/66‑1 gGCTTTATTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCT < 1:16027831/67‑1 GCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCT < 1:887533/67‑1 GCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCACAATCCGGTGCCTT > 1:20846398/1‑68 GCTTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATGCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCT < 1:3828749/67‑1 TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTA > 1:23184836/1‑67 TTTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTA > 1:29668665/1‑67 TTTTTAATGTGTCTGGGGTACGAGGATTCGAAACTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACC < 1:34012738/68‑1 TTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACC < 1:5970422/68‑1 TTTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACC < 1:8756605/68‑1 TTTTAATGTGGCTGGTGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCG < 1:4788016/68‑1 TTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCG < 1:20995344/68‑1 TTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTGGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACC < 1:6935316/67‑1 TTTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCG < 1:24435456/68‑1 TTTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGC < 1:22710262/68‑1 TTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGC < 1:26276685/68‑1 TTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGC < 1:21528864/68‑1 TTTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGC < 1:7302948/68‑1 TTAATTTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAAACCGGTGCCTTACCGCT < 1:20584322/68‑1 TTAATGTTGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGATTTCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT < 1:5919295/68‑1 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTTCCTTACCGCT < 1:25630608/68‑1 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT < 1:20313041/68‑1 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCT > 1:14341108/1‑68 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCG > 1:1479454/1‑66 TTAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCACAAACCGGTGCCTTACCGCT < 1:3767511/68‑1 TAATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTT > 1:13357439/1‑68 AATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCATAATCCGGTGCCTTACCGCTTG < 1:6226161/68‑1 AATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTG > 1:16297222/1‑68 AATGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTG < 1:30676895/68‑1 AATCTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCATAAACCGGTGCCTTACCGCTTG < 1:14328872/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGATCATCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:19117437/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCATAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:31865529/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGTATCAAAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:19755464/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:4544145/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:9585151/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:4294472/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:9451753/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:4340083/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC < 1:9119598/68‑1 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:12094730/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:10219137/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:12538760/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:580963/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:877344/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:593793/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:7879111/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:11442930/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:6638261/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:6677837/1‑68 TGTGGCTGGGGTACGAGGATTCGAACCTCGGAATGCCGGAATCAGAATCCGGTGCCTTACCGCTTGGC > 1:25889896/1‑68 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |