| New junction evidence | |||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| seq id | position | reads (cov) | reads (cov) | score | skew | freq | annotation | gene | product | ||
| * | ? | CP009273 | = 2161385 | 371 (0.830) | 21 (0.060) | 8/90 | NT | 6.7% | intergenic (‑90/+85) | yegZ/yegR | pseudogene, gpD phage P2‑like protein D/uncharacterized protein |
| ? | CP009273 | = 2161396 | 287 (0.800) | intergenic (‑101/+74) | yegZ/yegR | pseudogene, gpD phage P2‑like protein D/uncharacterized protein | |||||
Only 100 of 169 total aligned reads displayed.
TTTTATGCATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2161308‑2161385‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agcacgatgccGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTACCA < CP009273/2161396‑2161330 TTTTATGCATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATA > 1:23454889/1‑68 TTTATGCATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAG < 1:28509370/68‑1 TATGCATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCA < 1:1959212/68‑1 TATGCATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGC > 1:7785062/1‑67 TATGCATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGC > 1:16455128/1‑67 GCATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGA > 1:36196746/1‑68 GCATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGA > 1:27600756/1‑68 CATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGAT > 1:18848669/1‑68 ATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGAT > 1:2475527/1‑67 ATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGAT < 1:10224110/67‑1 TAATCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:1819184/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:596042/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:18284140/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:1809313/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:24696717/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:24705559/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:1745385/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:11477098/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:9144471/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:23593857/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:34400606/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:25346159/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:25964715/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:35211984/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:2014206/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:34941662/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:22419596/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:22850854/68‑1 TAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGC < 1:5336992/68‑1 AAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCC < 1:17225768/68‑1 AGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGA > 1:21163495/1‑68 ATCCTCCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGT > 1:19594676/1‑68 CCTCCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGG > 1:16373787/1‑68 CCTCCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGG > 1:1873887/1‑68 CCTCCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGG > 1:15345246/1‑68 CCTCCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGG > 1:29572336/1‑68 CCTTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCA > 1:36566221/1‑68 TTCATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAAT > 1:5739158/1‑68 ATAGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGA > 1:28209132/1‑68 AGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAG > 1:6065965/1‑68 AGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAG > 1:3021047/1‑68 AGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAG > 1:13800562/1‑68 AGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAA < 1:21168/67‑1 AGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAA > 1:12068832/1‑67 AGCACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGGGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAG > 1:23773894/1‑68 CACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGAC > 1:24822922/1‑68 CACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGAC > 1:29415517/1‑68 CACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGAC > 1:396101/1‑68 CACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTATATCGATGTGGTCAATGGAAGAC > 1:25435627/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:30135042/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:14459842/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:14310707/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:8936718/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:30677385/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:15390824/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:26744697/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:34514488/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:15799055/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:24962819/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:17777390/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:10921176/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:179364/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:18617538/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:1919834/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGAC < 1:7917401/67‑1 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGAC < 1:13483617/67‑1 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGAC < 1:24634466/67‑1 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGAC < 1:14441981/67‑1 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTAAATGGAAGACG > 1:51454/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTATATCGATGTGCTCAATGGAAGACG > 1:477767/1‑68 ACGATGCCGATAAGTGAAAGGCATAGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACG > 1:14707729/1‑68 cgtTGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGG < 1:28777759/65‑1 CGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGG < 1:2297567/68‑1 CGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGG < 1:5412218/68‑1 CGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGG < 1:13192390/68‑1 CGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGG < 1:15422397/68‑1 CGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGG < 1:12524956/68‑1 CGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGG < 1:16316183/68‑1 CGATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGG < 1:16628343/68‑1 GATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGT < 1:12889629/68‑1 GATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGT < 1:7143836/68‑1 GATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGT < 1:10543690/68‑1 ATGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTT > 1:24109249/1‑68 TGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTA < 1:35296075/68‑1 TGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTA < 1:2579486/68‑1 TGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTT < 1:26883491/67‑1 TGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTT < 1:8677745/67‑1 TGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTT < 1:17866293/67‑1 TGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTT < 1:17319832/67‑1 TGCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATGCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTT < 1:14564115/67‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:21659233/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:9803162/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:11859208/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:8129137/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:16055932/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:379812/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:3571897/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTAC < 1:36825048/68‑1 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTA > 1:2522271/1‑67 GCCGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTA > 1:32238564/1‑67 TTTTATGCATAAGCCCTATCTCTGGTAACCGTCTTCCATTGACCACATCGATAGAATCCTCCTTCATAGCACGATGCC‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑ > CP009273/2161308‑2161385‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑‑agcacgatgccGATAAGTGAAAGGCATCGTGCTATGAAGGAGGATTCTATCGATGTGGTCAATGGAAGACGGTTACCA < CP009273/2161396‑2161330 |
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 14 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 36 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
| Reads not counted as support for junction |
| read_name Not counted due to insufficient overlap past the breakpoint. |
| read_name Not counted due to not crossing MOB target site duplication. |