New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 108768 = | 342 (0.770) | 18 (0.050) | 6/100 | NT | 5.6% | coding (319/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
? | CP009273 | 108799 = | 302 (0.760) | coding (288/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/108840‑108768 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > CP009273/108799‑108864 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:28788650/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:11650792/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:29935540/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC < 1:18227933/68‑1 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGC > 1:23013340/1‑68 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:15708376/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:29035203/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC < 1:35476642/67‑1 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:13346483/1‑67 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC < 1:12867689/67‑1 ACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCC > 1:24845068/1‑67 CCAGAGCCTTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:3626949/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:25783933/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:14607142/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC < 1:15705973/68‑1 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:19109798/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:22989916/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:21827778/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:6746152/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:12309964/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:25970781/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC < 1:30212284/68‑1 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC < 1:12155487/68‑1 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC > 1:18871290/1‑68 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC < 1:11951684/68‑1 CCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGAGGCGGGGAGCGTATTAATTTCAGCGCCGC > 1:17875345/1‑68 CGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTA < 1:17382403/66‑1 CGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTA < 1:16745065/66‑1 GTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACT < 1:29938251/68‑1 GAAGCATTAAATCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGA < 1:6745900/68‑1 atcCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:10785903/65‑1 acTCAGCAGCTCCACGCGGCGGGGAGCGTATTACTTTCCGCGCCGCATTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:5251580/66‑1 ATTCAGCAGTTAACCGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:27331269/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:1923145/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:3918077/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:12497260/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:9254674/68‑1 ATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:24738229/68‑1 ATTCAGCAGGTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCAGAATTAATGCT < 1:36204427/68‑1 ATTCAGCAGATAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCT < 1:24255682/68‑1 CAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCA < 1:4323650/68‑1 AGTTAAAAGCGGCGGGGCGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAAT < 1:24744589/66‑1 aAAACGCGGCGGGCAGCGTATAAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGC < 1:6134935/67‑1 aAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTTAATTAATGCTTCAATACGGC < 1:31185113/67‑1 TAAACGCGGCGGGGCGCGTATTAATTCCCGCGCCGCTTTAAACTGCTTAATTAATGCTTCAATACGGC < 1:16864716/68‑1 TAAACGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGC < 1:15927031/68‑1 CGCCGCTTTTAAGTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:6152699/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGGTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:31893346/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTTGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:36212511/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:7207643/1‑68 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:11318623/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:133434/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:36213591/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:7255673/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:5983731/1‑68 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:7388510/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:841391/1‑68 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:24781968/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:10947640/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:18484027/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:24543922/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:24363903/1‑68 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:18246489/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:18172137/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:33624828/68‑1 CGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG < 1:31946906/68‑1 gcgGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGT < 1:23511334/65‑1 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGT < 1:18915984/68‑1 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGT < 1:16506882/68‑1 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:3719379/1‑67 GCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:21844292/1‑67 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:7213844/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:27005622/1‑66 CCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGG > 1:15743840/1‑66 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:5616563/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:33131801/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:35738856/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:6500811/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:19288147/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:13523746/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:7434078/1‑68 GCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:7981534/1‑68 GCTTTTAACGGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > 1:13560237/1‑68 GTGGACCAGAGCCGTATTGAAGCATTAATTCAGCAGTTAAAAGCGGCGGGGAGCGTATTAATTTCCGCGCCGC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ < CP009273/108840‑108768 ‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTG > CP009273/108799‑108864 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |