| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 776085 | NA (NA) | 67 (0.160) +GTT |
4/106 | NT | 11.7% | noncoding (76/76 nt) | lysT | tRNA‑Lys |
| ? | CP009273 | = 776400 | 536 (1.200) | intergenic (+26/‑124) | lysW/valZ | tRNA‑Lys/tRNA‑Val | |||||
Only 100 of 193 total aligned reads displayed.
GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/776019‑776085‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAACATCTGTCTTCGATGTTAAAACTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGA < CP009273/776400‑776337 ||| GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG > 1:9855034/1‑68GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG > 1:22779225/1‑68GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG > 1:22760960/1‑68GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG > 1:36638348/1‑68GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG > 1:4020030/1‑68GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG > 1:5464942/1‑68GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG > 1:6597898/1‑68 TCAGTTGGTAGAGCTGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTACGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:25226981/67‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTTACTTTTACTCAATTGTTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:11428415/67‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGTTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:15199736/67‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCTAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:13448195/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTa > 1:6894350/1‑67 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:10045842/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:2256002/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:21876231/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT > 1:24077196/1‑68 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:24620373/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT > 1:26744058/1‑68 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:27022574/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:27335117/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT > 1:27664343/1‑68 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT > 1:2897827/1‑68 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT > 1:31745583/1‑68 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:32250041/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:32933544/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:34014347/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:34558271/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT > 1:367471/1‑68 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:5067182/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:14486601/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:15629302/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:15543817/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:14759542/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:18247126/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT > 1:12422486/1‑68 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT > 1:12339587/1‑68 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:11979956/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:10899193/68‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:13311303/67‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:3037481/67‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:29576436/67‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:29553745/67‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:28384962/67‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:10035987/67‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:36362013/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:35382951/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:33663263/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:30486225/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:31258008/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:2089696/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:19151974/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAG < 1:17355933/66‑1 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGATCGAATACTGCACGACCCACCAGgt > 1:28148831/1‑66 TCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGGCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:16044913/67‑1 TCAGTTGGTA‑TGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:19733364/67‑1 TTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAA > 1:8843925/1‑68 TTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTA > 1:9528087/1‑67 TGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC < 1:20129301/68‑1 TGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC > 1:11836802/1‑68 TGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC > 1:21021070/1‑68 TGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAC > 1:15768982/1‑68 TGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAA > 1:35614319/1‑67 GGTAGAGCATTGGACTTTTAATCATTTGTTCGAAGGTTGGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA < 1:20751203/68‑1 GGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA < 1:7699525/68‑1 GGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA < 1:3139856/68‑1 GGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:34461981/62‑1 GGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTATTAA > 1:16824983/1‑66 TAGAGCAGTTGTCTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:21509312/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAgg > 1:26544016/1‑66 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:13063936/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:19480042/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:4440342/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:21219395/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:24993653/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:32961494/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:10989938/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:8210374/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:16271722/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:8619308/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATC > 1:1660087/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:33318545/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:14080742/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:30974806/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:10619276/67‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA > 1:18990630/1‑66 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA > 1:17398701/1‑66 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAAATC > 1:36591491/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTT < 1:4469260/60‑1 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTATTAAAATC > 1:23070153/1‑68 TAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAAACCTGCACGACCCACCAGTTTTAACAT < 1:26107940/67‑1 GAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCATTTTTAACATggt > 1:7237117/1‑65 GAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCTa > 1:14019818/1‑67 GCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACATCTaag > 1:29799320/1‑65 GCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAAAATCcg > 1:25742281/1‑64 TGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTTAACA > 1:33584866/1‑57 TTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGT < 1:4113405/46‑1 ATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCAGTTTT > 1:34454296/1‑44 ACGACCCACCAGTTTTTACATCTGTCGTCGATGTTAAAACTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGC > 1:1894316/1‑68 AGTTTTAACATCTGTCTTCGATGTTAAAACTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGA > 1:17445664/1‑68 AGTTTTAACATCTGTCTTCGATGTTAAAACTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGA > 1:28865815/1‑68 ||| GCTCAGTTGGTAGAGCAGTTGACTTTTAATCAATTGGTCGCAGGTTCGAATCCTGCACGACCCACCA‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/776019‑776085‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑TTAACATCTGTCTTCGATGTTAAAACTGGTGGGTCGTGCAGGATTCGAACCTGCGACCAATTGA < CP009273/776400‑776337 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |