New junction evidence | |||||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
* | ? | CP009273 | 108768 = | 342 (0.770) | 18 (0.050) | 6/100 | NT | 5.6% | coding (319/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
? | CP009273 | 108799 = | 302 (0.760) | coding (288/744 nt) | zapD | FtsZ stabilizer |
Only 100 of 459 total aligned reads displayed.
CAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTGGA > CP009273/108732‑108866 | aaTCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCt < 1:12978894/67‑1 (MQ=255) aaCGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTa > 1:11498594/1‑66 (MQ=255) gtattgaagcattaattcagcagttaaaagcggcggggagcgtattaatttccgcgccgcTTTTAAct < 1:29938251‑M2/8‑1 (MQ=255) aCGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAAct < 1:36286504/68‑1 (MQ=255) gATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAActgc < 1:19419030/68‑1 (MQ=255) gATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAActgc < 1:15171462/68‑1 (MQ=255) gATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAAct > 1:8312885/1‑66 (MQ=255) aTCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGATATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAAct > 1:36168676/1‑65 (MQ=255) aTCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAAct > 1:7501262/1‑65 (MQ=255) cTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGa < 1:7378135/68‑1 (MQ=255) ttCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGaa > 1:4675856/1‑68 (MQ=255) ttCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGaa > 1:3811478/1‑68 (MQ=255) ttCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGaa < 1:25452011/68‑1 (MQ=255) ttCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGaa < 1:24169321/68‑1 (MQ=255) agcattaattcagcagttaaatGCGGCGCGGAAAGTAATACGCTCCCCGCCGCGTGGAGCTGCtgagt < 1:5251580‑M1/46‑3 (MQ=255) agcattaattcagcagttaaaaGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAAt < 1:9254674‑M1/46‑1 (MQ=255) cACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAAtt < 1:8627972/68‑1 (MQ=255) aCGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTa < 1:29404864/68‑1 (MQ=255) aGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATg < 1:32165473/67‑1 (MQ=255) attcagcagttaaccgcggcggggagcgtattaatttccgcgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:27331269‑M2/22‑1 (MQ=255) attcagcagttaaaagcggcggggagcgtattaatttccgcgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:1923145‑M2/22‑1 (MQ=255) attcagcaggtaaaagcggcggggagcgtattaatttccgcgccgcTTTTAACTGCAGAATTAATGCt < 1:36204427‑M2/22‑1 (MQ=255) atccagcagttaaaagcggcggggagcgtattaatttccgcgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:10785903‑M2/22‑1 (MQ=255) tcagcagttaaaaGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGATTTAATGCTTc < 1:6745900‑M1/55‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:36249056/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:22162954/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:4928928/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:7155046/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:20777843/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:20365592/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:20093024/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:3247569/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:31248771/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:1843053/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCt < 1:10281857/66‑1 (MQ=255) aaTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTc > 1:16366255/1‑68 (MQ=255) cagcagttaaaagcggcggggagcgtattaatttccgcgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCa < 1:4323650‑M2/25‑1 (MQ=255) aTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCa > 1:24913437/1‑68 (MQ=255) aTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCa > 1:23071139/1‑68 (MQ=255) aTTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCa < 1:34033127/68‑1 (MQ=255) tGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAGTTAATGCTTCAAt < 1:27738028/68‑1 (MQ=255) tGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAAt < 1:30482676/68‑1 (MQ=255) tGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAAt < 1:14599725/68‑1 (MQ=255) cccGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATAc > 1:21068633/1‑68 (MQ=255) cccGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATAc > 1:17455559/1‑68 (MQ=255) cccGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATAc > 1:27013877/1‑68 (MQ=255) cccGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGATTCAATAc > 1:26644350/1‑68 (MQ=255) cGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAACTAATGCTTCAATACg > 1:18759289/1‑67 (MQ=255) taaacgcggcggggcgcgtattaattcccgcgccgcTTTAAACTGCTTAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:16864716‑M2/32‑1 (MQ=255) taaacgcggcggggagcgtattaatttccgcgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:15927031‑M2/32‑1 (MQ=255) taaaaGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACg < 1:16745065‑M1/61‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:4053760/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:32642402/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:28480910/68‑1 (MQ=255) gATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGACGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGc < 1:24585215/68‑1 (MQ=255) GCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTgg < 1:11951684‑M1/68‑1 (MQ=255) GCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTgg > 1:25970781‑M1/1‑68 (MQ=255) GCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTgg > 1:25783933‑M1/1‑68 (MQ=255) GCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTgg > 1:19109798‑M1/1‑68 (MQ=255) GGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGt < 1:35476642‑M1/67‑1 (MQ=255) aaTTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAg > 1:17098771/1‑68 (MQ=255) aaTTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAg < 1:12367767/68‑1 (MQ=255) aaTTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAg > 1:13778486/1‑68 (MQ=255) aaTTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAg < 1:32012315/68‑1 (MQ=255) aaTACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCAc < 1:1822755/68‑1 (MQ=255) aTACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCAc > 1:28189599/1‑67 (MQ=255) aTACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCAc > 1:11316187/1‑67 (MQ=255) aTACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACg < 1:33032975/68‑1 (MQ=255) aTACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACg < 1:1005539/68‑1 (MQ=255) aTACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACg < 1:27232999/68‑1 (MQ=255) aCGCTCGCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGcc > 1:15513485/1‑68 (MQ=255) aCGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGcc > 1:12211933/1‑68 (MQ=255) aCGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGcc > 1:21907682/1‑68 (MQ=255) aCGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGcc > 1:1256566/1‑68 (MQ=255) aCGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGcc > 1:26375461/1‑68 (MQ=255) aCGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGcc > 1:33437255/1‑68 (MQ=255) aCGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGcc > 1:33653226/1‑68 (MQ=255) aCGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGcc > 1:29812749/1‑68 (MQ=255) cGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCa < 1:3459211/68‑1 (MQ=255) cGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCa > 1:24418420/1‑68 (MQ=255) gCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCaa > 1:23001737/1‑68 (MQ=255) gCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCaa > 1:21816121/1‑68 (MQ=255) gCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCaa < 1:28820191/68‑1 (MQ=255) tCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCGACGCCAGGCACGCCAAt < 1:34875074/67‑1 (MQ=255) tCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAAt < 1:1356190/67‑1 (MQ=255) tCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAAt < 1:31080703/67‑1 (MQ=255) tCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAAt > 1:17701831/1‑67 (MQ=255) tCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAAt > 1:1786972/1‑67 (MQ=255) tCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAAt > 1:22448440/1‑67 (MQ=255) cgccgcTTTTAAGTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAgg < 1:6152699‑M2/62‑1 (MQ=255) cgccgcTTTTAACTGGTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAgg < 1:31893346‑M2/62‑1 (MQ=255) cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAgg < 1:133434‑M2/62‑1 (MQ=255) cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAgg > 1:5983731‑M2/7‑68 (MQ=255) cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAgg < 1:10947640‑M2/62‑1 (MQ=255) cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAgg > 1:24363903‑M2/7‑68 (MQ=255) cgccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAgg < 1:24781968‑M2/62‑1 (MQ=255) ccgcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAgg > 1:15743840‑M2/5‑66 (MQ=255) gcTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTg > 1:5616563‑M2/3‑68 (MQ=255) ttttAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTGGa < 1:23891752/68‑1 (MQ=255) ttttAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTGGa < 1:21408083/68‑1 (MQ=255) | CAATCAAACGATCTTCACGCAGAAATTGCCCGATACGCGGCGCGGAAATTAATACGCTCCCCGCCGCTTTTAACTGCTGAATTAATGCTTCAATACGGCTCTGGTCCACGCCAGGCACGCCAATCCAGGTCTGGA > CP009273/108732‑108866 |
Alignment Legend |
---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
Reads not counted as support for junction |
read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |