| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | 1242300 = | 559 (1.340) | 1604 (4.060) | 80/106 | NT | 76.4% | coding (533/1698 nt) | treA | periplasmic trehalase |
| ? | CP009273 | = 1292972 | 460 (1.170) | coding (606/2676 nt) | adhE | fused acetaldehyde‑CoA dehydrogenase/iron‑dependent alcohol dehydrogenase/pyruvate‑formate lyase deactivase | |||||
Only 100 of 2725 total aligned reads displayed.
CAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGT > CP009273/1292905‑1293038 | ttCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcg < 1:23301593‑M2/67‑4 (MQ=255) tCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgac > 1:3302353‑M2/1‑63 (MQ=255) tCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgac > 1:29247774‑M2/1‑63 (MQ=255) tCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgac > 1:21922100‑M2/1‑63 (MQ=255) tCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgac > 1:25143208‑M2/1‑63 (MQ=255) tCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGc < 1:1881918/68‑1 (MQ=255) tCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGc < 1:20213971/68‑1 (MQ=255) tCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGc < 1:13180386/68‑1 (MQ=255) tCACCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgac > 1:23818159‑M2/1‑63 (MQ=255) cATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATTGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgact > 1:7914831‑M2/1‑62 (MQ=255) cATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgact > 1:13790923‑M2/1‑62 (MQ=255) cATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgact > 1:8215112‑M2/1‑62 (MQ=255) cATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgact > 1:10293577‑M2/1‑62 (MQ=255) tCGATAACAACTGGAGGGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCCGGTTTACCGGAGCTGTATgcgacttt > 1:18549384‑M2/1‑60 (MQ=255) cGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgacttta < 1:15055337‑M2/68‑10 (MQ=255) cGATAACAACTGGAGTGTTGACCGCGCCTACACCGATAGCAGGTTTACCGCAGCTGTATGCGGCTTTa > 1:27764197/1‑68 (MQ=255) gATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttat > 1:15310906‑M2/1‑58 (MQ=255) acaacTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatccca < 1:19161777‑M2/68‑15 (MQ=255) acTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAAc > 1:27169878/1‑62 (MQ=255) aGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgacc < 1:6471340‑M2/66‑21 (MQ=255) aGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgacc < 1:28046846‑M2/66‑21 (MQ=255) aGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgacc < 1:34566103‑M2/66‑21 (MQ=255) aGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgacc < 1:9424349‑M2/66‑21 (MQ=255) tgtTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctt < 1:16344123‑M2/68‑25 (MQ=255) tgtTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGacc > 1:26209151/1‑67 (MQ=255) ccGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTc > 1:32011753/1‑68 (MQ=255) gcgcCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaag > 1:24407291‑M2/1‑36 (MQ=255) gcCTACACCTATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagt > 1:23542936‑M2/1‑34 (MQ=255) 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cacCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaac < 1:18261690‑M2/68‑40 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagttaccgctatcggcaagtcctaaca < 1:14483218‑M2/68‑41 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaaca < 1:12035351‑M2/68‑41 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaaca < 1:6733430‑M2/68‑41 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaaca < 1:5355968‑M2/68‑41 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaaca < 1:24601263‑M2/68‑41 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaaca < 1:25432460‑M2/68‑41 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaaca < 1:12831005‑M2/68‑41 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaaca < 1:17038803‑M2/68‑41 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCa > 1:8597967/1‑68 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCa > 1:28366908/1‑68 (MQ=255) acCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCa > 1:30349162/1‑68 (MQ=255) ccGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAg < 1:33256095/68‑1 (MQ=255) cGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatg > 1:16072986‑M2/1‑26 (MQ=255) cGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAgg > 1:4202841/1‑68 (MQ=255) gATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatgg > 1:8857660‑M2/1‑25 (MQ=255) aTAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggt < 1:5746691‑M2/68‑45 (MQ=255) tAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtg > 1:17623957‑M2/1‑23 (MQ=255) tAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtg > 1:7353828‑M2/1‑23 (MQ=255) tAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtg > 1:3639047‑M2/1‑23 (MQ=255) tAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggt > 1:14773567‑M2/1‑23 (MQ=255) tAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTg > 1:21193917/1‑68 (MQ=255) aGCTGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtga > 1:19494630‑M2/1‑22 (MQ=255) tGGTTTACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtgaagt > 1:9653446‑M2/1‑19 (MQ=255) tGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATg < 1:20719223/67‑1 (MQ=255) tGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATg < 1:61627/67‑1 (MQ=255) tGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATg < 1:28701368/67‑1 (MQ=255) tGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATg < 1:26894130/67‑1 (MQ=255) tGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATg < 1:24148802/67‑1 (MQ=255) tttACCGGAGCTGTATgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtgaagtaa > 1:30017747‑M2/1‑16 (MQ=255) 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aTgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtgaagtaactgtcccagtaatat < 1:25719806‑M2/68‑67 (MQ=255) aTgcgactttatcccagtgaccgctttcggcaagtcctaacatggtgaagtaactgtcccagtaatat < 1:31003494‑M2/68‑67 (MQ=255) | CAGTTTCATCGATAACAACTGGAGTGTTGCCCGCGCCTACACCGATAGCTGGTTTACCGGAGCTGTATGCGGCTTTAACCATGCCCGGACCACCAGTCGCGAGGATCAGGTTGATGTCTGGGTGGTGCATCAGT > CP009273/1292905‑1293038 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |