| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3614762 = | NA (NA) | 3 (0.010) | 3/100 | NT | 100% | coding (2211/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | 3614767 = | 0 (0.000) | coding (2216/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 236 total aligned reads displayed.
GTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCcggtgc‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/3614828‑3614762‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑CGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGACG > CP009273/3614767‑3614837 GTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCC > 1:11778039/1‑68GTGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCC > 1:2576568/1‑68 TGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCG > 1:15204790/1‑68 TGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCC < 1:16145577/67‑1 TGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCC < 1:6616036/67‑1 TGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCC < 1:22762727/67‑1 TGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCC < 1:24008770/67‑1 TGATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCC < 1:12851652/67‑1 ATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCGACCCGGT > 1:25963158/1‑68 ATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGT > 1:7910059/1‑68 ATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGT > 1:12651324/1‑68 ATGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGT > 1:6252966/1‑68 TGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGT < 1:26195292/67‑1 TGCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGT < 1:11707118/67‑1 TGCACCGTCTGACGCTCAACGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGT < 1:22984709/67‑1 GCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCTGCCTTTCTCATCATACATGTAATGCACCGCCACCCGGTGC < 1:20625906/68‑1 GCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGC < 1:28114215/68‑1 GCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGC < 1:24732224/68‑1 GCACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGC < 1:5009567/68‑1 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1:32357146/1‑66 ACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGC > 1:20150761/1‑66 ACCGTCTGACGCTCACCGGTCAGCCGGCCTTTCTCATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGC > 1:10548641/1‑66 CATCATACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTG > 1:22312196/1‑68 TACCTGTAATGCACCGCCACCCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCG > 1:19908517/1‑67 AATGCACCGCCACCCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGG > 1:214474/1‑68 CGGTGCATTACAGGTATGTTGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCA < 1:23848825/67‑1 GGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGA < 1:12062333/68‑1 GGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGA < 1:28771616/68‑1 GGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGA < 1:9765103/68‑1 GGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGA < 1:20789778/68‑1 GGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCAGA < 1:27699792/68‑1 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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |