| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 3614762 = | NA (NA) | 3 (0.010) | 3/100 | NT | 100% | coding (2211/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor |
| ? | CP009273 | 3614767 = | 0 (0.000) | coding (2216/4236 nt) | rhsB | Rhs family putative polymorphic toxin, putative neighboring cell growth inhibitor | |||||
Only 100 of 270 total aligned reads displayed.
CGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCA > CP009273/3614700‑3614833 | gtgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccc > 1:11778039‑M2/68‑68 (MQ=255) tgctgcaccgtcagccgcgcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccc < 1:18325816‑M2/1‑1 (MQ=255) tgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccc < 1:25596583‑M2/1‑1 (MQ=255) tgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccc < 1:6616036‑M2/1‑1 (MQ=255) tgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccc < 1:16145577‑M2/1‑1 (MQ=255) tgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccc < 1:11159376‑M2/1‑1 (MQ=255) tgatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCg > 1:15204790‑M2/67‑68 (MQ=255) gatgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCgg < 1:1672633‑M2/3‑1 (MQ=255) atgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgcgaccCGGt > 1:25963158‑M2/65‑68 (MQ=255) atgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGt > 1:27694636‑M2/65‑68 (MQ=255) atgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGt > 1:7910059‑M2/65‑68 (MQ=255) tgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGt < 1:11707118‑M2/4‑1 (MQ=255) tgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGt < 1:31481410‑M2/4‑1 (MQ=255) tgcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTg < 1:18816513‑M2/5‑1 (MQ=255) agcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGt < 1:34410071‑M2/4‑1 (MQ=255) gcaccgtctgacgctcaccggtcagcctgcctttctcatcatacatgtaatgcaccgccaccCGGTGc < 1:20625906‑M2/6‑1 (MQ=255) gcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTg > 1:32898270‑M2/63‑67 (MQ=255) gcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTg > 1:18557613‑M2/63‑67 (MQ=255) gcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc < 1:13782442‑M2/6‑1 (MQ=255) gcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc < 1:5009567‑M2/6‑1 (MQ=255) gcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc < 1:31273162‑M2/6‑1 (MQ=255) gcaccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc < 1:18070696‑M2/6‑1 (MQ=255) caccgtctgacgctcacgggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:4741623‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgccccgcccccCGGTGc > 1:10353307‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:19812192‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:12476644‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:12034920‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:21002163‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:26814057‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:4184587‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:217015‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:28888162‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:19493992‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:7845602‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:31979851‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:32696459‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:16888936‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:12940985‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:2571191‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:15885098‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:15803315‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:13350996‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:14274996‑M2/62‑67 (MQ=255) caccgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:14131932‑M2/62‑67 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgcccccCGGTGc > 1:7425371‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:27145043‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:32357146‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:27304067‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:28245457‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:29104649‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:29369163‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:29451801‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:30542054‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:3007285‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:10548641‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:10856576‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:24186779‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:23924670‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:4659977‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:13078017‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:22840055‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:13409672‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:5998953‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:3604215‑M2/61‑66 (MQ=255) accgtctgacgctcaccggtcagccggcctttctcatcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGc > 1:20150761‑M2/61‑66 (MQ=255) tcgctgatatggctgatgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTa > 1:21161127‑M2/23‑68 (MQ=255) tatggctgctgtctgTCAGCCATATCAGCGAAGGGCACAGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATgag > 1:25157977‑M2/16‑68 (MQ=255) TCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGAcc > 1:14425020‑M2/1‑68 (MQ=255) CAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCg > 1:6964202‑M2/1‑68 (MQ=255) GCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGt > 1:33953368‑M2/1‑68 (MQ=255) GCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGt > 1:5408447‑M2/1‑68 (MQ=255) GCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGt > 1:8606236‑M2/1‑68 (MQ=255) GCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGt > 1:10063590‑M2/1‑68 (MQ=255) GCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGt > 1:3955022‑M2/1‑68 (MQ=255) GCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGt > 1:3498434‑M2/1‑68 (MQ=255) GCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGt > 1:9027210‑M2/1‑68 (MQ=255) GCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGt > 1:12571936‑M2/1‑68 (MQ=255) GCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGt > 1:28819304‑M2/1‑68 (MQ=255) GCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGt > 1:25012918‑M2/1‑68 (MQ=255) catcatacctgtaatgcaccgccaccCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTg > 1:22312196‑M2/27‑68 (MQ=255) CCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTg > 1:30216280‑M2/1‑68 (MQ=255) CCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTg > 1:19912585‑M2/1‑68 (MQ=255) CCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTg > 1:23695159‑M2/1‑68 (MQ=255) CCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTg > 1:30798341‑M2/1‑68 (MQ=255) CCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTg > 1:26613662‑M2/1‑68 (MQ=255) CATATCAGCGAAGGGCACCGTGTGGCGGTGCATTACAGTTATGATTAGAAAGGCCGGCTGACCgg < 1:33598403‑M2/65‑1 (MQ=255) CATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCgg < 1:17866022‑M2/65‑1 (MQ=255) CATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGt < 1:19340422‑M2/66‑1 (MQ=255) CATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGt < 1:5800795‑M2/66‑1 (MQ=255) CATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGa < 1:27903972‑M2/68‑1 (MQ=255) CATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGa < 1:12691842‑M2/68‑1 (MQ=255) CATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGa > 1:22220636‑M2/1‑68 (MQ=255) CATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGa > 1:25393952‑M2/1‑68 (MQ=255) CATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGa > 1:23147648‑M2/1‑68 (MQ=255) CATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGa > 1:23186084‑M2/1‑68 (MQ=255) CATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGa > 1:23347402‑M2/1‑68 (MQ=255) CATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGa > 1:4027128‑M2/1‑68 (MQ=255) CATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGATATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGa > 1:6230520‑M2/1‑68 (MQ=255) aatgcaccgccaccCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACgg > 1:214474‑M2/15‑68 (MQ=255) CGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCa < 1:24650696‑M2/67‑1 (MQ=255) | CGGTGGCAGTATGACGAACGTGGCTGGCTGACAGACATCAGCCATATCAGCGAAGGGCACCGGGTGGCGGTGCATTACAGGTATGATGAGAAAGGCCGGCTGACCGGTGAGCGTCAGACGGTGCATCACCCGCA > CP009273/3614700‑3614833 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |